Breve introducción a nuestro trabajo



Los protistas, organismos eucarióticos objetivo de nuestro trabajo Una selenocisteína es un esqueleto de cisteína con un átomo de selenio en lugar de azufre Las regiones SECIS presentan secuencias comunes en regiones determinadas La traducción del codón UGA cambia con la presencia de SECIS Una selenoproteína es aquella proteína con una selenocisteína en su cadena de aminoácidos

Resumen

En esta página presentamos un trabajo de investigación en el que nuestro grupo se ha encargado de buscar la presencia de las selenoproteínas dsba y SelI en los genomas de protistas secuenciados recientemente.

Se conoce como selenoproteínas aquellas proteínas que contienen selenocisteína, un aminiácido de estructura similar a la cisteína que presenta un átomo de selenio en lugar de sulfuro. También conocida como el aminoácido 21, la selenocisteína está codificada por el codón UGA, usualmente identificado como codón STOP y que requiere de unos factores especiales para poder transcribir este aminoácido. Esto presenta una serie de problemas, debido a que es malinterpretado comúnmente por las plataformas informáticas, que le otorgan su valor clásico de STOP. Así, el contaje de estas proteínas es bastante reducido, poco exhaustivo, y en múltiples organismos no se ha dado siquiera. Esto, sumado a la crecente cantidad de genomas secuenciados, hacen que el trabajo que queda por delante sea considerable.

El objetivo de este trabajo reside en buscar la presencia de dos familias de selenoproteínas, las famílias dsba y SelI, y sus homólogos en cisteína, en los genomas recientemente secuenciados de una serie de organismos protistas mediante el uso de diversas herramientas bioinformáticas como las bases de datos de secuencias o la programación.

Abstract

In this page we present the results obtained in an research study on which our group has taken on the scouting of the selenoproteins dsba and SelI in the recently sequenced genome of diverse protists.

Selenoproteins are those proteins that contain selenocisteins, aminoacid whose structure resembles that of normal cisteins, but presents a selenium atom instead of sulfur. Also known as the 21st aminoacid, selenocisteins are coded by the UGA codon; usually a STOP codon, it requieres the presence of a series of factors and special mechanisms to translate for our aminoacid. This arouses a series of issues, as it is commonly mistaken by informatic platforms for its classic STOP value. Thereby, the countage of these proteins is somewhat scarce, not very exhaustive, and in multiple organisms hasn't even take place yet. This, added to the constantly increasing quantity of sequenced genomes, make the work that lies ahead somewhat considerable.

The objective of this study is to identify the presence of two selenoprotein families, the dsba and SelI families, and their cistein homologous, in a series of recently sequenced protists organisms' genomes through the use of diverse bioinformatic tools such as sequence databases and programming..