T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=94
*
 BAD AVG GOOD
*
gi|217409454|gb   :  93
SecS_M.musculus   :  94
SecS_X.tropical   :  94
SecS_D.rerio      :  96
cons              :  94

gi|217409454|gb   -------------------------------LRTLLVNRRLPEHG
SecS_M.musculus   MNPESFAAGERRVSPAYVRQGCEARRAHEHLIRLLLEQGKCPEDG
SecS_X.tropical   MEHESFKASERLVTPAYIRQGREARRMHEQLVRQLVEQGKCPKEP
SecS_D.rerio      MNSENFRLSEKLVSASYVRQGLDARRGHEQLIRRLLDQGKCPEEG

cons                                             :* *: : : *:. 


gi|217409454|gb   WSDVQIQHVLYTMATLDTNNKRSWCGVGEREGRVYSALVSSRHFG
SecS_M.musculus   WDESTLELFLHELAVMDSNNFLGNCGVGEREGRVASALVARRHYR
SecS_X.tropical   WDESTIEIFLNELAVMDSNNFLGNCGVGEREGRVASGMVSRRHYR
SecS_D.rerio      WSESTIELFLNELAVMDSNNFLGNCGVGEREGRVASSLVARRHYR

cons              *.:  :: .*  :*.:*:**  . ********** *.:*: **: 


gi|217409454|gb   LSHGVGRSGDIAEPQPKALGSTVLAKLTLCLVLDAVRRGSGLHPQ
SecS_M.musculus   FIHGIGRSGDISAVQPKAAGSSLLNKITNSLVLNVIKL-AGVH--
SecS_X.tropical   LIHGIGRSGDISAIQPKAAGSSVLNKLTNSMVLDIIRL-AGVR--
SecS_D.rerio      LIHGIGRSGDIAAVQPKAAGSSLLNKITNSVVLDVLKL-TGVR--

cons              : **:******:  **** **::* *:* .:**: ::  :*::  


gi|217409454|gb   TAAKSGILLPLCTGMSMALVLGTLRQLQDNQNIVLWSRIDQKSCF
SecS_M.musculus   -SVASCFVVPMATGMSLTLCFLTLRHKRPKAKYIIWPRIDQKSCF
SecS_X.tropical   -TASSCFVVPMATGMSLTLCFLTLRHKRPKAKYIIWPRIDQKSCF
SecS_D.rerio      -SVSSCFVVPMATGMSLTLCFLTLRHRRPKARYILWPRIDQKSCF

cons               :. * :::*:.****::* : ***: : : . ::*.********


gi|217409454|gb   KAIQSAGLECVVVPTRLAGDAVVTDLDAFQASLLTYG-DRVLAVV
SecS_M.musculus   KSMVTAGFEPVVIENVLEGDELRTDLKAVEAKIQELGPEHILCLH
SecS_X.tropical   KSMITAGFEPVVIENVLEGDELRTDLDAVEAKITELGAENILCVH
SecS_D.rerio      KSMVTAGFEPVVIENVLEGDELRTNLEEVERKIEEFGAENTLCVH

cons              *:: :**:* **: . * ** : *:*. .: .:   * :. *.: 


gi|217409454|gb   TTTSCFAPRVPDQVDAVARLCAEQCVPHVINNAYGLQSSDTSKLL
SecS_M.musculus   STTACFAPRVPDRLEELAVICANYDIPHVVNNAYGLQSSKCMHLI
SecS_X.tropical   STTSCFAPRVPDRVEELAVICKKYEIPHVVNNAYGVQSSKCMHLI
SecS_D.rerio      STTSCFAPRVPDRLEELSVLCAKHDIPHIVNNAYGVQPSKCMHLI

cons              :**:********::: :: :* :  :**::*****:*.*.  :*:


gi|217409454|gb   NRACAVGRVDAIVCSTDKNFMVPIGGAIVLSPDESLIQNVGKVYA
SecS_M.musculus   QQGARVGRIDAFVQSLDKNFMVPVGGAIIAGFNEPFIQDISKMYP
SecS_X.tropical   QQGARVGRIDAFVQSLDKNFMVPVGGAVIAGFSDSFVQEISKMYP
SecS_D.rerio      QQGARVGRIDAFVQSLDKNFVVPVGGAIIAGFDENFIQEISKIYP

cons              ::.. ***:**:* * ****:**:***:: . .: ::*::.*:*.


gi|217409454|gb   GRASASPMLDLFITLCSMGLRGYQQLLTSRRILLPTFTERLKEVA
SecS_M.musculus   GRASASPSLDVLITLLSLGCSGYRKLLKERKEMFVYLSTQLKKLA
SecS_X.tropical   GRASASPSLDVLITLLSLGASGYNKLLKERKEMFVYLSSELKKLA
SecS_D.rerio      GRASASPSLDVLITLLTLGANGYKKLLADRKELYGHLAQELSALA

cons              ******* **::*** ::*  **.:** .*: :   :: .*. :*


gi|217409454|gb   NKYGERVLECRTNCISFGVTLDGLRTSVSRDVSSLGAMLFQRCVS
SecS_M.musculus   EAHNERLLQTPHNPISLAMTLKTIDGHHDKAVTQLGSMLFTRQVS
SecS_X.tropical   KELNERLLETPHNPISLALSLTSLSEQSGSAVTQLGSMLFTRQVS
SecS_D.rerio      ARHGERLLKTPHNPISLAMSLNHLEAHSSSAVTQLGSMLFTRQVS

cons                 .**:*:   * **:.::*  :    .  *:.**:*** * **


gi|217409454|gb   GTRVVPRGTVQRMGGMEFCGFGSSHDAYPHAYLTAACAIGLTASE
SecS_M.musculus   GARAVPLGNVQTVSGHTFRGFMSHADNYPCAYLNAAAAIGMKMQD
SecS_X.tropical   GARVVPLGTSQTINGYVFKGFMSHSNNYPCAYLNAASAICIKKQD
SecS_D.rerio      GARVVPLGVQQTVSGHTFSGFMSHSEAYPCPYLNAASAIGITKGD

cons              *:*.** *  * :.*  * ** *  : ** .**.**.** :.  :


gi|217409454|gb   GDDFFTRLDQTLHEFQKRQRRKPSRNIVLWSWIDQKSCFKAIQSA
SecS_M.musculus   VDLFIKRLDKCLNIVRKEQTRASVVSGA-----DR----NKAEDA
SecS_X.tropical   VDMFIKRLDKCLRLCKKEKHLAKDEPRC-----AQ----QTTED-
SecS_D.rerio      VTVCMKRLGKCLKILKKEKSDPADL---------------EAEDG

cons                  :.**.: *.  :*.:                       :. 


gi|217409454|gb   GLECVVVPTRLEGDAVVTDLDAFQAFLLAYGDRVLAVVTTTSCFA
SecS_M.musculus   DI---------------EEM-------------------------
SecS_X.tropical   DV---------------AEL-------------------------
SecS_D.rerio      EL---------------EES-------------------------

cons               :                :                          


gi|217409454|gb   PQVPDQVDAVARLCAEQXLPTKXRRIQLRCYAVPTVRERDKDSTP
SecS_M.musculus   ---------------------------------------------
SecS_X.tropical   ---------------------------------------------
SecS_D.rerio      ---------------------------------------------

cons                                                           


gi|217409454|gb   GHGAAHGRDGILRFWEXSRCLSTRLLDGGVCDWTDRVRRRRLFYS
SecS_M.musculus   ---------------------------------------------
SecS_X.tropical   ---------------------------------------------
SecS_D.rerio      ---------------------------------------------

cons                                                           


gi|217409454|gb   ARSNAARISKTTAALMLNAYG---KSSN
SecS_M.musculus   --------ALKLDDVL-GDVGQ--GPAL
SecS_X.tropical   --------AQGLGDVLQGETASELLLSG
SecS_D.rerio      --------PQR---------ST--ELRV

cons                      .           .