T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=95
*
 BAD AVG GOOD
*
N.gruberi      :  94
M.musculus     :  95
X.tropicalis   :  95
cons           :  95

N.gruberi      ------EIASTLIQANHVKQALQAVNKQQKMYKTLLSQRQLPKEGFSD
M.musculus     MNPESFAAGERRVSPAYVRQGCEARRAHEHLIRLLLEQGKCPEDGWDE
X.tropicalis   MEHESFKASERLVTPAYIRQGREARRMHEQLVRQLVEQGKCPKEPWDE

cons                   ..  : . :::*. :* . :::: : *:.* : *:: :.:


N.gruberi      QQIESLLSFFASMDTNNYENHIGIGEREGRVFSKLVEKRHFYLSHGIG
M.musculus     STLELFLHELAVMDSNNFLGNCGVGEREGRVASALVARRHYRFIHGIG
X.tropicalis   STIEIFLNELAVMDSNNFLGNCGVGEREGRVASGMVSRRHYRLIHGIG

cons           . :* :*  :* **:**: .: *:******* * :* :**: : ****


N.gruberi      RSGELTSNQPKAAGSSIILQLCNYLVNHAIQLAGCKNVKKSIVVPMCT
M.musculus     RSGDISAVQPKAAGSSLLNKITNSLVLNVIKLAGVHSVASCFVVPMAT
X.tropicalis   RSGDISAIQPKAAGSSVLNKLTNSMVLDIIRLAGVRTASSCFVVPMAT

cons           ***:::: ********:: :: * :* . *:*** :.. ..:****.*


N.gruberi      GMTLALCLRSLANSLEQPNKKYVIWPRIDQQSVLKSIDTAGFTPIVIE
M.musculus     GMSLTLCFLTLRH--KRPKAKYIIWPRIDQKSCFKSMVTAGFEPVVIE
X.tropicalis   GMSLTLCFLTLRH--KRPKAKYIIWPRIDQKSCFKSMITAGFEPVVIE

cons           **:*:**: :* :  ::*: **:*******:* :**: **** *:***


N.gruberi      NVLNEDGSIEANLQSIESKIQQVGAENILCVLSTTSCFAPRVPDDVFE
M.musculus     NVLEGD-ELRTDLKAVEAKIQELGPEHILCLHSTTACFAPRVPDRLEE
X.tropicalis   NVLEGD-ELRTDLDAVEAKITELGAENILCVHSTTSCFAPRVPDRVEE

cons           ***: * .:.::*.::*:** ::*.*:***: ***:******** : *


N.gruberi      IGKICFKYGIGQVVNNAYGVQSKIIMERINKTIASSKSTITCFVQSTD
M.musculus     LAVICANYDIPHVVNNAYGLQSSKCMHLIQQG--ARVGRIDAFVQSLD
X.tropicalis   LAVICKKYEIPHVVNNAYGVQSSKCMHLIQQG--ARVGRIDAFVQSLD

cons           :. ** :* * :*******:**.  *. *::   :  . * .**** *


N.gruberi      KNFMVPVGGAVVSSGSDITFIDKVSKIYAGRASMTPILDLFITLLSMG
M.musculus     KNFMVPVGGAIIAGFN-EPFIQDISKMYPGRASASPSLDVLITLLSLG
X.tropicalis   KNFMVPVGGAVIAGFS-DSFVQEISKMYPGRASASPSLDVLITLLSLG

cons           **********:::. .  .*::.:**:*.**** :* **::*****:*


N.gruberi      KDGWEKLLAEREVLFQHFVSEIESKLTNTQSKFSLIRGSLQRNQISFA
M.musculus     CSGYRKLLKERKEMFVYLSTQLK-KLAEAHNERLL---QTPHNPISLA
X.tropicalis   ASGYNKLLKERKEMFVYLSSELK-KLAKELNERLL---ETPHNPISLA

cons            .*:.*** **: :* :: :::: **::  .:  *   .  :* **:*


N.gruberi      LSIDLPKE---EA-LKVGVSLFYRNCTGPRVVLKGSSKTVLPHLSFVG
M.musculus     MTLKTIDGHHDKAVTQLGSMLFTRQVSGARAVPLGNVQTVSGH-TFRG
X.tropicalis   LSLTSLSEQSGSAVTQLGSMLFTRQVSGARVVPLGTSQTINGY-VFKG

cons           :::   .    .*  ::*  ** *: :*.*.*  *. :*:  :  * *


N.gruberi      YGSHTDSYPHHYITLACAIGIEKEEIESFLTLLN--------------
M.musculus     FMSHADNYPCAYLNAAAAIGMKMQDVDLFIKRLDKCLNIVRKEQTRAS
X.tropicalis   FMSHSNNYPCAYLNAASAICIKKQDVDMFIKRLDKCLRLCKKEKHLAK

cons           : **::.**  *:. *.** :: :::: *:. *:              


N.gruberi      -------------------------------------K
M.musculus     VVSGADRNKAEDADIEEMALKLDDVLG-DVGQG--PAL
X.tropicalis   DEPRCAQQTTED-DVAELAQGLGDVLQGETASELLLSG

cons