T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=94
*
 BAD AVG GOOD
*
gi|199610358|gb   :  91
SecS_M.musculus   :  95
SecS_X.tropical   :  95
SecS_D.rerio      :  95
cons              :  94

gi|199610358|gb   ---------------------------------------------
SecS_M.musculus   MNPESFAAGERRVSPAYVRQGCEARRAHEHLIRLLLEQGKCPEDG
SecS_X.tropical   MEHESFKASERLVTPAYIRQGREARRMHEQLVRQLVEQGKCPKEP
SecS_D.rerio      MNSENFRLSEKLVSASYVRQGLDARRGHEQLIRRLLDQGKCPEEG

cons                                                           


gi|199610358|gb   ---------------------------------------------
SecS_M.musculus   WDESTLELFLHELAVMDSNNFLGNCGVGEREGRVASALVARRHYR
SecS_X.tropical   WDESTIEIFLNELAVMDSNNFLGNCGVGEREGRVASGMVSRRHYR
SecS_D.rerio      WSESTIELFLNELAVMDSNNFLGNCGVGEREGRVASSLVARRHYR

cons                                                           


gi|199610358|gb   ----------------KAAGSSLLVQLANALAKDVLRLAGLRAVQ
SecS_M.musculus   FIHGIGRSGDISAVQPKAAGSSLLNKITNSLVLNVIKLAGVHSVA
SecS_X.tropical   LIHGIGRSGDISAIQPKAAGSSVLNKLTNSMVLDIIRLAGVRTAS
SecS_D.rerio      LIHGIGRSGDIAAVQPKAAGSSLLNKITNSVVLDVLKLTGVRSVS

cons                              ******:* :::*::. ::::*:*:::. 


gi|199610358|gb   AHWCCLXRLGCRYAGAAATEKDKTRG--ALRHL------------
SecS_M.musculus   SCF----------VVPMATGMSLTLCFLTLRHKRPKAKYIIWPRI
SecS_X.tropical   SCF----------VVPMATGMSLTLCFLTLRHKRPKAKYIIWPRI
SecS_D.rerio      SCF----------VVPMATGMSLTLCFLTLRHRRPKARYILWPRI

cons              : :          . . **  . *    :***             


gi|199610358|gb   ----------ASGRPEILFQGHFGGRTDATSAGKLFSRGRXSLWG
SecS_M.musculus   DQKSCFKSMVTAGFEPVVIENVLEG-------------------D
SecS_X.tropical   DQKSCFKSMITAGFEPVVIENVLEG-------------------D
SecS_D.rerio      DQKSCFKSMVTAGFEPVVIENVLEG-------------------D

cons                        ::*   ::::. : *                   .


gi|199610358|gb   VLKTDLVGMAALMDQYGSESILAVSSTTSCFAPRAYDAVKEIAQL
SecS_M.musculus   ELRTDLKAVEAKIQELGPEHILCLHSTTACFAPRVPDRLEELAVI
SecS_X.tropical   ELRTDLDAVEAKITELGAENILCVHSTTSCFAPRVPDRVEELAVI
SecS_D.rerio      ELRTNLEEVERKIEEFGAENTLCVHSTTSCFAPRVPDRLEELSVL

cons               *:*:*  :   : : *.*  *.: ***:*****. * ::*:: :


gi|199610358|gb   CQERNIAHVINNAYGVQASACVHQIDLAMRIGRVDAVVQSLDKNF
SecS_M.musculus   CANYDIPHVVNNAYGLQSSKCMHLIQQGARVGRIDAFVQSLDKNF
SecS_X.tropical   CKKYEIPHVVNNAYGVQSSKCMHLIQQGARVGRIDAFVQSLDKNF
SecS_D.rerio      CAKHDIPHIVNNAYGVQPSKCMHLIQQGARVGRIDAFVQSLDKNF

cons              * : :*.*::*****:*.* *:* *: . *:**:**.********


gi|199610358|gb   LVPVGGAIVCSTSSEIVDSVAKFYPGRASATPALDFFITMLQMGK
SecS_M.musculus   MVPVGGAIIAGFNEPFIQDISKMYPGRASASPSLDVLITLLSLGC
SecS_X.tropical   MVPVGGAVIAGFSDSFVQEISKMYPGRASASPSLDVLITLLSLGA
SecS_D.rerio      VVPVGGAIIAGFDENFIQEISKIYPGRASASPSLDVLITLLTLGA

cons              :******::.. .. :::.::*:*******:*:**.:**:* :* 


gi|199610358|gb   NGYRRLLEERKHLAAYMREKLEVLAAEEGEHVLKVSTNEVGTIEL
SecS_M.musculus   SGYRKLLKERKEMFVYLSTQLKKLAEAHNERLLQTPHNPISL-AM
SecS_X.tropical   SGYNKLLKERKEMFVYLSSELKKLAKELNERLLETPHNPISL-AL
SecS_D.rerio      NGYKKLLADRKELYGHLAQELSALAARHGERLLKTPHNPISL-AM

cons              .**.:** :**.:  ::  :*. **   .*::*:.. * :.   :


gi|199610358|gb   KVEDR-QEKSRRLTLLGAMLFSRGVCGARVVSCLDSKCIAGYEFD
SecS_M.musculus   TLKTIDGHHDKAVTQLGSMLFTRQVSGARAVPLGNVQTVSGHTFR
SecS_X.tropical   SLTSLSEQSGSAVTQLGSMLFTRQVSGARVVPLGTSQTINGYVFK
SecS_D.rerio      SLNHLEAHSSSAVTQLGSMLFTRQVSGARVVPLGVQQTVSGHTFS

cons              .:     . .  :* **:***:* *.***.*.    : : *: * 


gi|199610358|gb   SFGAHYDEFPVAYVTFACVLGMQKTEVDMLMTKLRKTIHDWRKKQ
SecS_M.musculus   GFMSHADNYPCAYLNAAAAIGMKMQDVDLFIKRLDKCLNIVRKEQ
SecS_X.tropical   GFMSHSNNYPCAYLNAASAICIKKQDVDMFIKRLDKCLRLCKKEK
SecS_D.rerio      GFMSHSEAYPCPYLNAASAIGITKGDVTVCMKRLGKCLKILKKEK

cons              .* :* : :* .*:. *..: :   :* : :.:* * :.  :*::


gi|199610358|gb   -----------------------------------------N
SecS_M.musculus   TRASVVSGADRNKAEDADIEEMALKLDDVL-GDVGQG--PAL
SecS_X.tropical   HLAKDEPRCAQQTTED-DVAELAQGLGDVLQGETASELLLSG
SecS_D.rerio      SDPADL------EAEDGELEESPQRS---------TE--LRV

cons