T-COFFEE, Version_8.99(Thu Feb 17 19:24:49 CET 2011 - Revision 594)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=99
*
 BAD AVG GOOD
*
gi|199611737|gb   :  99
gi|199611737|gb   :  99
gi|199611737|gb   :  99
gi|199611737|gb   :  99
gi|199611737|gb   :  99
cons              :  99

gi|199611737|gb       1 ------SYDYDLVVIGGGSGGLACSKEAASFGK   27 
gi|199611737|gb       1 --------DYDLVVIGGGSGGLACSKEAASFGK   25 
gi|199611737|gb       1 VVEDDASYDYDLVVIGGGSGGLACSKEAASFGK   33 
gi|199611737|gb       1 ------SYDYDLVVIGGGSGGLACSKEAASFGK   27 
gi|199611737|gb       1 --EDDASYDYDLVVIGGGSGGLACSKEAASFGK   31 

cons                  1         *************************   33 


gi|199611737|gb      28 KVCVLDYVKPSPHGTSWGLGGTCVNVGCIPKKL   60 
gi|199611737|gb      26 KVCVLDYVKPSPHGTSWGLGGTCVNVGCIPKKL   58 
gi|199611737|gb      34 KVCVLDYVKPSPHGTSWGLGGTCVNVGCIPKKL   66 
gi|199611737|gb      28 KVCVLDYVKPSPHGTSWGLGGTCVNVGCIPKKL   60 
gi|199611737|gb      32 KVCVLDYVKPSPHGTSWGLGGTCVNVGCIPKKL   64 

cons                 34 *********************************   66 


gi|199611737|gb      61 MHQSSLIGEILHHDCASFGWNVGSVNGQVPTFD   93 
gi|199611737|gb      59 MHQSSLIGEILHHDCASFGWNVGSVNGQVPTFD   91 
gi|199611737|gb      67 MHQSSLIGEILHHDCASFGWNVGSVNGQVPTFD   99 
gi|199611737|gb      61 MHQSSLIGEILHHDCASFGWNVGSVNGQVPTFD   93 
gi|199611737|gb      65 MHQSSLIGEILHHDCASFGWNVGSVNGQVPTFD   97 

cons                 67 *********************************   99 


gi|199611737|gb      94 WKQLVSNVSSYIKSISFKYKVELRSKQVKYENV  126 
gi|199611737|gb      92 WKQLVSNVSSYIKSISFKYKVELRSKQVKYENV  124 
gi|199611737|gb     100 WKQLVSNVSSYIKSISFKYKVELRSKQVKYENV  132 
gi|199611737|gb      94 WKQLVSNVSSYIKSISFKYKVELRSKQVKYENV  126 
gi|199611737|gb      98 WKQLVSNVSSYIKSISFKYKVELRSKQVKYENV  130 

cons                100 *********************************  132 


gi|199611737|gb     127 LGSFVDPHTLKLWHPKKGTKEITTRHVVIAVGG  159 
gi|199611737|gb     125 LGSFVDPHTLKLWHPKKGTKEITTRHVVIAVGG  157 
gi|199611737|gb     133 LGSFVDPHTLKLWHPKKGTKEITTRHVVIAVGG  165 
gi|199611737|gb     127 LGSFVDPHTLKLWHPKKGTKEITTRHVVIAVGG  159 
gi|199611737|gb     131 LGSFVDPHTLKLWHPKKGTKEITTRHVVIAVGG  163 

cons                133 *********************************  165 


gi|199611737|gb     160 RPRQLACLGGELAVSSDDIFWMKQKEPGKTLVV  192 
gi|199611737|gb     158 RPRQLACLGGELAVSSDDIFWMKQKEPGKTLVV  190 
gi|199611737|gb     166 RPRQLACLGGELAVSSDDIFWMKQKEPGKTLVV  198 
gi|199611737|gb     160 RPRQLACLGGELAVSSDDIFWMKQKEPGKTLVV  192 
gi|199611737|gb     164 RPRQLACLGGELAVSSDDIFWMKQKEPGKTLVV  196 

cons                166 *********************************  198 


gi|199611737|gb     193 GASYVALECAGFLKGMGYAVKVMVRSILLRGFD  225 
gi|199611737|gb     191 GASYVALECAGFLKGMGYAVKVMVRSILLRGFD  223 
gi|199611737|gb     199 GASYVALECAGFLKGMGYAVKVMVRSILLRGFD  231 
gi|199611737|gb     193 GASYVALECAGFLKGMGYAVKVMVRSILLRGFD  225 
gi|199611737|gb     197 GASYVALECAGFLKGMGYAVKVMVRSILLRGFD  229 

cons                199 *********************************  231 


gi|199611737|gb     226 QDMASKIGEYMEMQSGIEFIRKTVPQSITKLDS  258 
gi|199611737|gb     224 QDMASKIGEYMEMQSGIEFIRKTVPQSITKLDS  256 
gi|199611737|gb     232 QDMASKIGEYMEMQSGIEFIRKTVPQSITKLDS  264 
gi|199611737|gb     226 QDMASKIGEYMEMQSGIEFIRKTVPQSITKLDS  258 
gi|199611737|gb     230 QDMASKIGEYMEMQSGIEFIRKTVPQSITKLDS  262 

cons                232 *********************************  264 


gi|199611737|gb     259 GQLLVKWITEDGDCFEETFDTVLNATGRDPDVA  291 
gi|199611737|gb     257 GQLLVKWITEDGDCFEETFDTVLNATGRDPDVA  289 
gi|199611737|gb     265 GQLLVKWITEDGDCFEETFDTVLNATGRDPDVA  297 
gi|199611737|gb     259 GQLLVKWITEDGDCFEETFDTVLNATGRDPDVA  291 
gi|199611737|gb     263 GQLLVKWITEDGDCFEETFDTVLNATGRDPDVA  295 

cons                265 *********************************  297 


gi|199611737|gb     292 KLGLDEAGVKLNEKTGRIWVNNEQTTTPNVYAI  324 
gi|199611737|gb     290 KLGLDEAGVKLNEKTGRIWVNNEQTTTPNVYAI  322 
gi|199611737|gb     298 KLGLDEAGVKLNEKTGRIWVNNEQTTTPNVYAI  330 
gi|199611737|gb     292 KLGLDEAGVKLNEKTGRIWVNNEQTTTPNVYAI  324 
gi|199611737|gb     296 KLGLDEAGVKLNEKTGRIWVNNEQTTTPNVYAI  328 

cons                298 *********************************  330 


gi|199611737|gb     325 GDVIDAPELTPVAIQAGRLLSRRLYNEGTVQMD  357 
gi|199611737|gb     323 GDVIDAPELTPVAIQAGRLLSRRLYNEGTVQMD  355 
gi|199611737|gb     331 GDVIDAPELTPVAIQAGRLLSRRLYNEGTVQMD  363 
gi|199611737|gb     325 GDVIDAPELTPVAIQAGRLLSRRLYNEGTVQMD  357 
gi|199611737|gb     329 GDVIDAPELTPVAIQAGRLLSRRLYNEGTVQMD  361 

cons                331 *********************************  363 


gi|199611737|gb     358 YDKICTAVFTPIEYGCCGLSEEDSKEEYGDDSV  390 
gi|199611737|gb     356 YDKICTAVFTPIEYGCCGLSEEDSKEEYGDDSV  388 
gi|199611737|gb     364 YDKICTAVFTPIEYGCCGLSEEDSKEEYGDDSV  396 
gi|199611737|gb     358 YDKICTAVFTPIEYGCCGLSEEDSKEEYGDDSV  390 
gi|199611737|gb     362 YDKICTAVFTPIEYGCCGLSEEDSKEEYGDDSV  394 

cons                364 *********************************  396 


gi|199611737|gb     391 EVYHKNFVPLEWSLAEQTRIAAESCYVKVVCDK  423 
gi|199611737|gb     389 EVYHKNFVPLEWSLAEQTRIAAESCYVKVVCDK  421 
gi|199611737|gb     397 EVYHKNFVPLEWSLAEQTRIAAESCYVKVVCDK  429 
gi|199611737|gb     391 EVYHKNFVPLEWSLAEQTRIAAESCYVKVVCDK  423 
gi|199611737|gb     395 EVYHKNFVPLEWSLAEQTRIAAESCYVKVVCDK  427 

cons                397 *********************************  429 


gi|199611737|gb     424 TRNNFVLGFHYLGPNAGEVTQAMGLAMKLGFTY  456 
gi|199611737|gb     422 TRNNFVLGFHYLGPNAGEVTQAMGLAMKLGFTY  454 
gi|199611737|gb     430 TRNNFVLGFHYLGPNAGEVTQAMGLAMKLGFTY  462 
gi|199611737|gb     424 TRNNFVLGFHYLGPNAGEVTQAMGLAMKLGFTY  456 
gi|199611737|gb     428 TRNNFVLGFHYLGPNAGEVTQAMGLAMKLGFTY  460 

cons                430 *********************************  462 


gi|199611737|gb     457 DQLVDTVGIHPTTAEAFTTLETTKSSGDSTTGG  489 
gi|199611737|gb     455 DQLVDTVGIHPTTAEAFTTLETTKSSGDSTTGG  487 
gi|199611737|gb     463 DQLVDTVGIHPTTAEAFTTLETTKSSGDSTTGG  495 
gi|199611737|gb     457 DQLVDTVGIHPTTAEAFTTLETTKSSGDSTTGG  489 
gi|199611737|gb     461 DQLVDTVGIHPTTAEAFTTLETTKSSGDSTTGG  493 

cons                463 *********************************  495 


gi|199611737|gb     490 GCXG  493 
gi|199611737|gb     488 GCXG  491 
gi|199611737|gb     496 GCXG  499 
gi|199611737|gb     490 GCXG  493 
gi|199611737|gb     494 GCXG  497 

cons                496 ****  499