T-COFFEE, Version_8.99(Tue Jan 25 16:00:40 CET 2011)
Cedric Notredame 
CPU TIME:8 sec.
SCORE=99
*
 BAD AVG GOOD
*
gi|300122766|em   :  99
gi|300122766|em   :  99
gi|300122766|em   :  99
gi|300122766|em   :  99
gi|300122766|em   :  99
gi|300123462|em   :  99
gi|300123462|em   :  99
gi|300123462|em   :  99
gi|300123462|em   :  99
gi|300123462|em   :  99
cons              :  99

gi|300122766|em       1 ---------------------DDGKTTYDYDLI   12 
gi|300122766|em       1 ----------------------------DYDLI    5 
gi|300122766|em       1 --------------------------TYDYDLI    7 
gi|300122766|em       1 ---------------------------YDYDLI    6 
gi|300122766|em       1 ---------------------DDGKTTYDYDLI   12 
gi|300123462|em       1 ---------------------DDGKTTYDYDLI   12 
gi|300123462|em       1 ----------------------------DYDLI    5 
gi|300123462|em       1 HAGGCDHLLLLIMSLTYQEDIDDGKTTYDYDLI   33 
gi|300123462|em       1 ---------------------------YDYDLI    6 
gi|300123462|em       1 ---------------------DDGKTTYDYDLI   12 

cons                  1                             *****   33 


gi|300122766|em      13 VIGGGSGGLAASKEAADLGATVALFDYVKPSPQ   45 
gi|300122766|em       6 VIGGGSGGLAASKEAADLGATVALFDYVKPSPQ   38 
gi|300122766|em       8 VIGGGSGGLAASKEAADLGATVALFDYVKPSPQ   40 
gi|300122766|em       7 VIGGGSGGLAASKEAADLGATVALFDYVKPSPQ   39 
gi|300122766|em      13 VIGGGSGGLAASKEAADLGATVALFDYVKPSPQ   45 
gi|300123462|em      13 VIGGGSGGLAASKEAADLGATVALFDYVKPSPQ   45 
gi|300123462|em       6 VIGGGSGGLAASKEAADLGATVALFDYVKPSPQ   38 
gi|300123462|em      34 VIGGGSGGLAASKEAADLGATVALFDYVKPSPQ   66 
gi|300123462|em       7 VIGGGSGGLAASKEAADLGATVALFDYVKPSPQ   39 
gi|300123462|em      13 VIGGGSGGLAASKEAADLGATVALFDYVKPSPQ   45 

cons                 34 *********************************   66 


gi|300122766|em      46 GSTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAAIIGEFVRD   78 
gi|300122766|em      39 GSTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAAIIGEFVRD   71 
gi|300122766|em      41 GSTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAAIIGEFVRD   73 
gi|300122766|em      40 GSTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAAIIGEFVRD   72 
gi|300122766|em      46 GSTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAAIIGEFVRD   78 
gi|300123462|em      46 GSTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAAIIGEFVRD   78 
gi|300123462|em      39 GSTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAAIIGEFVRD   71 
gi|300123462|em      67 GSTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAAIIGEFVRD   99 
gi|300123462|em      40 GSTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAAIIGEFVRD   72 
gi|300123462|em      46 GSTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAAIIGEFVRD   78 

cons                 67 *********************************   99 


gi|300122766|em      79 ASSFGWDVPEVHHHWNTLVDNVQDYIRGLNYNY  111 
gi|300122766|em      72 ASSFGWDVPEVHHHWNTLVDNVQDYIRGLNYNY  104 
gi|300122766|em      74 ASSFGWDVPEVHHHWNTLVDNVQDYIRGLNYNY  106 
gi|300122766|em      73 ASSFGWDVPEVHHHWNTLVDNVQDYIRGLNYNY  105 
gi|300122766|em      79 ASSFGWDV------WNTLVDNVQDYIRGLNYNY  105 
gi|300123462|em      79 ASSFGWDVPEVHHHWNTLVDNVQDYIRGLNYNY  111 
gi|300123462|em      72 ASSFGWDVPEVHHHWNTLVDNVQDYIRGLNYNY  104 
gi|300123462|em     100 ASSFGWDVPEVHHHWNTLVDNVQDYIRGLNYNY  132 
gi|300123462|em      73 ASSFGWDVPEVHHHWNTLVDNVQDYIRGLNYNY  105 
gi|300123462|em      79 ASSFGWDV------WNTLVDNVQDYIRGLNYNY  105 

cons                100 ********      *******************  132 


gi|300122766|em     112 RVSLMSKHVTYYNQLAYVKDAHTVEGTDVFGDK  144 
gi|300122766|em     105 RVSLMSKHVTYYNQLAYVKDAHTVEGTDVFGDK  137 
gi|300122766|em     107 RVSLMSKHVTYYNQLAYVKDAHTVEGTDVFGDK  139 
gi|300122766|em     106 RVSLMSKHVTYYNQLAYVKDAHTVEGTDVFGDK  138 
gi|300122766|em     106 RVSLMSKHVTYYNQLAYVKDAHTVEGTDVFGDK  138 
gi|300123462|em     112 RVSLMSKHVTYYNQLAYVKDAHTVEGTDVFGDK  144 
gi|300123462|em     105 RVSLMSKHVTYYNQLAYVKDAHTVEGTDVFGDK  137 
gi|300123462|em     133 RVSLMSKHVTYYNQLAYVKDAHTVEGTDVFGDK  165 
gi|300123462|em     106 RVSLMSKHVTYYNQLAYVKDAHTVEGTDVFGDK  138 
gi|300123462|em     106 RVSLMSKHVTYYNQLAYVKDAHTVEGTDVFGDK  138 

cons                133 *********************************  165 


gi|300122766|em     145 HIYTCRRIIVAVGGRPNKLGCPGEELAVTSDDL  177 
gi|300122766|em     138 HIYTCRRIIVAVGGRPNKLGCPGEELAVTSDDL  170 
gi|300122766|em     140 HIYTCRRIIVAVGGRPNKLGCPGEELAVTSDDL  172 
gi|300122766|em     139 HIYTCRRIIVAVGGRPNKLGCPGEELAVTSDDL  171 
gi|300122766|em     139 HIYTCRRIIVAVGGRPNKLGCPGEELAVTSDDL  171 
gi|300123462|em     145 HIYTCRRIIVAVGGRPNKLGCPGEELAVTSDDL  177 
gi|300123462|em     138 HIYTCRRIIVAVGGRPNKLGCPGEELAVTSDDL  170 
gi|300123462|em     166 HIYTCRRIIVAVGGRPNKLGCPGEELAVTSDDL  198 
gi|300123462|em     139 HIYTCRRIIVAVGGRPNKLGCPGEELAVTSDDL  171 
gi|300123462|em     139 HIYTCRRIIVAVGGRPNKLGCPGEELAVTSDDL  171 

cons                166 *********************************  198 


gi|300122766|em     178 FMLDHPPKKTLLVGASFIALECAGFLHHLGFDV  210 
gi|300122766|em     171 FMLDHPPKKTLLVGASFIALECAGFLHHLGFDV  203 
gi|300122766|em     173 FMLDHPPKKTLLVGASFIALECAGFLHHLGFDV  205 
gi|300122766|em     172 FMLDHPPKKTLLVGASFIALECAGFLHHLGFDV  204 
gi|300122766|em     172 FMLDHPPKKTLLVGASFIALECAGFLHHLGFDV  204 
gi|300123462|em     178 FMLDHPPKKTLLVGASFIALECAGFLHHLGFDV  210 
gi|300123462|em     171 FMLDHPPKKTLLVGASFIALECAGFLHHLGFDV  203 
gi|300123462|em     199 FMLDHPPKKTLLVGASFIALECAGFLHHLGFDV  231 
gi|300123462|em     172 FMLDHPPKKTLLVGASFIALECAGFLHHLGFDV  204 
gi|300123462|em     172 FMLDHPPKKTLLVGASFIALECAGFLHHLGFDV  204 

cons                199 *********************************  231 


gi|300122766|em     211 TVMVRSILLRGFDQECANKIGDFMKEEGIHFLH  243 
gi|300122766|em     204 TVMVRSILLRGFDQECANKIGDFMKEEGIHFLH  236 
gi|300122766|em     206 TVMVRSILLRGFDQECANKIGDFMKEEGIHFLH  238 
gi|300122766|em     205 TVMVRSILLRGFDQECANKIGDFMKEEGIHFLH  237 
gi|300122766|em     205 TVMVRSILLRGFDQECANKIGDFMKEEGIHFLH  237 
gi|300123462|em     211 TVMVRSILLRGFDQECANKIGDFMKEEGIHFLH  243 
gi|300123462|em     204 TVMVRSILLRGFDQECANKIGDFMKEEGIHFLH  236 
gi|300123462|em     232 TVMVRSILLRGFDQECANKIGDFMKEEGIHFLH  264 
gi|300123462|em     205 TVMVRSILLRGFDQECANKIGDFMKEEGIHFLH  237 
gi|300123462|em     205 TVMVRSILLRGFDQECANKIGDFMKEEGIHFLH  237 

cons                232 *********************************  264 


gi|300122766|em     244 NTVPTELQRLPNGRILVKYQGSGFANSELRGEE  276 
gi|300122766|em     237 NTVPTELQRLPNGRILVKYQGSGFANSELRGEE  269 
gi|300122766|em     239 NTVPTELQRLPNGRILVKYQGSGFANSELRGEE  271 
gi|300122766|em     238 NTVPTELQRLPNGRILVKYQGSGFANSELRGEE  270 
gi|300122766|em     238 NTVPTELQRLPNGRILVKYQGSGFANSELRGEE  270 
gi|300123462|em     244 NTVPTELQRLPNGRILVKYQGSGFANSELRGEE  276 
gi|300123462|em     237 NTVPTELQRLPNGRILVKYQGSGFANSELRGEE  269 
gi|300123462|em     265 NTVPTELQRLPNGRILVKYQGSGFANSELRGEE  297 
gi|300123462|em     238 NTVPTELQRLPNGRILVKYQGSGFANSELRGEE  270 
gi|300123462|em     238 NTVPTELQRLPNGRILVKYQGSGFANSELRGEE  270 

cons                265 *********************************  297 


gi|300122766|em     277 EFDTVVSCIGRYADTERLGLDQLGVKTRRGKIL  309 
gi|300122766|em     270 EFDTVVSCIGRYADTERLGLDQLGVKTRRGKIL  302 
gi|300122766|em     272 EFDTVVSCIGRYADTERLGLDQLGVKTRRGKIL  304 
gi|300122766|em     271 EFDTVVSCIGRYADTERLGLDQLGVKTRRGKIL  303 
gi|300122766|em     271 EFDTVVSCIGRYADTERLGLDQLGVKTRRGKIL  303 
gi|300123462|em     277 EFDTVVSCIGRYADTERLGLDQLGVKTRRGKIL  309 
gi|300123462|em     270 EFDTVVSCIGRYADTERLGLDQLGVKTRRGKIL  302 
gi|300123462|em     298 EFDTVVSCIGRYADTERLGLDQLGVKTRRGKIL  330 
gi|300123462|em     271 EFDTVVSCIGRYADTERLGLDQLGVKTRRGKIL  303 
gi|300123462|em     271 EFDTVVSCIGRYADTERLGLDQLGVKTRRGKIL  303 

cons                298 *********************************  330 


gi|300122766|em     310 SVQEQTSVPNIYGIGDVLYGKQELTPVAIQTGK  342 
gi|300122766|em     303 SVQEQTSVPNIYGIGDVLYGKQELTPVAIQTGK  335 
gi|300122766|em     305 SVQEQTSVPNIYGIGDVLYGKQELTPVAIQTGK  337 
gi|300122766|em     304 SVQEQTSVPNIYGIGDVLYGKQELTPVAIQTGK  336 
gi|300122766|em     304 SVQEQTSVPNIYGIGDVLYGKQELTPVAIQTGK  336 
gi|300123462|em     310 SVQEQTSVPNIYGIGDVLYGKQELTPVAIQTGK  342 
gi|300123462|em     303 SVQEQTSVPNIYGIGDVLYGKQELTPVAIQTGK  335 
gi|300123462|em     331 SVQEQTSVPNIYGIGDVLYGKQELTPVAIQTGK  363 
gi|300123462|em     304 SVQEQTSVPNIYGIGDVLYGKQELTPVAIQTGK  336 
gi|300123462|em     304 SVQEQTSVPNIYGIGDVLYGKQELTPVAIQTGK  336 

cons                331 *********************************  363 


gi|300122766|em     343 LLARRLYGGSSVQMDYENVPMTVFTPLEYGNCG  375 
gi|300122766|em     336 LLARRLYGGSSVQMDYENVPMTVFTPLEYGNCG  368 
gi|300122766|em     338 LLARRLYGGSSVQMDYENVPMTVFTPLEYGNCG  370 
gi|300122766|em     337 LLARRLYGGSSVQMDYENVPMTVFTPLEYGNCG  369 
gi|300122766|em     337 LLARRLYGGSSVQMDYENVPMTVFTPLEYGNCG  369 
gi|300123462|em     343 LLARRLYGGSSVQMDYENVPMTVFTPLEYGNCG  375 
gi|300123462|em     336 LLARRLYGGSSVQMDYENVPMTVFTPLEYGNCG  368 
gi|300123462|em     364 LLARRLYGGSSVQMDYENVPMTVFTPLEYGNCG  396 
gi|300123462|em     337 LLARRLYGGSSVQMDYENVPMTVFTPLEYGNCG  369 
gi|300123462|em     337 LLARRLYGGSSVQMDYENVPMTVFTPLEYGNCG  369 

cons                364 *********************************  396 


gi|300122766|em     376 LTEEAALERFGEDNVEVYVSQFTPLEWQISPHR  408 
gi|300122766|em     369 LTEEAALERFGEDNVEVYVSQFTPLEWQISPHR  401 
gi|300122766|em     371 LTEEAALERFGEDNVEVYVSQFTPLEWQISPHR  403 
gi|300122766|em     370 LTEEAALERFGEDNVEVYVSQFTPLEWQISPHR  402 
gi|300122766|em     370 LTEEAALERFGEDNVEVYVSQFTPLEWQISPHR  402 
gi|300123462|em     376 LTEEAALERFGEDNVEVYVSQFTPLEWQISPHR  408 
gi|300123462|em     369 LTEEAALERFGEDNVEVYVSQFTPLEWQISPHR  401 
gi|300123462|em     397 LTEEAALERFGEDNVEVYVSQFTPLEWQISPHR  429 
gi|300123462|em     370 LTEEAALERFGEDNVEVYVSQFTPLEWQISPHR  402 
gi|300123462|em     370 LTEEAALERFGEDNVEVYVSQFTPLEWQISPHR  402 

cons                397 *********************************  429 


gi|300122766|em     409 RKEVCFAKLITKRDDGLILGFHILSPNAGEITQ  441 
gi|300122766|em     402 RKEVCFAKLITKRDDGLILGFHILSPNAGEITQ  434 
gi|300122766|em     404 RKEVCFAKLITKRDDGLILGFHILSPNAGEITQ  436 
gi|300122766|em     403 RKEVCFAKLITKRDDGLILGFHILSPNAGEITQ  435 
gi|300122766|em     403 RKEVCFAKLITKRDDGLILGFHILSPNAGEITQ  435 
gi|300123462|em     409 RKEVCFAKLITKRDDGLILGFHILSPNAGEITQ  441 
gi|300123462|em     402 RKEVCFAKLITKRDDGLILGFHILSPNAGEITQ  434 
gi|300123462|em     430 RKEVCFAKLITKRDDGLILGFHILSPNAGEITQ  462 
gi|300123462|em     403 RKEVCFAKLITKRDDGLILGFHILSPNAGEITQ  435 
gi|300123462|em     403 RKEVCFAKLITKRDDGLILGFHILSPNAGEITQ  435 

cons                430 *********************************  462 


gi|300122766|em     442 GFGLAFQTKATYQNLMDLVGIHPTIAEEFTTLS  474 
gi|300122766|em     435 GFGLAFQTKATYQNLMDLVGIHPTIAEEFTTLS  467 
gi|300122766|em     437 GFGLAFQTKATYQNLMDLVGIHPTIAEEFTTLS  469 
gi|300122766|em     436 GFGLAFQTKATYQNLMDLVGIHPTIAEEFTTLS  468 
gi|300122766|em     436 GFGLAFQTKATYQNLMDLVGIHPTIAEEFTTLS  468 
gi|300123462|em     442 GFGLAFQTKATYQNLMDLVGIHPTIAEEFTTLS  474 
gi|300123462|em     435 GFGLAFQTKATYQNLMDLVGIHPTIAEEFTTLS  467 
gi|300123462|em     463 GFGLAFQTKATYQNLMDLVGIHPTIAEEFTTLS  495 
gi|300123462|em     436 GFGLAFQTKATYQNLMDLVGIHPTIAEEFTTLS  468 
gi|300123462|em     436 GFGLAFQTKATYQNLMDLVGIHPTIAEEFTTLS  468 

cons                463 *********************************  495 


gi|300122766|em     475 VTKRSGASAKKGGCXG  490 
gi|300122766|em     468 VTKRSGASAKKGGCXG  483 
gi|300122766|em     470 VTKRSGASAKKGGCXG  485 
gi|300122766|em     469 VTKRSGASAKKGGCXG  484 
gi|300122766|em     469 VTKRSGASAKKGGCXG  484 
gi|300123462|em     475 VTKRSGASAKKGGCXG  490 
gi|300123462|em     468 VTKRSGASAKKGGCXG  483 
gi|300123462|em     496 VTKRSGASAKKGGCXG  511 
gi|300123462|em     469 VTKRSGASAKKGGCXG  484 
gi|300123462|em     469 VTKRSGASAKKGGCXG  484 

cons                496 ****************  511