T-COFFEE, Version_7.38(Thu Nov 20 17:26:38 WEST 2008)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=89
*
 BAD AVG GOOD
*
SECp43_Homo_sap   :  89
SECp43_2          :  89
cons              :  89

SECp43_Homo_sap   MA-------ASLWMGDLEPYMDENFISRAFATMGETVMSVKIIRN
SECp43_2          MAANSPYQSASLYVGDLNPTVTEALLFEIFKAVGP-VASIRVCRD

cons              **       ***::***:* : * :: . * ::*  * *::: *:


SECp43_Homo_sap   RLTGIPAGYCFVEFADLATAEKCLHKINGKPLPGATPAKRFKLNY
SECp43_2          AVTRRSLGYAYVNFHNVVDAERALDTLNYTLIKGR-PC---RIMW

cons               :*  . **.:*:* ::. **:.*..:* . : *  *.   :: :


SECp43_Homo_sap   ATYGKQPDNSPEYSLFVGDLTPDVDDGMLYEFFVKVYPSCRGGKV
SECp43_2          SHRDPSIRKSGQGNIFIKNLDKSIDNKALYDTFS-AFGNILSCKV

cons              :  . .  :* : .:*: :*  .:*:  **: *  .: .  . **


SECp43_Homo_sap   VLDQTGVSKGYGFVKFTDELEQKRALTECQGAVGLGSKPVRLSVA
SECp43_2          VTDGKGNSKGYGFVH------------------------------

cons              * * .* *******:                              


SECp43_Homo_sap   IPKASRVKPVEYSQMYSYSYNQYYQQYQNYYAQWGYDQNTGSYSY
SECp43_2          ---------------------------------------------

cons                                                           


SECp43_Homo_sap   SYPQYGYTQSTMQTYEEVGDDALEDPMPQLDVTEANKEFMEQSEE
SECp43_2          ---------------------------------------------

cons                                                           


SECp43_Homo_sap   LYDALMDCHWQPLDTVSSEIPAMM
SECp43_2          -----------------------Y

cons