A pesar de los diferentes estudios para buscar selenoproteínas, hasta hace poco no se habían buscado en organismos clasificados de la clase Kinetoplastida. Los kinetoplastidios son un grupo de protozoos flagelados que incluyen distintos parásitos responsables de enfermedades en humanos y otros animales. Contienen kinetoplasto, es decir, un gránulo de DNA localizado junto a la mitocondria que se asocia a la base del flagelo. En este grupo de organismos encontramos los géneros Trypanosoma (con un flagelo) y Leishmania (con dos flagelos).
El selenoproteoma de Trypanosoma contiene 3 selenoproteínas, que incluyen homólogos distantes de mamíferos (SelK y SelT), y una selenoproteína multidominio descrita recientemente: SelTryp. Ésta contiene homólogos con Cisteína en humanos, y parece ser una proteína específica de Kinetoplastia. En SelTryp, Sec está presente en un motivo CxxU, que normalmente se encuentra en selenoproteínas que realizan una función redox en el que se forma un puente seleniosulfito reversible. Esta observación sugiere una función redox del motivo CxxU de SelTryp. [REFERENCIA: Stephan Gromer et al. Selenium metabolism in Trypanosoma: characterization of selenoproteomes and identification of a Kinetoplastida-specific selenoprotein]
En Leishmania se han encontrado selenoproteínas en Leishmania major y Leishmania infantum. Se identificó una selenoproteína en Leishmania major mediante una búsqueda de los elementos SECIS en todo el genoma y posterior refinamiento de estos para quedarse con los que realmente podían serlo. Se vio que en el open reading frame asociado a uno de estos elementos SECIS había un codon UGA upstream. Se observó que existía un homólogo en Leishmania infantum, por lo que se siguió en esta línia. Posteriores estudios con Se marcado radiactivamente confirmaron la presencia de esta Selenoproteína. El posible gen codificaba por una posible selenoproteína en Leishmania pero no en otros organismos. Aún no se ha especulado sobre la función de estas nuevas selenoproteínas. [REFERENCIA: Cassago et al, 2006: Identification of Leishmania selenoproteins and SECIS element]