T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=98
*
 BAD AVG GOOD
*
B.hominis      :  98
M.musculus     :  97
X.tropicalis   :  97
cons           :  98

B.hominis      MNEKNFEYARSLIPATYVNQGRDAIKRRENLVKDLLTHRKIPEIGWDD
M.musculus     MNPESFAAGERRVSPAYVRQGCEARRAHEHLIRLLLEQGKCPEDGWDE
X.tropicalis   MEHESFKASERLVTPAYIRQGREARRMHEQLVRQLVEQGKCPKEPWDE

cons           *: :.*  ..  :..:*:.** :* : :*:*:: *: : * *:  **:


B.hominis      QSIELFLNDLSLMDSNNFLGNSGVGEREGRIAST-VAKRHFYLAHGIG
M.musculus     STLELFLHELAVMDSNNFLGNCGVGEREGRVASALVARRHYRFIHGIG
X.tropicalis   STIEIFLNELAVMDSNNFLGNCGVGEREGRVASGMVSRRHYRLIHGIG

cons           .::*:**::*::*********.********:**  *::**: : ****


B.hominis      RAGDVAAIQ-KAAGSSLICELTRKMAVDFIQTCGITEVKDCIVLPLAT
M.musculus     RSGDISAVQPKAAGSSLLNKITNSLVLNVIKLAGVHSVASCFVVPMAT
X.tropicalis   RSGDISAIQPKAAGSSVLNKLTNSMVLDIIRLAGVRTASSCFVVPMAT

cons           *:**::*:* ******:: ::*..:.::.*: .*:  . .*:*:*:**


B.hominis      GMSISMCLLSLRLNNPTAKYVIWFRVDQKTCLKSILTTGLEPIIIDPV
M.musculus     GMSLTLCFLTLRHKRPKAKYIIWPRIDQKSCFKSMVTAGFEPVVIENV
X.tropicalis   GMSLTLCFLTLRHKRPKAKYIIWPRIDQKSCFKSMITAGFEPVVIENV

cons           ***:::*:*:** :.*.***:** *:***:*:**::*:*:**::*: *


B.hominis      PEGDELNTNLGALREKLESIKREEILCIIPTTSVFAPRLPDDIVGVSK
M.musculus     LEGDELRTDLKAVEAKIQELGPEHILCLHSTTACFAPRVPDRLEELAV
X.tropicalis   LEGDELRTDLDAVEAKITELGAENILCVHSTTSCFAPRVPDRVEELAV

cons            *****.*:* *:. *: .:  *.***: .**: ****:** :  :: 


B.hominis      LAKEFSVPVIVNNAYGLQSGATCKAIDRAIRVGRIDMLVSSTDKNMLV
M.musculus     ICANYDIPHVVNNAYGLQSSKCMHLIQQGARVGRIDAFVQSLDKNFMV
X.tropicalis   ICKKYEIPHVVNNAYGVQSSKCMHLIQQGARVGRIDAFVQSLDKNFMV

cons           :. ::.:* :******:**.   : *::. ****** :*.* ***::*


B.hominis      PVGGALVYSPQSGMVDLVRKNYPGRASMSPILDVFITLLSMGKRELRS
M.musculus     PVGGAIIAGFNEPFIQDISKMYPGRASASPSLDVLITLLSLGCSGYRK
X.tropicalis   PVGGAVIAGFSDSFVQEISKMYPGRASASPSLDVLITLLSLGASGYNK

cons           *****:: . .. ::: : * ****** ** ***:*****:*    ..


B.hominis      VLKEREDCYQYLLDRLGEVAGRYKQRVLRTPRNPISIAVTLDNPFPED
M.musculus     LLKERKEMFVYLSTQLKKLAEAHNERLLQTPHNPISLAMTLKTI----
X.tropicalis   LLKERKEMFVYLSSELKKLAKELNERLLETPHNPISLALSLTSL----

cons           :****:: : **  .* ::*   ::*:*.**:****:*::* .     


B.hominis      DSFEYSDEDITKFGAMLYTRGVSGSRCVGFHNKKSVGKYEFANYGGHT
M.musculus     --DGHHDKAVTQLGSMLFTRQVSGARAVPLGNVQTVSGHTFRGFMSHA
X.tropicalis   --SEQSGSAVTQLGSMLFTRQVSGARVVPLGTSQTINGYVFKGFMSHS

cons                 .. :*::*:**:** ***:* * : . :::. : * .: .*:


B.hominis      DHYPHAYFTSAAAIGVKKEEIDVFIDRLE-------------------
M.musculus     DNYPCAYLNAAAAIGMKMQDVDLFIKRLDKCLNIVRKEQTRASVVSGA
X.tropicalis   NNYPCAYLNAASAICIKKQDVDMFIKRLDKCLRLCKKEKHLAKDEPRC

cons           ::** **:.:*:** :* :::*:**.**:                   


B.hominis      --------------------------------K
M.musculus     DRNKAEDADIEEMALKLDDVLG-DVGQG--PAL
X.tropicalis   AQQTTED-DVAELAQGLGDVLQGETASELLLSG

cons