T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=98
*
 BAD AVG GOOD
*
C.owczarzaki   :  99
M.musculus     :  97
X.tropicalis   :  97
cons           :  98

C.owczarzaki   -------------NDAYIQQGADAIRTRQNLVKSLLAQRKWPELGWDE
M.musculus     MNPESFAAGERRVSPAYVRQGCEARRAHEHLIRLLLEQGKCPEDGWDE
X.tropicalis   MEHESFKASERLVTPAYIRQGREARRMHEQLVRQLVEQGKCPKEPWDE

cons                        . **::** :* * :::*:: *: * * *:  ***


C.owczarzaki   MSIELLLSDLAQMDSNNFPANIGAGEREARVYSDLVARRHFRMAHGIG
M.musculus     STLELFLHELAVMDSNNFLGNCGVGEREGRVASALVARRHYRFIHGIG
X.tropicalis   STIEIFLNELAVMDSNNFLGNCGVGEREGRVASGMVSRRHYRLIHGIG

cons            ::*::* :** ****** .* *.****.** * :*:***:*: ****


C.owczarzaki   RSGDIAAIQPKAAGSSLIMKLVNIMCLDVIRLAGVHAANACIALPLAT
M.musculus     RSGDISAVQPKAAGSSLLNKITNSLVLNVIKLAGVHSVASCFVVPMAT
X.tropicalis   RSGDISAIQPKAAGSSVLNKLTNSMVLDIIRLAGVRTASSCFVVPMAT

cons           *****:*:********:: *:.* : *::*:****::. :*:.:*:**


C.owczarzaki   GMAMVMTLLTLAQTRPPSARKVLWLRIDQKSCIKAITACGFEVVVVDN
M.musculus     GMSLTLCFLTLRHKRP-KAKYIIWPRIDQKSCFKSMVTAGFEPVVIEN
X.tropicalis   GMSLTLCFLTLRHKRP-KAKYIIWPRIDQKSCFKSMITAGFEPVVIEN

cons           **::.: :*** :.** .*: ::* *******:*:: :.*** **::*


C.owczarzaki   AIEGDEVRTDLSALQHQVNTVGKDNILCIVSTTSCFAPRCPDRIVEIA
M.musculus     VLEGDELRTDLKAVEAKIQELGPEHILCLHSTTACFAPRVPDRLEELA
X.tropicalis   VLEGDELRTDLDAVEAKITELGAENILCVHSTTSCFAPRVPDRVEELA

cons           .:****:****.*:: ::  :* ::***: ***:***** ***: *:*


C.owczarzaki   KICATESIPHVINNAYGIQSSKITALIQDAHKAGRVDAFVQSSDKNLM
M.musculus     VICANYDIPHVVNNAYGLQSSKCMHLIQQGARVGRIDAFVQSLDKNFM
X.tropicalis   VICKKYEIPHVVNNAYGVQSSKCMHLIQQGARVGRIDAFVQSLDKNFM

cons            ** . .****:*****:****   ***:. :.**:****** ***:*


C.owczarzaki   VPVGGALVAGHDRAFIKRIGEMYPGRASAAPSVDIFITLLSMGQQGFR
M.musculus     VPVGGAIIAGFNEPFIQDISKMYPGRASASPSLDVLITLLSLGCSGYR
X.tropicalis   VPVGGAVIAGFSDSFVQEISKMYPGRASASPSLDVLITLLSLGASGYN

cons           ******::**.. .*:: *.:********:**:*::*****:* .*:.


C.owczarzaki   SLLKQRKVVFEQLRAKLGAFAVSQGERLLETPHNPISLGMIQTASSGT
M.musculus     KLLKERKEMFVYLSTQLKKLAEAHNERLLQTPHNPISLAMTLKTIDGH
X.tropicalis   KLLKERKEMFVYLSSELKKLAKELNERLLETPHNPISLALSLTSLSEQ

cons           .***:** :*  * ::*  :*   .****:********.:  .: .  


C.owczarzaki   FGSDATRLGSFLFTRCVSGTRCAVALAPATSVGPVSLSNFGAHHSAYH
M.musculus     HDKAVTQLGSMLFTRQVSGAR-AVPLGNVQTVSGHTFRGFMSHADNYP
X.tropicalis   SGSAVTQLGSMLFTRQVSGAR-VVPLGTSQTINGYVFKGFMSHSNNYP

cons            .. .*:***:**** ***:* .*.*.   ::.   : .* :* . * 


C.owczarzaki   GAYLTAAAAIGMTEQEVDALIDRLTAAFKDL-----------------
M.musculus     CAYLNAAAAIGMKMQDVDLFIKRLDKCLNIVRKEQTRASVVSGADRNK
X.tropicalis   CAYLNAASAICIKKQDVDMFIKRLDKCLRLCKKEKHLAKDEPRCAQQT

cons            ***.**:** :. *:** :*.**  .:.                   


C.owczarzaki   ----------------------------R
M.musculus     AEDADIEEMALKLDDVLG-DVGQG--PAL
X.tropicalis   TED-DVAELAQGLGDVLQGETASELLLSG

cons