T-COFFEE, Version_7.38(Thu Nov 20 17:26:38 WEST 2008)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=90
*
 BAD AVG GOOD
*
SecS_Homo_sapie   :  90
SecS              :  90
cons              :  90

SecS_Homo_sapie   MSTSYGCFWRRFIHGIGRSGDISAVQPKAAG--------------
SecS              -------------HGIGRSGDIAAVQPKAAGTYTFASLTNHLPQL

cons                           *********:********              


SecS_Homo_sapie   ---SSLLNKITNSLVLDIIKLAGVHTV---ANCFVVPMATGMSLT
SecS              TQGSSLLVKLTNALALHALRIAGGGNKAFAESCLVLPLATGMAVS

cons                 **** *:**:*.*. :::**  .     .*:*:*:****:::


SecS_Homo_sapie   LCFLTLRHKRPK-AKYIIWPRIDQKSCFKSMITAGFEPVVIENVL
SecS              LALLTLKQMRPDTARYVLWPRMDQKSCLKSIQTAGMPTHTH----

cons              *.:***:: **. *:*::***:*****:**: ***: . .     


SecS_Homo_sapie   EGDELRTDLKAVEAKVQELGPDCILCIHSTTSCFAPRVPDRLEEL
SecS              ---------------------------------------------

cons                                                           


SecS_Homo_sapie   AVICANYDIPHIVNNAY--GVQSSK-C------MHLIQQGARVGR
SecS              -----THDTRHTTHTTHTTGTRTHELCTVRLLITVSARQACRLGR

cons                   .:*  * .:.::  *.:: : *          :*..*:**


SecS_Homo_sapie   IDAFVQSLDKNFMVPVGGAIIAGFNDSFIQEISKMYPGRASASPS
SecS              VDCFVQSTDKNFLVPVGGAIVAGPSKKFIEELNKAYPGRASASPL

cons              :*.**** ****:*******:** ...**:*:.* ********* 


SecS_Homo_sapie   LDVLITLLSLGSNGYKKLLKERKEMFSYLSNQIKKLSEAYNERLL
SecS              VDLFITLLSLGGXGWKTLLRERKELFGYFTAEMAKVAEKHGERFL

cons              :*::*******. *:*.**:****:*.*:: :: *::* :.**:*


SecS_Homo_sapie   HTPHNPISLAMTLKTLDEHRDKAVTQLGSMLFTRQVSGARVVPLG
SecS              ATPNNPISFGMTLERLGDVKE-GPTMLGSMLFSRCCSGTRIVTGK

cons               **:****:.***: *.: :: . * ******:*  **:*:*.  


SecS_Homo_sapie   SMQTVSGYTFRGFMSHTNNYPCAYLNAASAIGMKMQDVDLFIKRL
SecS              EKKVVAGITFEGYGAHIDSYPTAYATAACALGLTRGEVDLFLTRL

cons              . :.*:* **.*: :* :.** ** .**.*:*:.  :****:.**


SecS_Homo_sapie   DRCLKAVRKERSKESDDNYDKTEDVDIEEMALKLDNVLLDTYQDA
SecS              DKTLTELHHQKRK--------------------------------

cons              *: *. ::::: *                                


SecS_Homo_sapie   SS
SecS              -K

cons               .