T-COFFEE, Version_8.99(Tue Jan 25 16:00:40 CET 2011)
Cedric Notredame 
CPU TIME:1 sec.
SCORE=99
*
 BAD AVG GOOD
*
supercontig_1.2   :  99
supercontig_1.2   :  99
supercontig_1.2   :  99
supercontig_1.2   :  99
supercontig_1.2   :  99
cons              :  99

supercontig_1.2       1 ---GYDYDLIVVGGGSGGLALSKQAAKLGKRVC   30 
supercontig_1.2       1 -----DYDLIVVGGGSGGLALSKQAAKLGKRVC   28 
supercontig_1.2       1 ---GYDYDLIVVGGGSGGLALSKQAAKLGKRVC   30 
supercontig_1.2       1 ---GYDYDLIVVGGGSGGLALSKQAAKLGKRVC   30 
supercontig_1.2       1 STTGYDYDLIVVGGGSGGLALSKQAAKLGKRVC   33 

cons                  1      ****************************   33 


supercontig_1.2      31 VLDFVKPSPQGSTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQ   63 
supercontig_1.2      29 VLDFVKPSPQGSTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQ   61 
supercontig_1.2      31 VLDFVKPSPQGSTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQ   63 
supercontig_1.2      31 VLDFVKPSPQGSTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQ   63 
supercontig_1.2      34 VLDFVKPSPQGSTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQ   66 

cons                 34 *********************************   66 


supercontig_1.2      64 ACLLGEAIEDAEKFGWEVEKANIKHDWSKLVMG   96 
supercontig_1.2      62 ACLLGEAIEDAEKFGWEVEKANIKHDWSKLVMG   94 
supercontig_1.2      64 ACLLGEAIEDAEKFGWEVEKANIKHDWSKLVMG   96 
supercontig_1.2      64 ACLLGEAIEDAEKFGWEVEKANIKHDWSKLVMG   96 
supercontig_1.2      67 ACLLGEAIEDAEKFGWEVEKANIKHDWSKLVMG   99 

cons                 67 *********************************   99 


supercontig_1.2      97 VSDHIGGLNFAYRVSLRENNVTYLNAYGVFKDA  129 
supercontig_1.2      95 VSDHIGGLNFAYRVSLRENNVTYLNAYGVFKDA  127 
supercontig_1.2      97 VSDHIGGLNFAYRVSLRENNVTYLNAYGVFKDA  129 
supercontig_1.2      97 VSDHIGGLNFAYRVSLRENNVTYLNAYGVFKDA  129 
supercontig_1.2     100 VSDHIGGLNFAYRVSLRENNVTYLNAYGVFKDA  132 

cons                100 *********************************  132 


supercontig_1.2     130 HTIECTDKKRKVTTLTAEHFVLAVGGRPKYPDI  162 
supercontig_1.2     128 HTIECTDKKRKVTTLTAEHFVLAVGGRPKYPDI  160 
supercontig_1.2     130 HTIECTDKKRKVTTLTAEHFVLAVGGRPKYPDI  162 
supercontig_1.2     130 HTIECTDKKRKVTTLTAEHFVLAVGGRPKYPDI  162 
supercontig_1.2     133 HTIECTDKKRKVTTLTAEHFVLAVGGRPKYPDI  165 

cons                133 *********************************  165 


supercontig_1.2     163 PGARELGITSDDMFSLPYAPGKTLVVGASYVAL  195 
supercontig_1.2     161 PGARELGITSDDMFSLPYAPGKTLVVGASYVAL  193 
supercontig_1.2     163 PGARELGITSDDMFSLPYAPGKTLVVGASYVAL  195 
supercontig_1.2     163 PGARELGITSDDMFSLPYAPGKTLVVGASYVAL  195 
supercontig_1.2     166 PGARELGITSDDMFSLPYAPGKTLVVGASYVAL  198 

cons                166 *********************************  198 


supercontig_1.2     196 ECAGFLTGLGYDTTVMARSIFLRGFDQQCAEQI  228 
supercontig_1.2     194 ECAGFLTGLGYDTTVMARSIFLRGFDQQCAEQI  226 
supercontig_1.2     196 ECAGFLTGLGYDTTVMARSIFLRGFDQQCAEQI  228 
supercontig_1.2     196 ECAGFLTGLGYDTTVMARSIFLRGFDQQCAEQI  228 
supercontig_1.2     199 ECAGFLTGLGYDTTVMARSIFLRGFDQQCAEQI  231 

cons                199 *********************************  231 


supercontig_1.2     229 AAYMSEHGTKFLRRCVPLSLERIE---------  252 
supercontig_1.2     227 AAYMSEHGTKFLRRCVPLSLERIR---------  250 
supercontig_1.2     229 AAYMSEHGTKFLRRCVPLSLERIEPEADSATGR  261 
supercontig_1.2     229 AAYMSEHGTKFLRRCVPLSLER-----------  250 
supercontig_1.2     232 AAYMSEHGTKFLRRCVPLSLERIE---------  255 

cons                232 **********************             264 


supercontig_1.2     253 -------------------FDTVLFAIGREAVT  266 
supercontig_1.2     251 --IRVTWEDGLANEPGSDVFDTVLFAIGREAVT  281 
supercontig_1.2     262 HRIRVTWEDGLANEPGSDVFDTVLFAIGREAVT  294 
supercontig_1.2     251 ---------------GSDVFDTVLFAIGREAVT  268 
supercontig_1.2     256 ------------NEPGSDVFDTVLFAIGREAVT  276 

cons                265                    **************  297 


supercontig_1.2     267 STIGLEALGLKANASGKVDAPLEQTSVPNVFAI  299 
supercontig_1.2     282 STIGLEALGLKANASGKVDAPLEQTSVPNVFAI  314 
supercontig_1.2     295 STIGLEALGLKANASGKVDAPLEQTSVPNVFAI  327 
supercontig_1.2     269 STIGLEALGLKANASGKVDAPLEQTSVPNVFAI  301 
supercontig_1.2     277 STIGLEALGLKANASGKVDAPLEQTSVPNVFAI  309 

cons                298 *********************************  330 


supercontig_1.2     300 GDVINGRPELTPVAIQAGRLLAKRLYGGATTQM  332 
supercontig_1.2     315 GDVINGRPELTPVAIQAGRLLAKRLYGGATTQM  347 
supercontig_1.2     328 GDVINGRPELTPVAIQAGRLLAKRLYGGATTQM  360 
supercontig_1.2     302 GDVINGRPELTPVAIQAGRLLAKRLYGGATTQM  334 
supercontig_1.2     310 GDVINGRPELTPVAIQAGRLLAKRLYGGATTQM  342 

cons                331 *********************************  363 


supercontig_1.2     333 DYANIPTTVFTPLEYGCIGMAEEDAIALYKEEN  365 
supercontig_1.2     348 DYANIPTTVFTPLEYGCIGMAEEDAIALYKEEN  380 
supercontig_1.2     361 DYANIPTTVFTPLEYGCIGMAEEDAIALYKEEN  393 
supercontig_1.2     335 DYANIPTTVFTPLEYGCIGMAEEDAIALYKEEN  367 
supercontig_1.2     343 DYANIPTTVFTPLEYGCIGMAEEDAIALYKEEN  375 

cons                364 *********************************  396 


supercontig_1.2     366 IEVFHQYFQPLEWTVAHRPASTCYCKLICNKLD  398 
supercontig_1.2     381 IEVFHQYFQPLEWTVAHRPASTCYCKLICNKLD  413 
supercontig_1.2     394 IEVFHQYFQPLEWTVAHRPASTCYCKLICNKLD  426 
supercontig_1.2     368 IEVFHQYFQPLEWTVAHRPASTCYCKLICNKLD  400 
supercontig_1.2     376 IEVFHQYFQPLEWTVAHRPASTCYCKLICNKLD  408 

cons                397 *********************************  429 


supercontig_1.2     399 NMRVIGLHILGPNAGEITQGYGVAFRLGATKDD  431 
supercontig_1.2     414 NMRVIGLHILGPNAGEITQGYGVAFRLGATKDD  446 
supercontig_1.2     427 NMRVIGLHILGPNAGEITQGYGVAFRLGATKDD  459 
supercontig_1.2     401 NMRVIGLHILGPNAGEITQGYGVAFRLGATKDD  433 
supercontig_1.2     409 NMRVIGLHILGPNAGEITQGYGVAFRLGATKDD  441 

cons                430 *********************************  462 


supercontig_1.2     432 FDMTVGIHPTCSENFTTLDITRASGLDPGAKGC  464 
supercontig_1.2     447 FDMTVGIHPTCSENFTTLDITRASGLDPGAKGC  479 
supercontig_1.2     460 FDMTVGIHPTCSENFTTLDITRASGLDPGAKGC  492 
supercontig_1.2     434 FDMTVGIHPTCSENFTTLDITRASGLDPGAKGC  466 
supercontig_1.2     442 FDMTVGIHPTCSENFTTLDITRASGLDPGAKGC  474 

cons                463 *********************************  495 


supercontig_1.2     465 XG  466 
supercontig_1.2     480 XG  481 
supercontig_1.2     493 XG  494 
supercontig_1.2     467 XG  468 
supercontig_1.2     475 XG  476 

cons                496 **  497