T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=84
*
 BAD AVG GOOD
*
supercontig_1.4   :  80
DANIO_RERIO       :  83
SelW1_Homo_sapi   :  83
SelW2_Homo_sapi   :  86
SelW2_Mus_muscu   :  86
cons              :  84

supercontig_1.4   ---------------------VLKVNIEYCSACGYFPRMKEIERA
DANIO_RERIO       M--------------------TVKVHVVYCGGXGYRPKFIKLKTL
SelW1_Homo_sapi   M--------------------ALAVRVVYCGAXGYKSKYLQLKKK
SelW2_Homo_sapi   MSGEPGQTSVAPPPEEVEPGSGVRIVVEYCEPCGFEATYLELASA
SelW2_Mus_muscu   MSGEPAPVSVVPPPGEVEAGSGVHIVVEYCKPCGFEATYLELASA

cons                                    : : : **   *: .   ::   


supercontig_1.4   IQKEFPT-AKVTG--EGGRSKSFEVTINGELVHSKLTSGKFVNPP
DANIO_RERIO       LEDEFPNELEITGEGTPSTTGWLEVEVNGKLVHSKKNGDGFVDSD
SelW1_Homo_sapi   LEDEFPGRLDICGEGTPQATGFFEVMVAGKLIHSKKKGDGYVDTE
SelW2_Homo_sapi   VKEQYPG-IEIES--RLGGTGAFEIEINGQLVFSKLENGGFPYEK
SelW2_Mus_muscu   VKEEYPG-IEIES--RLGGTGAFEIEINGQLVFSKLENGGFPYEK

cons              ::.::*   .: .      :  :*: : *:*:.**  .. :    


supercontig_1.4   VI----VEAAKAIACSSPPRDDE---QRHASC
DANIO_RERIO       SKMQKIVTAIEQA----------------MGK
SelW1_Homo_sapi   SKFLKLVAAIKAA---------------LAQG
SelW2_Homo_sapi   DL----IEAIRRASNGETLEKITNSRPPCVIL
SelW2_Mus_muscu   DL----MEAIRRASNGEPVEKITNSRPPCVIL

cons                    : * .