T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=82
*
 BAD AVG GOOD
*
T.trahens    :  69
H.Sapiens    :  81
M.musculus   :  85
X.laevis     :  83
cons         :  82

T.trahens    ------------------------------------------------
H.Sapiens    MKTAENIRGTGSDGPRKRGLCVLCGLPAAGKSTFARALAHRLQQEQGW
M.musculus   MKTAAARGATRRDGQPKLGLCVLCGLPAAGKSTFARALALRLRRERGW
X.laevis     MCEEATR--------RQVGICLLCGLPGAGKSTLGRSFSATILRQR--

cons                                                         


T.trahens    ------------------------------------------------
H.Sapiens    AIGVVAYDDVMP-DAFL----A-GARAR-----------PAPSQWKLL
M.musculus   AVGVLSYDDVLP-LALP----D-CDGTQ-----------PRPSQWKMF
X.laevis     -FAVITYDKIITAEAFHLALQDELDQSREIPPSSALLKTQETSQWKQH

cons                                                         


T.trahens    ------------------------------------------------
H.Sapiens    RQELLKYLEYFLMAVINGCQMSVPPNRTEAMWEDFITCLKDQDLI-FS
M.musculus   RQELLKHLECFLVAVISGAQMSAPPNRTEAVWEDFITCLKSQDLMIFP
X.laevis     RQYLLEYLEHLIVALLNSSELRPPEGKCDGTWYRFVDCLEEQGLI-SS

cons                                                         


T.trahens    ------------------------------------------------
H.Sapiens    AA-FEAQSCYLLTKTAVSRPLFLVLDDNFYYQSMRYEVYQLARKYSLG
M.musculus   TA-LEAQPCHLLAKPAVSRPLFLVLDDNFYYQSMRYEVYQLARKYSLG
X.laevis     AGSSTEKGTHSVIIP-ENDEVCLVLDDNFYYQSMRYEVYQLARKYSLG

cons                                                         


T.trahens    ------------------------------------------------
H.Sapiens    FCQLFLDCPLETCLQRNGQRPQALPPETIHLMGRKLEKPNPEKNAWEH
M.musculus   FCQLFLDCPLETCLKRNGERSQPLPDETIQLMGRKIEKPNPEKNAWEH
X.laevis     FCQIYLHCPVESCVLRNKGRPVSIAEDTIRLMDKKIQKPNPEKNSWEQ

cons                                                         


T.trahens    --------------------------------------------AVTA
H.Sapiens    NSLTIPSPACASEASLEVTDLLLTALENPVKYAEDNMEQKDTDRIICS
M.musculus   NSLIIQSSACSLEASLEVTGLLLTALENPIKCVEDNTEQKETDRIICS
X.laevis     NSLVLDSSQLIKADDHRIVKLVNQAMANPLRPLQENLEIKEKDRAITA

cons                                                      : :


T.trahens    ANLAHQADLASRRAFTAVMRGLGQ----GDDRKAAASALHAAKAAALA
H.Sapiens    TNILHKTDQTLRRIVSQTMKEAKGNQEAFSEMTFKQRWVRANHAA-IW
M.musculus   TNILHKADETLRRTVSQTMREAKDEQIPLNNLKHLAEELNKLKADVLE
X.laevis     ASILHQADQSIRRCISETMRRVKGTAS-AHEMKVAAQELQSAKSQFLE

cons         :.: *::* : ** .: .*:          : .     :.  ::  : 


T.trahens    AFR---------------------------------------------
H.Sapiens    RIILGN-EHIKCRSAKVGWLQ---------CCRIE-------------
M.musculus   DLRQGN-RKYLCFQQTTDLSDIISSFCKERDTIVQ-------------
X.laevis     DLRERLCEKGIQPMTACNATTIVSLFKEQTDHIVQPFLATEQSCCLEP

cons          :                                              


T.trahens    -----------D
H.Sapiens    -----KRPLSTG
M.musculus   -----KYFSKQH
X.laevis     NLDCNDRASGIS

cons