T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=97
*
 BAD AVG GOOD
*
gi|299737268|gb   :  98
SecS_M.musculus   :  97
SecS_X.tropical   :  97
SecS_D.rerio      :  97
cons              :  97

gi|299737268|gb   MNAKNAQLAEAFVAPTYVEQGLAAIRNREQLFTALLSQRRVPDDG
SecS_M.musculus   MNPESFAAGERRVSPAYVRQGCEARRAHEHLIRLLLEQGKCPEDG
SecS_X.tropical   MEHESFKASERLVTPAYIRQGREARRMHEQLVRQLVEQGKCPKEP
SecS_D.rerio      MNSENFRLSEKLVSASYVRQGLDARRGHEQLIRRLLDQGKCPEEG

cons              *: :.   .*  *:.:*:.**  * * :*:*.  *:.* : *.: 


gi|299737268|gb   WDEQTVELVLQSLAAMDSNNFRTNIGAGEREARVFSSLVAKRHFH
SecS_M.musculus   WDESTLELFLHELAVMDSNNFLGNCGVGEREGRVASALVARRHYR
SecS_X.tropical   WDESTIEIFLNELAVMDSNNFLGNCGVGEREGRVASGMVSRRHYR
SecS_D.rerio      WSESTIELFLNELAVMDSNNFLGNCGVGEREGRVASSLVARRHYR

cons              *.*.*:*:.*:.**.******  * *.****.** *.:*::**::


gi|299737268|gb   LCHGVGRSGDVAAVQPKAAGSSLIVQLTNALAKDLLREAGLRSIT
SecS_M.musculus   FIHGIGRSGDISAVQPKAAGSSLLNKITNSLVLNVIKLAGVHSVA
SecS_X.tropical   LIHGIGRSGDISAIQPKAAGSSVLNKLTNSMVLDIIRLAGVRTAS
SecS_D.rerio      LIHGIGRSGDIAAVQPKAAGSSLLNKITNSVVLDVLKLTGVRSVS

cons              : **:*****::*:********:: ::**::. :::: :*::: :


gi|299737268|gb   SALVLPVATGMSLTLVLLTLRAQKPDAKYVIWPRIDQKSCFKSIL
SecS_M.musculus   SCFVVPMATGMSLTLCFLTLRHKRPKAKYIIWPRIDQKSCFKSMV
SecS_X.tropical   SCFVVPMATGMSLTLCFLTLRHKRPKAKYIIWPRIDQKSCFKSMI
SecS_D.rerio      SCFVVPMATGMSLTLCFLTLRHRRPKARYILWPRIDQKSCFKSMV

cons              *.:*:*:******** :**** ::*.*:*::************::


gi|299737268|gb   TAGLTPLVLENTLSEDGDQLRTDMDGLQRLIDAHRSGDVLAVLST
SecS_M.musculus   TAGFEPVVIENVL--EGDELRTDLKAVEAKIQELGPEHILCLHST
SecS_X.tropical   TAGFEPVVIENVL--EGDELRTDLDAVEAKITELGAENILCVHST
SecS_D.rerio      TAGFEPVVIENVL--EGDELRTNLEEVERKIEEFGAENTLCVHST

cons              ***: *:*:**.*  :**:***::. ::  *    . . *.: **


gi|299737268|gb   TSCFAPRGYDDVEAIARVCQTHDIAHVINNAYGVQASKCTHVVNQ
SecS_M.musculus   TACFAPRVPDRLEELAVICANYDIPHVVNNAYGLQSSKCMHLIQQ
SecS_X.tropical   TSCFAPRVPDRVEELAVICKKYEIPHVVNNAYGVQSSKCMHLIQQ
SecS_D.rerio      TSCFAPRVPDRLEELSVLCAKHDIPHIVNNAYGVQPSKCMHLIQQ

cons              *:*****  * :* :: :* .::*.*::*****:*.*** *:::*


gi|299737268|gb   AMRVGRVDAIVQSLDKNFMVPVGGAIVCAPSAEMVASVSKCYPGR
SecS_M.musculus   GARVGRIDAFVQSLDKNFMVPVGGAIIAGFNEPFIQDISKMYPGR
SecS_X.tropical   GARVGRIDAFVQSLDKNFMVPVGGAVIAGFSDSFVQEISKMYPGR
SecS_D.rerio      GARVGRIDAFVQSLDKNFVVPVGGAIIAGFDENFIQEISKIYPGR

cons              . ****:**:********:******::.. .  :: .:** ****


gi|299737268|gb   AAITPTLDFFITMLQMGRKGYRQLLQERKTLAKYLQEQLQIVAHE
SecS_M.musculus   ASASPSLDVLITLLSLGCSGYRKLLKERKEMFVYLSTQLKKLAEA
SecS_X.tropical   ASASPSLDVLITLLSLGASGYNKLLKERKEMFVYLSSELKKLAKE
SecS_D.rerio      ASASPSLDVLITLLTLGANGYKKLLADRKELYGHLAQELSALAAR

cons              *: :*:**.:**:* :* .**.:** :** :  :*  :*. :*  


gi|299737268|gb   VGERVLHVPFNEVLLL-AKHICTKASSNELTFFGAMLFSRGVSGT
SecS_M.musculus   HNERLLQTPHNPISLAMTLKTIDGHHDKAVTQLGSMLFTRQVSGA
SecS_X.tropical   LNERLLETPHNPISLALSLTSLSEQSGSAVTQLGSMLFTRQVSGA
SecS_D.rerio      HGERLLKTPHNPISLAMSLNHLEAHSSSAVTQLGSMLFTRQVSGA

cons               .**:*..*.* : *  :        .. :* :*:***:* ***:


gi|299737268|gb   RVVSCLDNKTIGGYTFESYGAHSDHFPAPYLTVACAIGMTKDEVD
SecS_M.musculus   RAVPLGNVQTVSGHTFRGFMSHADNYPCAYLNAAAAIGMKMQDVD
SecS_X.tropical   RVVPLGTSQTINGYVFKGFMSHSNNYPCAYLNAASAICIKKQDVD
SecS_D.rerio      RVVPLGVQQTVSGHTFSGFMSHSEAYPCPYLNAASAIGITKGDVT

cons              *.*.    :*:.*:.* .: :*:: :*..**..*.** :.  :* 


gi|299737268|gb   ALVVKLRKT------------------------------------
SecS_M.musculus   LFIKRLDKCLNIVRKEQTRASVVSGADRNKAEDADIEEMALKLDD
SecS_X.tropical   MFIKRLDKCLRLCKKEKHLAKDEPRCAQQTTED-DVAELAQGLGD
SecS_D.rerio      VCMKRLGKCLKILKKEKSDPADL------EAEDGELEESPQRS--

cons                : :* *                                     


gi|299737268|gb   -------------I
SecS_M.musculus   VL-GDVGQG--PAL
SecS_X.tropical   VLQGETASELLLSG
SecS_D.rerio      -------TE--LRV

cons