T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=96
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 BAD AVG GOOD
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H.arabidopsidis   :  96
M.musculus        :  96
X.tropicalis      :  96
cons              :  96

H.arabidopsidis   ---------------------------------------------
M.musculus        MNPESFAAGERRVSPAYVRQGCEARRAHEHLIRLLLEQGKCPEDG
X.tropicalis      MEHESFKASERLVTPAYIRQGREARRMHEQLVRQLVEQGKCPKEP

cons                                                           


H.arabidopsidis   ---------------------------------------------
M.musculus        WDESTLELFLHELAVMDSNNFLGNCGVGEREGRVASALVARRHYR
X.tropicalis      WDESTIEIFLNELAVMDSNNFLGNCGVGEREGRVASGMVSRRHYR

cons                                                           


H.arabidopsidis   ----------------KAAGSSLLVQLANALAKDVLRLAGLRAVX
M.musculus        FIHGIGRSGDISAVQPKAAGSSLLNKITNSLVLNVIKLAGVHSVA
X.tropicalis      LIHGIGRSGDISAIQPKAAGSSVLNKLTNSMVLDIIRLAGVRTAS

cons                              ******:* :::*::. ::::***:::. 


H.arabidopsidis   SALVLPVATGMSLCWCXLQLKKTRPAARYVIWPRVDQKSCFKAIL
M.musculus        SCFVVPMATGMSLTLCFLTLRHKRPKAKYIIWPRIDQKSCFKSMV
X.tropicalis      SCFVVPMATGMSLTLCFLTLRHKRPKAKYIIWPRIDQKSCFKSMI

cons              *.:*:*:******  * * *::.** *:*:****:*******:::


H.arabidopsidis   AAGLTPLVLANCLVVADEVCGGXLKTDLVGMAALMDQYGSESILA
M.musculus        TAGFEPVVIENVL-EGDE-----LRTDLKAVEAKIQELGPEHILC
X.tropicalis      TAGFEPVVIENVL-EGDE-----LRTDLDAVEAKITELGAENILC

cons              :**: *:*: * *  .**     *:*** .: * : : *.* **.


H.arabidopsidis   VSSTTSCFAPRAYDAVKEIAQLCQERNIAHVINNAYGVQASACVH
M.musculus        LHSTTACFAPRVPDRLEELAVICANYDIPHVVNNAYGLQSSKCMH
X.tropicalis      VHSTTSCFAPRVPDRVEELAVICKKYEIPHVVNNAYGVQSSKCMH

cons              : ***:*****. * ::*:* :* : :*.**:*****:*:* *:*


H.arabidopsidis   QIDLAMRIGRVDAVVQSLDKNFLVPVGGAIVCSTSSEIVDSVAKF
M.musculus        LIQQGARVGRIDAFVQSLDKNFMVPVGGAIIAGFNEPFIQDISKM
X.tropicalis      LIQQGARVGRIDAFVQSLDKNFMVPVGGAVIAGFSDSFVQEISKM

cons               *: . *:**:**.********:******::.. .. :::.::*:


H.arabidopsidis   YPGRASATPALDFFITMLQMGKNGYRRLLEERKHLAAYMREKLEV
M.musculus        YPGRASASPSLDVLITLLSLGCSGYRKLLKERKEMFVYLSTQLKK
X.tropicalis      YPGRASASPSLDVLITLLSLGASGYNKLLKERKEMFVYLSSELKK

cons              *******:*:**.:**:*.:* .**.:**:***.: .*:  :*: 


H.arabidopsidis   LAAEEGEHVLKVSTNEISYAMTLATFCSEVEDRQEKSRRLTLLGA
M.musculus        LAEAHNERLLQTPHNPISLAMTLKTIDG------HHDKAVTQLGS
X.tropicalis      LAKELNERLLETPHNPISLALSLTSLSE------QSGSAVTQLGS

cons              **   .*::*:.. * ** *::* ::        . .  :* **:


H.arabidopsidis   MLFSRGVCGARVVSCLDSKCIAGYEFDSFGAHYDEFPVAYVTFAC
M.musculus        MLFTRQVSGARAVPLGNVQTVSGHTFRGFMSHADNYPCAYLNAAA
X.tropicalis      MLFTRQVSGARVVPLGTSQTINGYVFKGFMSHSNNYPCAYLNAAS

cons              ***:* *.***.*.    : : *: * .* :* :::* **:. *.


H.arabidopsidis   VLGMQKTEVDMLMTKLRKTIHDWRKKQNTI---------------
M.musculus        AIGMKMQDVDLFIKRLDKCLNIVRKEQTRASVVSGADRNKAEDAD
X.tropicalis      AICIKKQDVDMFIKRLDKCLRLCKKEKHLAKDEPRCAQQTTED-D

cons              .: ::  :**:::.:* * :.  :*::                  


H.arabidopsidis   -----------------------S
M.musculus        IEEMALKLDDVLG-DVGQ--GPAL
X.tropicalis      VAELAQGLGDVLQGETASELLLSG

cons