CREACIÓ D'UNA QUERY HÍBRIDA: Aureococcus anophagefferens combinada amb Equus caballus
En aquest cas en concret va ser impossible obtenir algun tipus de resultat amb els programes Exonerate o Genewise. Per això vam pensar de crear una query a partir de dos seqüències proteiques molt semblants, omplint els gaps que apareixien i obtenint una query millor i més llarga. Finalment, com es pot veure en el resultat del T_Coffee, l'alineament obtingut entre la nova query i la seqüència de C. elegans és molt prometedor i sembla que realment pot correspondre a una selenoproteïna.
La query híbrida creada és la següent:
MVAMAARPGGWLGPAFALRMLLATVLQAVSAFGAEFSSEECKAAGFNPETLKCGLCERLSDYHLETLLTDCLQCCIKEEEFKH
EKLYPTAILEVCEXNLARFPQVQAFVHKDMARQFRGLQIKYVRGSDPQVALKDADFKTKEVLSVEKWDTDTLIDFFSEKLERN