T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=90
*
 BAD AVG GOOD
*
DI1_P.pallidum   :  77
DI1_G.gallus     :  93
DI1_H.sapiens    :  93
DI1_M.musculus   :  91
DI1_X.laevis     :  90
DI1_D.Rerio      :  91
cons             :  90

DI1_P.pallidum   ---------------------------------------------
DI1_G.gallus     ML--SIRVL-------LHKLLILLQVTLSVVVGKTMMILFPDTTK
DI1_H.sapiens    MGLPQPGLW-------LKRLWVLLEVAVHVVVGKVLLILFPDRVK
DI1_M.musculus   MGLPQLWLW-------LKRLVIFLQVALEVAVGKVLMTLFPGRVK
DI1_X.laevis     MESL-LQ-TIKLMLRYIQKALILFFLFLYVVVGKVLMFLFPQTMA
DI1_D.Rerio      MGSA-VGFALRKLFVYISAVLMVCAAILQMSMLKLLSFISPGRMR

cons                                                          


DI1_P.pallidum   ---------------------------------------------
DI1_G.gallus     RYILKLGEKSRMNQNPKFSYENWGPTFFSFQYLLFVLKVKWRRLE
DI1_H.sapiens    RNILAMGEKTGMTRNPHFSHDNWIPTFFSTQYFWFVLKVRWQRLE
DI1_M.musculus   QSILAMGQKTGMARNPRFAPDNWVPTFFSIQYFWFVLKVRWQRLE
DI1_X.laevis     SVLKSRFEISG-VHDPKFQYEDWGPTFFTYKFLRSVLEIMWMRLE
DI1_D.Rerio      KIHMKMGERSTMTQNPKFRYEDWGPAFFSLAFIKTLFFVNWCSLG

cons                                                          


DI1_P.pallidum   ------------------------------AKPVVLFCGSYTXPP
DI1_G.gallus     DEAHEGRPAPNTPVVALNGEMQHLFSFMRDNRPLILNFGSCTXPS
DI1_H.sapiens    DTTELGGLAPNCPVVRLSGQRCNIWEFMQGNRPLVLNFGSCTXPS
DI1_M.musculus   DRAEFGGLAPNCTVVCLSGQKCNIWDFIQGSRPLVLNFGSCTXPS
DI1_X.laevis     DEAFVGHSAPNTPVVDLSGELHHIWDYLQGTRPLVLSFGSCTXPP
DI1_D.Rerio      LEAFEGHAAPDSALITLDRQKTSVHRFLKGNRPLVLSFGSCTXPP

cons                                            :*::*  ** ***.


DI1_P.pallidum   FRDKMVMFQAIANEFAEYCQFYILYLAEMHPVDGWVIGGDE-I--
DI1_G.gallus     FMLKFDEFNKLVKDFSSIADFLIIYIEEAHAVDGWAFRNNVVIKN
DI1_H.sapiens    FMFKFDQFKRLIEDFSSIADFLVIYIEEAHASDGWAFKNNMDIRN
DI1_M.musculus   FLLKFDQFKRLV--FASTADFLIIYIEEAHATDGWAFKNNVDIRQ
DI1_X.laevis     FLFRLGEFNKLVNEFNSIADFLIIYIDEAHAADEWALKNNLHIKK
DI1_D.Rerio      FLYKLDEFKQLVKDFSNVADFLIVYLAEAHATDAWAFKNNVDISV

cons             *  ::  *: :   * . .:* ::*: * *. * *.: .:  *  


DI1_P.pallidum   STSLQIXQRLNIVKALQEYSPVTIPYLVDLIDNGFNAKYDAIPER
DI1_G.gallus     HRSLE--DRKTAAQFLQQKNPL-CPVVLDTMENLSSSKYAALPER
DI1_H.sapiens    HQNLQ--DRLQAAHLLLARSPQ-CPVVVDTMQNQSSQLYAALPER
DI1_M.musculus   HRSLQ--ERVRAARMLLARSPQ-CPVVVDTMQNQSSQLYAALPER
DI1_X.laevis     HRSLQ--DRLAAAKRLMEESPS-CPVVLDTMSNLCSAKYAALPER
DI1_D.Rerio      HKNLE--ERLAAARTLLKEDPP-CPVVVDEMNNITASKYGALPER

cons               .*:  :*   .: *   .*   * ::* :.*     * *:***


DI1_P.pallidum   LFVLENKKFSYVGGPGPFKFIPEELKEYLTKRAKPIVLYCGSFTC
DI1_G.gallus     LYILQAGNVIYKGGVGPWNYHPQEIRAVLEKL-------------
DI1_H.sapiens    LYIIQEGRILYKGKSGPWNYNPEEVRAVLEKL-------------
DI1_M.musculus   LYVIQEGRICYKGKAGPWNYNPEEVRAVLEKLCT-----------
DI1_X.laevis     LYILQEGKIIYKGKMGPWGYKPEEVCSVLEKK-------------
DI1_D.Rerio      LYVIQSGKVIYQGGIGPWGYKPEEVRKVLEKS-------------

cons             *::::  .. * *  **: : *:*:   * *              


DI1_P.pallidum   IPFRNKLQLIQAIANEFAEYCDFYIVYTAEVHTADGWIIGGDEIS
DI1_G.gallus     ---------------------------------------------
DI1_H.sapiens    ---------------------------------------------
DI1_M.musculus   -PPRHV---------------------------------------
DI1_X.laevis     ---------------------------------------------
DI1_D.Rerio      ---------------------------------------------

cons                                                          


DI1_P.pallidum   TAHKQPKTRLKIVEALQKFSPVSIPYLVDLIDNNFNEKYDNTPLR
DI1_G.gallus     ---------------------------------------------
DI1_H.sapiens    ---------------------------------------------
DI1_M.musculus   ---------------------------------------------
DI1_X.laevis     ---------------------------------------------
DI1_D.Rerio      ---------------------------------------------

cons                                                          


DI1_P.pallidum   LFVLENKKFSYVGKQGSWNYK
DI1_G.gallus     --------------------K
DI1_H.sapiens    -------------------HS
DI1_M.musculus   ------------------PQL
DI1_X.laevis     --------------------K
DI1_D.Rerio      --------------------K

cons