Execució dels programes Exonerate i Genewise

En aquest cas, el resultat de l'exonerate ha estat negatiu i el del Genewise poc concloent, ja que només aliniava 10 aminoàcids. Tot i que en un principi hagi de semblar que aquesta proteïna doncs, no és una Selenoproteïna, dos factors ens van fer pensar que pot ser hi havia hagut algun problema en l'execució dels programes. En primer lloc, l'aliniament predit pel programa tblastn era molt bo, i quadrava molt bé pel que fa la posició del codó d'inici i de la Selenocisteïna. En segon lloc, havia estat una espècie estudiada ja l'any anterior i els hi havia donat un resultat positiu. Així doncs, després de comprovar que els scaffolds es corresponien amb els utilitzats en el treball de l'any anterior i les regions extretes eren les mateixes, i que tot i així no obteníem els mateixos resultats que ells, després d'haver comprovat que no hi havien hagut errors del procediment, ja que vem repetir-lo tres vegades, vem decidir fer un aliniament amb el T_coffee per veure'n el resultat. Així doncs, el fitxer que s'adjunta a continuació és el que es correpon a aquest procés, que va donar un resultat molt bo.