Resum

Les selenoproteïnes són proteïnes que incorporen a la seva seqüència una selenocisteïna (Sec o U), un aminoàcid que conté un àtom de seleni. Aquest aminoàcid ve codificat pel triplet UGA, que coincideix amb la senyal de STOP de la traducció. L'estudi de les selenoproteïnes és interessant per caracteritzar els genomes fet que permetrà fer, per exemple, estudis evolutius.

El nostre estudi es centra en la identificació de quatre famílies de selenoproteïnes (SPS2, Lmsel1, SelU i SelP) en una sèrie de genomes d'espècies de protistes seqüenciades recentment. Ens hem basat en la comparació amb proteïnes homòlogues identificant el codó TGA així com en la cerca d'elements SECIS i gens de la maquinària de biosíntesi de selenoproteïnes.

Abstract

Selenoproteins are proteins which incorporate a selenocistein (Sec or U) to its sequence, a residue which contains a selenium atom. This residue is codified by the UGA triplet, which is also the STOP translation signal. The selenoproteins study is interesting for the characterization of genomes, which will allow, for instance, evolutionary studies.

Our study is focused in the identification of four selenoprotein families (SPS2, Lmsel1, SelU and SelP) in a series of protist species genome recently sequenced. We dedicated to the comparison with homologue proteins identifing the TGA codon and the search of SECIS elements and genes of the selenoproteins biosynthesis machinery.