T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=83
*
 BAD AVG GOOD
*
C.merolae    :  85
A.aegypti    :  81
D.rerio      :  83
H.sapiens    :  87
M.musculus   :  87
S.mansoni    :  77
cons         :  83

C.merolae    -----VSLYVGDLQPDVVEQNLFELFSSVGP-VVSVRVCRDVVTRRSL
A.aegypti    MSSIQCQLWMGSLESYMTENFILAAFRKMGEDPQTVKLMRNKYTGDPA
D.rerio      MFNRMTSLWMGDLDPYMDENFIKQAFSTMGETAFGVKIITHRVTGGSA
H.sapiens    M---AASLWMGDLEPYMDENFISRAFATMGETVMSVKIIRNRLTGIPA
M.musculus   M---AASLWMGDLEPYMDENFISRAFATMGETVMSVKIIRNRLTGIPA
S.mansoni    MQNFSHTIWMGDLEPYMDEMFIKRAFETSGENIVSVKVIRNKATGQTL

cons                :::*.*:. : *  :   * . *     *::  .  *  . 


C.merolae    GYAYVNFQNPEDAERAIDVLQFYEGPLT-KNKPIRIMWKRSDPSQ--R
A.aegypti    GYCFVSFKTDEAAIDAMHKLNGKPIPGTNPLVRFRLNSATNNQNKALL
D.rerio      GYCFVEMADEASVDRCVQRLNGKLVPGSNPPRKFKLNYATYGKRP--E
H.sapiens    GYCFVEFADLATAEKCLHKINGKPLPGATPAKRFKLNYATYGKQP--D
M.musculus   GYCFVEFADLATAEKCLHKINGKPLPGATPAKRFKLNYATYGKQP--D
S.mansoni    GYGFIEFANSTSARDAMLKLNGKLIPGA-PTRRFKLNHASYGKDS--T

cons         ** ::.:     .  .:  ::    * :     :::     .      


C.merolae    RNPEGNIFIKNLDKSIDNKALYDTFS-TFGTITSLRIMRDEKGVSKGF
A.aegypti    ADREFSVWVGDLSSDVDDYSLYRVFSAKYTSIKTAKVILDSSGFSKGY
D.rerio      PGPEFSVFVGDLTSEVDDYQLHQFFLKKFPSCKGAKVVTDPYGNSRGY
H.sapiens    NSPEYSLFVGDLTPDVDDGMLYEFFVKVYPSCRGGKVVLDQTGVSKGY
M.musculus   NSPEYSLFVGDLTPDVDDGMLYEFFVKVYPSCRGGKVVLDPTGVSKGY
S.mansoni    SSNECSLFVGELTEDVDDLALFNAFK-KYPTCRSAKVVMT-NGKSRGY

cons          . * .::: :*  .:*:  *.  *   : :    :::    * *:*:


C.merolae    GFVAFSHPDEAIKAVTEMNQRI-VGQKPIYVALAQRKDQRRA------
A.aegypti    GFVKFGLEDEQKSALYEMNGFIGLGCKPLKICNAVPKPKNELGPAGPT
D.rerio      GFVKFSDENEQKKALEEFQNASGLGGKPIRISIAVNKGNKAS-T----
H.sapiens    GFVKFTDELEQKRALTECQGAVGLGSKPVRLSVAIPKASRVK-P----
M.musculus   GFVKFTDELEQKRALTECQGAVGLGCKPVRLSVAIPKASRVK-P----
S.mansoni    GFVRFLTESDMDKALIEMQNYCGLGYKPIRVSLAIPKRYNADGSLVVT

cons         *** *    :   *: * :    :* **: :. *  *  .        


C.merolae    ------------------------------------------------
A.aegypti    SSTPSAASL-------------LG-YGT--ATDYS-QYYDPSTYWQNY
D.rerio      ----------------------YHNQNNTYNTNYQQQYYQQ-PY-NSY
H.sapiens    ----------------------VE-YSQMYSYSYN-QYYQQ--Y-QNY
M.musculus   ----------------------VE-YSQMYSYSYN-QYYQQ--Y-QNY
S.mansoni    TT-ASETSSVVPSGMPDPFTAAVAAAVTGNSAAQA-EYYQA--Y-QQY

cons                                                         


C.merolae    ------------------------------------------------
A.aegypti    SAWQGYYDATGTADYSAYQM--PA-A----------------------
D.rerio      YPQWGYDQYSG-YNYGYNPY--AA-----PPPMMGPPPPM---GMPPM
H.sapiens    YAQWGYDQNTGSYSYSYPQY--GY-----TQ-----------------
M.musculus   YAQWGYDQNTGSYSYSYPQY--GY-----TQ-----------------
S.mansoni    YQQYYASQYAA-QFYSSESSTNGDSANSGITSIAGGGTLVGDATVQQH

cons                                                         


C.merolae    ------------------------------------------------
A.aegypti    AAVDASAYHAYEQQQQHHHAHSQVEDEELTLVDHKYTLDVEKLNR-EV
D.rerio      P-P---D---MQGSTEAHDGTEEVEEDP--SEDPNPQVDVEELNR-QY
H.sapiens    ---------------STMQTYEEVGDDA--LEDPMPQLDVTEANK-EF
M.musculus   ---------------STMQTYEEVGDDA--LEDPAPQLDVTEANK-EF
S.mansoni    AFVDAAASHLYARALQQGTGS------Q--EYAPEPHVLSSACDRPRH

cons                                                         


C.merolae    ----------------------------Q--IE
A.aegypti    MERDRNLYDALESSKWMPVEQ-LE-------IF
D.rerio      MERSEELYDSLMECHWLPMDT-ITSDISMMNGS
H.sapiens    MEQSEELYDALMDCHWQPLDT-VSSEIPA--MM
M.musculus   MEQSEELYDALMDCHWQPLDT-VSSEIPA--MM
S.mansoni    VDDLDEVFNFLESSRWHVTDPSLGLFIKI--RP

cons