T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame
CPU TIME:0 sec.
SCORE=80
*
BAD AVG GOOD
*
H.arabidopsidis : 76
A.aegypti : 77
D.rerio : 81
H.sapiens : 85
M.musculus : 85
S.mansoni : 74
cons : 80
H.arabidopsidis ------TLWMGDIQMHWDEAFIASLFASAAEQPV-IKLIRDKVTG
A.aegypti MSSIQCQLWMGSLESYMTENFILAAFRKMGEDPQTVKLMRNKYTG
D.rerio MFNRMTSLWMGDLDPYMDENFIKQAFSTMGETAFGVKIITHRVTG
H.sapiens M---AASLWMGDLEPYMDENFISRAFATMGETVMSVKIIRNRLTG
M.musculus M---AASLWMGDLEPYMDENFISRAFATMGETVMSVKIIRNRLTG
S.mansoni MQNFSHTIWMGDLEPYMDEMFIKRAFETSGENIVSVKVIRNKATG
cons :***.:: : * ** * . .* :*:: .: **
H.arabidopsidis YPAGYGFLEFPTQRGAQQVLEMFNGLMWCIENTVHRFRMNWGAGG
A.aegypti DPAGYCFVSFKTDEAAIDAMHKLNGKPIPGTNPLVRFRLNSATNN
D.rerio GSAGYCFVEMADEASVDRCVQRLNGKLVPGSNPPRKFKLNYATYG
H.sapiens IPAGYCFVEFADLATAEKCLHKINGKPLPGATPAKRFKLNYATYG
M.musculus IPAGYCFVEFADLATAEKCLHKINGKPLPGATPAKRFKLNYATYG
S.mansoni QTLGYGFIEFANSTSARDAMLKLNGKLIPGA-PTRRFKLNHASYG
cons . ** *:.: . : :** . :*::* .: .
H.arabidopsidis RR--IETSDDHSIFVGDLAPDVGDEVLLSTFNARFTSVRGAKVVM
A.aegypti QNKALLADREFSVWVGDLSSDVDDYSLYRVFSAKYTSIKTAKVIL
D.rerio KR--PEPGPEFSVFVGDLTSEVDDYQLHQFFLKKFPSCKGAKVVT
H.sapiens KQ--PDNSPEYSLFVGDLTPDVDDGMLYEFFVKVYPSCRGGKVVL
M.musculus KQ--PDNSPEYSLFVGDLTPDVDDGMLYEFFVKVYPSCRGGKVVL
S.mansoni KD--STSSNECSLFVGELTEDVDDLALFNAF-KKYPTCRSAKVVM
cons : . : *::**:*: :*.* * * :.: : .**:
H.arabidopsidis DPVTRMSKGFGFVRFGSKEEADQALQTMNG-VFCSSRPMRVSVAT
A.aegypti DS-SGFSKGYGFVKFGLEDEQKSALYEMNGFIGLGCKPLKICNAV
D.rerio DP-YGNSRGYGFVKFSDENEQKKALEEFQNASGLGGKPIRISIAV
H.sapiens DQ-TGVSKGYGFVKFTDELEQKRALTECQGAVGLGSKPVRLSVAI
M.musculus DP-TGVSKGYGFVKFTDELEQKRALTECQGAVGLGCKPVRLSVAI
S.mansoni T--NGKSRGYGFVRFLTESDMDKALIEMQNYCGLGYKPIRVSLAI
cons *:*:***:* : : . ** :. . :*:::. *
H.arabidopsidis ERTARTT-P-------------------------TH--T--NYYA
A.aegypti PKPKNELGPAGPT----SSTP-------------SAASLLGYGTA
D.rerio NKGNKAS-T-------------------------YHNQN--NTYN
H.sapiens PKASRVK-P-------------------------VE-YS--QMYS
M.musculus PKASRVK-P-------------------------VE-YS--QMYS
S.mansoni PKRYNADGSLVVTTTASETSSVVPSGMPDPFTAAVAAAV--TGNS
cons : . .
H.arabidopsidis QQYG-QYQT--G-YQTVLPMLGQNFYGYNAAYSYP----------
A.aegypti TDYS-QYYDPSTYWQNYSAWQGYYDATGTADYSAYQMPAAAAVDA
D.rerio TNYQQQYYQ-QP-YNSYYPQWGYDQYSG-YNYGYN----------
H.sapiens YSYN-QYYQ--Q-YQNYYAQWGYDQNTGSYSYSYP----------
M.musculus YSYN-QYYQ--Q-YQNYYAQWGYDQNTGSYSYSYP----------
S.mansoni AAQA-EYYQ--A-YQQYYQQYYASQYAA-QFYSS-----------
cons :* :: *.
H.arabidopsidis ----QYQQGA-----------------------AGYG-----YGA
A.aegypti SAYHAYEQQQ----------------------QHHHA-----HSQ
D.rerio ----PYAAPPPMMGPPPPMGMPPMPPDMQGSTEAHDG-----TEE
H.sapiens ----QYGYTQ----------------------STMQT-----YEE
M.musculus ----QYGYTQ----------------------STMQT-----YEE
S.mansoni --------ESSTNGDS----------ANSGITSIAGGGTLVGDAT
cons
H.arabidopsidis YGQYALQ---------------------GAQPQVDYQQQQL-QQQ
A.aegypti VEDEEL-------------------TLVDHKYTLDVEKLNR-EVM
D.rerio VEEDPSE---------------------DPNPQVDVEELNR-QYM
H.sapiens VGDDALE---------------------DPMPQLDVTEANK-EFM
M.musculus VGDDALE---------------------DPAPQLDVTEANK-EFM
S.mansoni VQQHAFVDAAASHLYARALQQGTGSQEYAPEPHVLSSACDRPRHV
cons : : : .
H.arabidopsidis PQQKR-IAAVRPPHTPLLEI-VKSYCPR--PM
A.aegypti ERDRNLYDALESSKWMPVEQ-LE-------IF
D.rerio ERSEELYDSLMECHWLPMDT-ITSDISMMNGS
H.sapiens EQSEELYDALMDCHWQPLDT-VSSEIPA--MM
M.musculus EQSEELYDALMDCHWQPLDT-VSSEIPA--MM
S.mansoni DDLDEVFNFLESSRWHVTDPSLGLFIKI--RP
cons . : : : :