T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=87
*
 BAD AVG GOOD
*
C.parvum     :  88
D.rerio      :  87
H.sapiens    :  90
M.musculus   :  90
S.mansoni    :  81
cons         :  87

C.parvum     V---SASLYVGDLDADVTETMLYEIFNSVA-VVSSVRICRDALTRRSL
D.rerio      MFNRMTSLWMGDLDPYMDENFIKQAFSTMGETAFGVKIITHRVTGGSA
H.sapiens    M---AASLWMGDLEPYMDENFISRAFATMGETVMSVKIIRNRLTGIPA
M.musculus   M---AASLWMGDLEPYMDENFISRAFATMGETVMSVKIIRNRLTGIPA
S.mansoni    MQNFSHTIWMGDLEPYMDEMFIKRAFETSGENIVSVKVIRNKATGQTL

cons         :     ::::***:. : * :: . * : .    .*::  .  *  . 


C.parvum     GYAYVNYNSVADAERALDTLNFTCIRGR-PCRIM---WCLRDPASRRN
D.rerio      GYCFVEMADEASVDRCVQRLNGKLVPGSNPPRKFKLNYATYGKRPEPG
H.sapiens    GYCFVEFADLATAEKCLHKINGKPLPGATPAKRFKLNYATYGKQPDNS
M.musculus   GYCFVEFADLATAEKCLHKINGKPLPGATPAKRFKLNYATYGKQPDNS
S.mansoni    GYGFIEFANSTSARDAMLKLNGKLIPGA-PTRRFKLNHASYGKDSTSS

cons         ** :::  . : .  .:  :* . : *  * : :    .  .  .  .


C.parvum     NDGNVFVKNLDKSIDNKTLFDTF-SLFGNIMSCKIATDVEGKSLGYGF
D.rerio      PEFSVFVGDLTSEVDDYQLHQFFLKKFPSCKGAKVVTDPYGNSRGYGF
H.sapiens    PEYSLFVGDLTPDVDDGMLYEFFVKVYPSCRGGKVVLDQTGVSKGYGF
M.musculus   PEYSLFVGDLTPDVDDGMLYEFFVKVYPSCRGGKVVLDPTGVSKGYGF
S.mansoni    NECSLFVGELTEDVDDLALFNAF-KKYPTCRSAKVVM-TNGKSRGYGF

cons          : .:** :*  .:*:  *.: * . : .  . *:.    * * ****


C.parvum     IHFEHADSAKEAISRLNGAV-LGDRPIY--------------------
D.rerio      VKFSDENEQKKALEEFQNASGLGGKPIRISIAVNKGNKASTYHNQN--
H.sapiens    VKFTDELEQKRALTECQGAVGLGSKPVRLSVAIPKASRVKPVE-YS--
M.musculus   VKFTDELEQKRALTECQGAVGLGCKPVRLSVAIPKASRVKPVE-YS--
S.mansoni    VRFLTESDMDKALIEMQNYCGLGYKPIRVSLAIPKRYNADGSLVVTTT

cons         ::*    . ..*: . :.   ** :*:                     


C.parvum     ------------------------------------------------
D.rerio      -----------------------NT-YNTNYQQQYYQQPYNSYYPQWG
H.sapiens    -----------------------QM-YSYSY-NQYYQQ-YQNYYAQWG
M.musculus   -----------------------QM-YSYSY-NQYYQQ-YQNYYAQWG
S.mansoni    ASETSSVVPSGMPDPFTAAVAAAVTGNSAA-QAEYYQA-YQQYYQQYY

cons                                                         


C.parvum     ------------------------------------------------
D.rerio      YDQYSG-YNYGYNPYAAPPPMMGPPPPMGMPPMPPDMQGSTEAHDGTE
H.sapiens    YDQNTGSYSYSYPQYGYTQST----------------------MQTYE
M.musculus   YDQNTGSYSYSYPQYGYTQST----------------------MQTYE
S.mansoni    ASQYAA-QFYSS-----ESSTNGDS----------ANSGITSIAGGGT

cons                                                         


C.parvum     ------------------------------------------------
D.rerio      EVEE--------------------------DPSEDPNPQVDVEELNR-
H.sapiens    EVGD--------------------------DALEDPMPQLDVTEANK-
M.musculus   EVGD--------------------------DALEDPAPQLDVTEANK-
S.mansoni    LVGDATVQQHAFVDAAASHLYARALQQGTGSQEYAPEPHVLSSACDRP

cons                                                         


C.parvum     ----------------------------------V
D.rerio      QYMERSEELYDSLMECHWLPMDT-ITSDISMMNGS
H.sapiens    EFMEQSEELYDALMDCHWQPLDT-VSSEIPAM--M
M.musculus   EFMEQSEELYDALMDCHWQPLDT-VSSEIPAM--M
S.mansoni    RHVDDLDEVFNFLESSRWHVTDPSLGLFIKIR--P

cons