T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=98
*
 BAD AVG GOOD
*
P.ultimum      :  99
M.musculus     :  97
X.tropicalis   :  97
cons           :  98

P.ultimum      MNAKNAQLAEAFVAPTYVEQGLAAIRNREQLFTALLSQRRVPDDGWDE
M.musculus     MNPESFAAGERRVSPAYVRQGCEARRAHEHLIRLLLEQGKCPEDGWDE
X.tropicalis   MEHESFKASERLVTPAYIRQGREARRMHEQLVRQLVEQGKCPKEPWDE

cons           *: :.   .*  *:*:*:.**  * * :*:*.  *:.* : *.: ***


P.ultimum      QTVELVLQSLAAMDSNNFRTNIGAGEREARVFSSLVAKRHFHLCHGVG
M.musculus     STLELFLHELAVMDSNNFLGNCGVGEREGRVASALVARRHYRFIHGIG
X.tropicalis   STIEIFLNELAVMDSNNFLGNCGVGEREGRVASGMVSRRHYRLIHGIG

cons           .*:*:.*:.**.******  * *.****.** *.:*::**::: **:*


P.ultimum      RSGDVAAVQPKAAGSSLIVQLTNALAKDLLREAGLRSITSALVLPVAT
M.musculus     RSGDISAVQPKAAGSSLLNKITNSLVLNVIKLAGVHSVASCFVVPMAT
X.tropicalis   RSGDISAIQPKAAGSSVLNKLTNSMVLDIIRLAGVRTASSCFVVPMAT

cons           ****::*:********:: ::**::. :::: **::: :*.:*:*:**


P.ultimum      GMSLTLVLLTLRAQKPDAKYVIWPRIDQKSCFKSILTAGLTPLVLENT
M.musculus     GMSLTLCFLTLRHKRPKAKYIIWPRIDQKSCFKSMVTAGFEPVVIENV
X.tropicalis   GMSLTLCFLTLRHKRPKAKYIIWPRIDQKSCFKSMITAGFEPVVIENV

cons           ****** :**** ::*.***:*************::***: *:*:**.


P.ultimum      LSEDGDQLRTDMDGLQRLIDAHRSGDVLAVLSTTSCFAPRGYDDVEAI
M.musculus     L--EGDELRTDLKAVEAKIQELGPEHILCLHSTTACFAPRVPDRLEEL
X.tropicalis   L--EGDELRTDLDAVEAKITELGAENILCVHSTTSCFAPRVPDRVEEL

cons           *  :**:****:..::  *    . .:*.: ***:*****  * :* :


P.ultimum      ARVCQTHDIAHVINNAYGVQASKCTHVVNQAMRVGRVDAIVQSLDKNF
M.musculus     AVICANYDIPHVVNNAYGLQSSKCMHLIQQGARVGRIDAFVQSLDKNF
X.tropicalis   AVICKKYEIPHVVNNAYGVQSSKCMHLIQQGARVGRIDAFVQSLDKNF

cons           * :* .::*.**:*****:*:*** *:::*. ****:**:********


P.ultimum      MVPVGGAIVCAPSAEMVASVSKCYPGRAAITPTLDFFITMLQMGRKGY
M.musculus     MVPVGGAIIAGFNEPFIQDISKMYPGRASASPSLDVLITLLSLGCSGY
X.tropicalis   MVPVGGAVIAGFSDSFVQEISKMYPGRASASPSLDVLITLLSLGASGY

cons           *******::.. .  :: .:** *****: :*:**.:**:*.:* .**


P.ultimum      RQLLQERKTLAKYLQEQLQIVAHEVGERVLHVPFNEISFAMTLSTFST
M.musculus     RKLLKERKEMFVYLSTQLKKLAEAHNERLLQTPHNPISLAMTLKTIDG
X.tropicalis   NKLLKERKEMFVYLSSELKKLAKELNERLLETPHNPISLALSLTSLSE

cons           .:**:*** :  **. :*: :*.  .**:*..*.* **:*::*.::. 


P.ultimum      ASDARTKAQELTFFGAMLFSRGVSGTRVVSCLDNKTIGGYTFESYGAH
M.musculus     HHD-----KAVTQLGSMLFTRQVSGARAVPLGNVQTVSGHTFRGFMSH
X.tropicalis   QSG-----SAVTQLGSMLFTRQVSGARVVPLGTSQTINGYVFKGFMSH

cons             .     . :* :*:***:* ***:*.*.    :*:.*:.*..: :*


P.ultimum      SDHFPAPYLTVACAIGMTKDEVDALVVKLRKTIHEWRTKHNRS-----
M.musculus     ADNYPCAYLNAAAAIGMKMQDVDLFIKRLDKCLNIVRKEQTRASVVSG
X.tropicalis   SNNYPCAYLNAASAICIKKQDVDMFIKRLDKCLRLCKKEKHLAKDEPR

cons           ::::*..**..*.** :. ::** :: :* * :.  :.::  :     


P.ultimum      ---------------------------------S
M.musculus     ADRNKAEDADIEEMALKLDDVLG-DVGQ--GPAL
X.tropicalis   CAQQTTED-DVAELAQGLGDVLQGETASELLLSG

cons