T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=90
*
 BAD AVG GOOD
*
gi|288565305|gb   :  83
SecS_M.musculus   :  92
SecS_X.tropical   :  91
SecS_D.rerio      :  92
cons              :  90

gi|288565305|gb   ------------VDAAYIRQGSDALKSHEKKLTALLAQRKLPEDG
SecS_M.musculus   MNPESFAAGERRVSPAYVRQGCEARRAHEHLIRLLLEQGKCPEDG
SecS_X.tropical   MEHESFKASERLVTPAYIRQGREARRMHEQLVRQLVEQGKCPKEP
SecS_D.rerio      MNSENFRLSEKLVSASYVRQGLDARRGHEQLIRRLLDQGKCPEEG

cons                          * .:*:*** :* : **: :  *: * * *:: 


gi|288565305|gb   WDDLSIQVLLNDLAQMDSNNFAHNAGAGEREARVASSLVRNRCFH
SecS_M.musculus   WDESTLELFLHELAVMDSNNFLGNCGVGEREGRVASALVARRHYR
SecS_X.tropical   WDESTIEIFLNELAVMDSNNFLGNCGVGEREGRVASGMVSRRHYR
SecS_D.rerio      WSESTIELFLNELAVMDSNNFLGNCGVGEREGRVASSLVARRHYR

cons              *.: :::::*::** ******  *.*.****.****.:* .* ::


gi|288565305|gb   LAHGVGRSGDICAVQPKAAGSSLLVQLTNCLVLDMLHLAGIKNAK
SecS_M.musculus   FIHGIGRSGDISAVQPKAAGSSLLNKITNSLVLNVIKLAGVHSVA
SecS_X.tropical   LIHGIGRSGDISAIQPKAAGSSVLNKLTNSMVLDIIRLAGVRTAS
SecS_D.rerio      LIHGIGRSGDIAAVQPKAAGSSLLNKITNSVVLDVLKLTGVRSVS

cons              : **:******.*:********:* ::**.:**::::*:*::.. 


gi|288565305|gb   SAIVLPVATGMALLFAMLTLQAQARVPGRPHTKRYVLWPRIAKSH
SecS_M.musculus   SCFVVPMATGMSLTLCFLTLRHK-----RPK-AKYIIWPRIDQKS
SecS_X.tropical   SCFVVPMATGMSLTLCFLTLRHK-----RPK-AKYIIWPRIDQKS
SecS_D.rerio      SCFVVPMATGMSLTLCFLTLRHR-----RPK-ARYILWPRIDQKS

cons              *.:*:*:****:* :.:***: :     **:  :*::**** :. 


gi|288565305|gb   A-----SSPWSPPASSPLXSRTSWTATSCARTS-QRLKPRCANSG
SecS_M.musculus   CFKSMVTAGFEPVVIEN------VLEGDELRTDLKAVEAKIQELG
SecS_X.tropical   CFKSMITAGFEPVVIEN------VLEGDELRTDLDAVEAKITELG
SecS_D.rerio      CFKSMVTAGFEPVVIEN------VLEGDELRTNLEEVERKIEEFG

cons              .     :: :.* . .           .  **. . :: :  : *


gi|288565305|gb   PR------TFCACSRPRAAL--RRAATTASTRSRSSAGNTILGTS
SecS_M.musculus   PEHILCLHSTTACFAPRVPDRLEELAVICANYDIPHVVNNAYGLQ
SecS_X.tropical   AENILCVHSTTSCFAPRVPDRVEELAVICKKYEIPHVVNNAYGVQ
SecS_D.rerio      AENTLCVHSTTSCFAPRVPDRLEELSVLCAKHDIPHIVNNAYGVQ

cons              ..      :  :*  **..   .. :. . . . .   *.  * .


gi|288565305|gb   STMPTDSSRPSARTSXIKHFGSGASTRASRARTRTFSCPSV-APS
SecS_M.musculus   SSKCMHLIQQGARV--------GRIDAFVQSLDKNFMVPVGGAII
SecS_X.tropical   SSKCMHLIQQGARV--------GRIDAFVQSLDKNFMVPVGGAVI
SecS_D.rerio      PSKCMHLIQQGARV--------GRIDAFVQSLDKNFVVPVGGAII

cons              .:   .  : .**.        *      ::  :.*  *   *  


gi|288565305|gb   SQSPQAFVQAIGKMYPGRASNAPALDLFITMLHLGRRGYKALLDE
SecS_M.musculus   AGFNEPFIQDISKMYPGRASASPSLDVLITLLSLGCSGYRKLLKE
SecS_X.tropical   AGFSDSFVQEISKMYPGRASASPSLDVLITLLSLGASGYNKLLKE
SecS_D.rerio      AGFDENFIQEISKIYPGRASASPSLDVLITLLTLGANGYKKLLAD

cons              :   : *:* *.*:****** :*:**::**:* **  **. ** :


gi|288565305|gb   RKRLVPYFSAALTSVATAHGERVLVTRHNDISFCLTLSHVGG---
SecS_M.musculus   RKEMFVYLSTQLKKLAEAHNERLLQTPHNPISLAMTLKTIDGHHD
SecS_X.tropical   RKEMFVYLSSELKKLAKELNERLLETPHNPISLALSLTSLSEQSG
SecS_D.rerio      RKELYGHLAQELSALAARHGERLLKTPHNPISLAMSLNHLEAHSS

cons              **.:  :::  *. :*   .**:* * ** **:.::*. :     


gi|288565305|gb   NDATFLGSMLFSRGVSGTRVVTGTSRATIVGHAFEGFGAHSATYP
SecS_M.musculus   KAVTQLGSMLFTRQVSGARAVPLGNVQTVSGHTFRGFMSHADNYP
SecS_X.tropical   SAVTQLGSMLFTRQVSGARVVPLGTSQTINGYVFKGFMSHSNNYP
SecS_D.rerio      SAVTQLGSMLFTRQVSGARVVPLGVQQTVSGHTFSGFMSHSEAYP

cons              . .* ******:* ***:*.*.     *: *:.* ** :*:  **


gi|288565305|gb   TAYLSAACAIGMTQDEIDVFIARLNKTLGDFHAKSATAS--SGGP
SecS_M.musculus   CAYLNAAAAIGMKMQDVDLFIKRLDKCLNIVRKEQTRASVVSGAD
SecS_X.tropical   CAYLNAASAICIKKQDVDMFIKRLDKCLRLCKKEKHLAKDEPRCA
SecS_D.rerio      CPYLNAASAIGITKGDVTVCMKRLGKCLKILKKEKSDPADLE---

cons               .**.**.** :.  :: : : **.* *   : :.  .       


gi|288565305|gb   QT-LNDKQXXQVRQMALRSSSVA-NDTQ--QYPTL
SecS_M.musculus   RNKAEDA---DIEEMALKLDDVL-GDVG--QGPAL
SecS_X.tropical   QQTTED----DVAELAQGLGDVLQGETASELLLSG
SecS_D.rerio      ---AEDG---ELEESPQR-----------STELRV

cons                  :*    :: : .