T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:1 sec.
SCORE=89
*
 BAD AVG GOOD
*
B. taurus       :  92
M. musculus     :  92
R. norvegicus   :  92
H. sapiens      :  92
P. troglodites  :  92
S. kowalevskii  :  68
S.scrofa        :  92
cons            :  89

B. taurus       MWRGLGLALALCLLLTGGTESQGQSSYCKQPPPWSIKDQDPMLNS
M. musculus     MWRSLGLALALCLLPYGGAESQGQSSACYKAPEWYIGDQNPMLNS
R. norvegicus   MWRSLGLALALCLLPYGGAESQGQSPACKQAPPWNIGDQNPMLNS
H. sapiens      MWRSLGLALALCLLPSGGTESQDQSSLCKQPPAWSIRDQDPMLNS
P. troglodites  MWRSLGLALALCLLPSGGTESQDQSSLCKQPPAWSIRDQDPMLNS
S. kowalevskii  MGHQ-GMLLAALLSLATLVCSAPISPECPDGVLWSVNEETPMLAN
S.scrofa        MWRGLGLALALCLLSWGGTESQGKSSFCEQPPGWSIKDQDPMLNS

cons            * :  *: **  *     . *   *. * .   * : :: *** .


B. taurus       YGSVTVVALLQASUYLCILQASRLEDLRVKLEKEGYSNISYVVVN
M. musculus     EGKVTVVALLQASUYLCLLQASRLEDLRIKLESQGYFNISYIVVN
R. norvegicus   EGTVTVVALLQASUYLCLLQASRLEDLRIKLENQGYFNISYIVVN
H. sapiens      NGSVTVVALLQASUYLCILQASKLEDLRVKLKKEGYSNISYIVVN
P. troglodites  SGSVTVVALLQASUYLCILQASKR-SCRVKLKKEGYFHISYIVVN
S. kowalevskii  RGKVVVVALLQASUHFCLSQAEALEVLREKFLSQGMDEISFLVVN
S.scrofa        YGSVTVVALLQASUYLCILQASRLEDLRVKLEKEGYSNISYIVVN

cons             *.*.*********::*: **.     * *: .:*  .**::***


B. taurus       HQGISSRLKYVHLKNKVSEHIPVYQQEENQPDVWTLLNGNKDDFL
M. musculus     HQGSPSQLKHSHLKKQVSEHIAVYRQEEDGIDVWTLLNGNKDDFL
R. norvegicus   HQGSPSQLKHAHLKKQVSDHIAVYRQDEHQTDVWTLLNGNKDDFL
H. sapiens      HQGISSRLKYTHLKNKVSEHIPVYQQEENQTDVWTLLNGSKDDFL
P. troglodites  HQGISSRLKYTHLKNKVSEHIPVYQQEENQTDVWTLLNGSKDDFL
S. kowalevskii  SKKLHSQFLIGHLHQRVS--FPVYQA-RYENDIWSQLDGAKDDII
S.scrofa        HQGIASQLKYVYLKSKVSEHIPVYQQEENQTDVWTLLNGNKDDFL

cons             :   *::   :*:.:**  :.**:  .   *:*: *:* ***::


B. taurus       IYDRCGRLVYHLGLPYSFLTFTYVEDSIKTVYCEDKCGNCSLKAL
M. musculus     IYDRCGRLVYHLGLPYSFLTFPYVEEAIKIAYCEERCGNCNLTSL
R. norvegicus   IYDRCGRLVYHLGLPYSFLTFPYVEEAIKIAYCEKRCGNCSFTSL
H. sapiens      IYDRCGRLVYHLGLPFSFLTFPYVEEAIKIAYCEKKCGNCSLTTL
P. troglodites  IYDRCGRLVYHLGLPFSFLTFPYVEEAIKIAYCEKKCGNCSLTTL
S. kowalevskii  VYDRCGKLVDHIRMPYSFLENDNVERAIVSAYYENPCGRCEVVEP
S.scrofa        IYDRCGLLVYHLGLPYSFLTFPYVEEAIKTVYCENKCGNCSLKTL

cons            :***** ** *: :*:***    ** :*  .* *. **.*..   


B. taurus       E-DEDVCKNV------------------FLA--------------
M. musculus     E-DEDFCKTV------------------TSA--------------
R. norvegicus   E-DEAFCKNV------------------SSA--------------
H. sapiens      K-DEDFCKRV------------------SLA--------------
P. troglodites  K-DEDFCKRV------------------SLA--------------
S. kowalevskii  QVSEDLVTYEVNTSYEGSGDIIDGDPLVYLIELEHEVEDLEKQAL
S.scrofa        K-DEDFCKNV------------------YLA--------------

cons            : .* . .                                     


B. taurus       ---------------------TKEK--------------------
M. musculus     ---------------------TANK--------------------
R. norvegicus   ---------------------TASK--------------------
H. sapiens      ---------------------TVDK--------------------
P. troglodites  ---------------------TVDK--------------------
S. kowalevskii  ERQRVRNHSQTNSSDESQMVGQDEKNSESMESREDKSGSASSEES
S.scrofa        ---------------------TEEK--------------------

cons                                   .*                    


B. taurus       ----TAEASQRHHHPH------PHPHHGHQLHENAHLSESP---K
M. musculus     ----TAEPSEAHSHHK------HHNKHGQEHLGSSKPSENQ---Q
R. norvegicus   ----TTEPSEEHNHHK------HHDKHGHEHLGSSKPSENQ---Q
H. sapiens      ----TVETPSPHYHHE------HHHNHGHQHLGSSELSENQ---Q
P. troglodites  ----TVETPSPHYHHE------HHHNHGHQHLGSSELSENQ---Q
S. kowalevskii  KKYGSTESKSGSFSSE------ESKQDGSRQSGSSEESKQDGSRQ
S.scrofa        ----TTEAPQPHHHHDHHHHRHHHHHHGHQHLGNGHLSEHP---K

cons                :.*. .     .         :.* .   ... *:     :


B. taurus       PDTPDTPENP--PPSGLHHH--HHRHKGPQRQGHSDNCDTP----
M. musculus     PGPSE--TTL--PPSGLHH---HHRHRGQHRQGHLESUDTT----
R. norvegicus   PGALDVETSL--PPSGLHHHHHHHKHKGQHRQGHLESUDMG----
H. sapiens      PGAPNAPTHP--APPGLHH---HHKHKGQHRQGHPENRDMP----
P. troglodites  PGAPNAPTHP--APPGLHH---HHKHKGQHRQGHPENQDMP----
S. kowalevskii  SGSSEESKQDGSRQFGS---SEESKQDGSRQSGSSEEKKKDDDWW
S.scrofa        PEAPDAPEQP--PPSGLHH---HHGHKGHQRQGHSENUDMP----

cons            . . :          *      .  : * ::.*  :. .      


B. taurus       ----VGSESLQPSLPQKKLURKRCINQLLUQFPKDSESALS-SCC
M. musculus     -----ASEGLHLSLAQRKLURRGCINQLLCKLSKESEAAPS-SCC
R. norvegicus   -----ASEGLQLSLAQRKLURRGCINQLLCKLSEESGAATS-SCC
H. sapiens      -----ASEDLQD-L-QKKLCRKRCINQLLCKLPTDSELAPR-SUC
P. troglodites  -----GSEDLQD-L-QKKLCRKRCINQLLCKLPKDSELAPR-SCC
S. kowalevskii  KVEKWSSEDKHSK--EESHDKK-------S-KDKDSLEATRKDWS
S.scrofa        ----AGSESLQLSLPQKKLURRGCISQLLCKFPKNSESALR-SUC

cons                 .**. :    :..  ::            :*  *   . .


B. taurus       CHCRHLVFEKTGSAITUQCTEKLPSLCSUQGLLAEENVIESUQUR
M. musculus     CHCRHLIFEKSGSAIAUQCAENLPSLCSUQGLFAEEKVTESCQCR
R. norvegicus   CHCRHLIFEKSGSAITUQCAENLPSLCSUQGLFAEEKVIESCQCR
H. sapiens      CHCRHLIFEKTGSAITUQCKENLPSLCSUQGLRAEENITESCQUR
P. troglodites  CHCRHLIFEKTGSAITUQCKENLPSLCSUQGLRAEENITESCQUR
S. kowalevskii  SESDEDSFEKK----------------------------------
S.scrofa        UHCRHLIFEKTESAVTUQCGENLPSLCSUQGLLAEENVIESUQUR

cons             .. .  ***.                                  


B. taurus       LPPAAUQAAGQQLNPTEASTKUSUKNKAKMUKUPSN
M. musculus     SPPAAUQ--NQPMNPMEANPNUSUDNQTRKUKUHSN
R. norvegicus   SPPAAUH--SQHVSPTEASPNUSUNNKTKKUKUNLN
H. sapiens      LPPAAUQI-SQQLIPTEASASURUKNQAKKUEUPSN
P. troglodites  LPPAAUQI-SQQLIPTEASTSUCUKNQAKKUEUPSN
S. kowalevskii  ----------------------------------KK
S.scrofa        LPPAAUQA-SQQLNPAEASTKUSUKNKAGRUKUPSN

cons                                               :