T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=96
*
 BAD AVG GOOD
*
supercontig_1.1   :  96
SecS_M.musculus   :  96
SecS_X.tropical   :  96
SecS_D.rerio      :  97
cons              :  96

supercontig_1.1   -----------LGNDAYIQQGADAIRTRQNLVKSLLAQRKWPELG
SecS_M.musculus   MNPESFAAGERRVSPAYVRQGCEARRAHEHLIRLLLEQGKCPEDG
SecS_X.tropical   MEHESFKASERLVTPAYIRQGREARRMHEQLVRQLVEQGKCPKEP
SecS_D.rerio      MNSENFRLSEKLVSASYVRQGLDARRGHEQLIRRLLDQGKCPEEG

cons                           . :*::** :* * :::*:: *: * * *:  


supercontig_1.1   WDEMSIELLLSDLAQMDSNNFPANIGAGEREARVYSDLVARRHFR
SecS_M.musculus   WDESTLELFLHELAVMDSNNFLGNCGVGEREGRVASALVARRHYR
SecS_X.tropical   WDESTIEIFLNELAVMDSNNFLGNCGVGEREGRVASGMVSRRHYR
SecS_D.rerio      WSESTIELFLNELAVMDSNNFLGNCGVGEREGRVASSLVARRHYR

cons              *.* ::*::* :** ****** .* *.****.** * :*:***:*


supercontig_1.1   MAHGIGRSGDIAAIQPKAAGSSLIMKLVNIMCLDVIRLAGVHAAN
SecS_M.musculus   FIHGIGRSGDISAVQPKAAGSSLLNKITNSLVLNVIKLAGVHSVA
SecS_X.tropical   LIHGIGRSGDISAIQPKAAGSSVLNKLTNSMVLDIIRLAGVRTAS
SecS_D.rerio      LIHGIGRSGDIAAVQPKAAGSSLLNKITNSVVLDVLKLTGVRSVS

cons              : *********:*:********:: *:.* : *::::*:**::. 


supercontig_1.1   ACIALPLATGMAMVMTLLTLAQTRPPSARKVLWLRIDQKSCIKAI
SecS_M.musculus   SCFVVPMATGMSLTLCFLTLRHKRP-KAKYIIWPRIDQKSCFKSM
SecS_X.tropical   SCFVVPMATGMSLTLCFLTLRHKRP-KAKYIIWPRIDQKSCFKSM
SecS_D.rerio      SCFVVPMATGMSLTLCFLTLRHRRP-KARYILWPRIDQKSCFKSM

cons              :*:.:*:****::.: :*** : ** .*: ::* *******:*::


supercontig_1.1   TACGFEVVVVDNAIEGDEVRTDLSALQHQVNTVGKDNILCIVSTT
SecS_M.musculus   VTAGFEPVVIENVLEGDELRTDLKAVEAKIQELGPEHILCLHSTT
SecS_X.tropical   ITAGFEPVVIENVLEGDELRTDLDAVEAKITELGAENILCVHSTT
SecS_D.rerio      VTAGFEPVVIENVLEGDELRTNLEEVERKIEEFGAENTLCVHSTT

cons               :.*** **::*.:****:**:*. :: ::  .* :: **: ***


supercontig_1.1   SCFAPRCPDRIVEIAKICATESIPHVINNAYGIQSSKITALIQDA
SecS_M.musculus   ACFAPRVPDRLEELAVICANYDIPHVVNNAYGLQSSKCMHLIQQG
SecS_X.tropical   SCFAPRVPDRVEELAVICKKYEIPHVVNNAYGVQSSKCMHLIQQG
SecS_D.rerio      SCFAPRVPDRLEELSVLCAKHDIPHIVNNAYGVQPSKCMHLIQQG

cons              :***** ***: *:: :* . .***::*****:*.**   ***:.


supercontig_1.1   HKAGRVDAFVQSSDKNLMVPVGGALVAGHDRAFIKRIGEMYPGRA
SecS_M.musculus   ARVGRIDAFVQSLDKNFMVPVGGAIIAGFNEPFIQDISKMYPGRA
SecS_X.tropical   ARVGRIDAFVQSLDKNFMVPVGGAVIAGFSDSFVQEISKMYPGRA
SecS_D.rerio      ARVGRIDAFVQSLDKNFVVPVGGAIIAGFDENFIQEISKIYPGRA

cons               :.**:****** ***::******::**..  *:: *.::*****


supercontig_1.1   SAAPSVDIFITLLSMGQQGFRSLLKQRKVVFEQLRAKLGAFAVSQ
SecS_M.musculus   SASPSLDVLITLLSLGCSGYRKLLKERKEMFVYLSTQLKKLAEAH
SecS_X.tropical   SASPSLDVLITLLSLGASGYNKLLKERKEMFVYLSSELKKLAKEL
SecS_D.rerio      SASPSLDVLITLLTLGANGYKKLLADRKELYGHLAQELSALAARH

cons              **:**:*::****::* .*:..** :** ::  *  :*  :*   


supercontig_1.1   GERLLETPHNPISLAIAIT-LST-FGSDATRLGSFLFTRCVSGTR
SecS_M.musculus   NERLLQTPHNPISLAMTLKTIDGHHDKAVTQLGSMLFTRQVSGAR
SecS_X.tropical   NERLLETPHNPISLALSLTSLSEQSGSAVTQLGSMLFTRQVSGAR
SecS_D.rerio      GERLLKTPHNPISLAMSLNHLEAHSSSAVTQLGSMLFTRQVSGAR

cons              .****:*********:::. :.   .. .*:***:**** ***:*


supercontig_1.1   CADRAAATTSVGPVSLSNFGAHHSAYHGAYLTAAAAIGMTEQEVD
SecS_M.musculus   AVPLGNVQTVSG-HTFRGFMSHADNYPCAYLNAAAAIGMKMQDVD
SecS_X.tropical   VVPLGTSQTING-YVFKGFMSHSNNYPCAYLNAASAICIKKQDVD
SecS_D.rerio      VVPLGVQQTVSG-HTFSGFMSHSEAYPCPYLNAASAIGITKGDVT

cons               .  .   *  *   : .* :* . *  .**.**:** :.  :* 


supercontig_1.1   ALIDRLTAAFKDLRAAMNQ--------------------------
SecS_M.musculus   LFIKRLDKCLNIVRKEQTRASVVSGADRNKAEDADIEEMALKLDD
SecS_X.tropical   MFIKRLDKCLRLCKKEKHLAKDEPRCAQQTTED-DVAELAQGLGD
SecS_D.rerio      VCMKRLGKCLKILKKEKSDPADL------EAEDGELEESPQR---

cons                :.**  .:.  :                               


supercontig_1.1   -------------P
SecS_M.musculus   VL-GDVGQG--PAL
SecS_X.tropical   VLQGETASELLLSG
SecS_D.rerio      --------STELRV

cons