T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=97
*
 BAD AVG GOOD
*
C.merolae      :  98
M.musculus     :  97
X.tropicalis   :  97
cons           :  97

C.merolae      MDADLLEKARALADPAYVTVAEAARRSRTALFRQLLTQRRLLPQGLDE
M.musculus     MNPESFAAGERRVSPAYVRQGCEARRAHEHLIRLLLEQGKCPEDGWDE
X.tropicalis   MEHESFKASERLVTPAYIRQGREARRMHEQLVRQLVEQGKCPKEPWDE

cons           *: : :  ..  . ***:  .  *** :  *.* *: * :   :  **


C.merolae      HTVRLLVDELAGLDANQFIDQANVGEREGRIYSELVRARHFGMAHGMG
M.musculus     STLELFLHELAVMDSNNFLGNCGVGEREGRVASALVARRHYRFIHGIG
X.tropicalis   STIEIFLNELAVMDSNNFLGNCGVGEREGRVASGMVSRRHYRLIHGIG

cons            *:.:::.*** :*:*:*:.:..*******: * :*  **: : **:*


C.merolae      RAGDLAASQPKACGASILVRLCAALLLDALHVAGFRSCRRVALLPIAT
M.musculus     RSGDISAVQPKAAGSSLLNKITNSLVLNVIKLAGVHSVASCFVVPMAT
X.tropicalis   RSGDISAIQPKAAGSSVLNKLTNSMVLDIIRLAGVRTASSCFVVPMAT

cons           *:**::* ****.*:*:* ::  :::*: :::**.::     ::*:**


C.merolae      GMAMTLCLLALRWQRPAADRVLWIRIDQKACLKCIRAAGYQIDVLENK
M.musculus     GMSLTLCFLTLRHKRPKAKYIIWPRIDQKSCFKSMVTAGFEPVVIENV
X.tropicalis   GMSLTLCFLTLRHKRPKAKYIIWPRIDQKSCFKSMITAGFEPVVIENV

cons           **::***:*:** :** *. ::* *****:*:*.: :**::  *:** 


C.merolae      LDGDQVVTDMEALEKRLAASDPSRYAAVISTTSCFAPRAPDRVVAIAQ
M.musculus     LEGDELRTDLKAVEAKIQELGPEHILCLHSTTACFAPRVPDRLEELAV
X.tropicalis   LEGDELRTDLDAVEAKITELGAENILCVHSTTSCFAPRVPDRVEELAV

cons           *:**:: **:.*:* ::   ....  .: ***:*****.***:  :* 


C.merolae      LCARYGIPHLINHAYGVQSRRCNGLVCAACRLGRVDAVIFSFDKNFMV
M.musculus     ICANYDIPHVVNNAYGLQSSKCMHLIQQGARVGRIDAFVQSLDKNFMV
X.tropicalis   ICKKYEIPHVVNNAYGVQSSKCMHLIQQGARVGRIDAFVQSLDKNFMV

cons           :* .* ***::*:***:** :*  *:  ..*:**:**.: *:******


C.merolae      PVGGAGVAGTSPTFIEAVESLYPGRASVAPVVDLFITLLQLGRDGFSG
M.musculus     PVGGAIIAGFNEPFIQDISKMYPGRASASPSLDVLITLLSLGCSGYRK
X.tropicalis   PVGGAVIAGFSDSFVQEISKMYPGRASASPSLDVLITLLSLGASGYNK

cons           ***** :** . .*:: :..:******.:* :*::****.** .*:  


C.merolae      LLRERERRFQRFQAQLAPVLAKHGERLLHTPDNPISFAISLEHTMLEG
M.musculus     LLKERKEMFVYLSTQLKKLAEAHNERLLQTPHNPISLAMTLKTIDGHH
X.tropicalis   LLKERKEMFVYLSSELKKLAKELNERLLETPHNPISLALSLTSLSEQS

cons           **:**:. *  :.::*  :    .****.**.****:*::*     . 


C.merolae      GIEPTAIGSMLYARRCSGPRAVLGTERRLVQGVLLAGYGAHIADYPVP
M.musculus     DKAVTQLGSMLFTRQVSGARAVPLGNVQTVSGHTFRGFMSHADNYPCA
X.tropicalis   GSAVTQLGSMLFTRQVSGARVVPLGTSQTINGYVFKGFMSHSNNYPCA

cons           .   * :****::*: **.*.*     : :.*  : *: :*  :** .


C.merolae      YLNLAAAIGIRDIDIERFCRRLDEVLGQV-------------------
M.musculus     YLNAAAAIGMKMQDVDLFIKRLDKCLNIVRKEQTRASVVSGADRNKAE
X.tropicalis   YLNAASAICIKKQDVDMFIKRLDKCLRLCKKEKHLAKDEPRCAQQTTE

cons           *** *:** ::  *:: * :***: *                      


C.merolae      --------------------------R
M.musculus     DADIEEMALKLDDVL-GDVGQ--GPAL
X.tropicalis   D-DVAELAQGLGDVLQGETASELLLSG

cons