CLUSTAL FORMAT for T-COFFEE Version_5.05 [http://www.tcoffee.org], CPU=0.60 sec, SCORE=92, Nseq=3, Len=461 berghei MPQTYILFTYYTLLHTFILLRFYLGLYIKCGSRYEEINDKINEQGMSVMIENMAFHSTAH yoelii --NFDNVSPTYTLLHTFILLLFYLGLYIKCGSRYEEINDKVNEQGMSVMIENMAFHSTAH chabaudi --PIYILLIYYTLLHTFILLQFYLGLYIKCGSRYEEISDKINEQGMSVMIENMAFHSTAH : ********** ****************.**:******************* berghei LSHLRAIKSLEKIGANVSCNAFREHIVYTCECLNEYLPIVINLLIGNVLFPRFLSWEMKN yoelii LSHLRAIKSLEKIGANVSCNAFREHIVYTCECLNEYLPVVINLLIGNVLFPRFLSWEMKN chabaudi LSHLRAIKSLEKIGANVSCNAFREHIVYTCECLNEYLPVVINLLIGNVLFPRFLSWEMKN **************************************:********************* berghei NVNRLNTMRAKLFENNEMYITELLHNTAWYNNTLGNKLYVSESNIENYTSENLRNFMLKH yoelii NVNRLNTMRAKLFENNEMYITELLHNTAWYNNTLGNKLYVSESNIENYTSENLRNFMLKH chabaudi NVNRLNTMRAKLFENNEMYITELLHNTAWYNNTLGNKLYVSESNIENYTSENLRNFMLKH ************************************************************ berghei FSPKNMTLVGINVDHNELTKWTSRAFQDYVPIPYIKQKEVTPNYTGGFISVEDKNIKKTN yoelii FSPKNMTLVGINVDHNELTKWTSRAFQDYVPIPYTKQKEVTPNYTGGFISVEDKNIKKTN chabaudi FSPKNMTLVGVNVDHNELTKWTSRAFQDYVPIPYVKQNEVTPNYTGGFVSVEDKNIKKTN **********:*********************** **:**********:*********** berghei IAIAYETKGGWKTSDMITLTVLQTLMGGGGSFSTGGPGKGMYSRLFLNVLNNYNFIESCM yoelii IAIAYETKGGWKTSDMITLTVLQTLMGGGGSFSTGGPGKGMYSRLFLNVLNNYNFIESCM chabaudi IAIAYETKGGWKTSDMITLTVLQTLMGGGGSFSTGGPGKGMYSRLFLNVLNNYNFIESCM ************************************************************ berghei AFSTQHSDTGLFGLYFTGDPANTKDIINSMALEFHKMNKCTDEELNRAKKSLKSFMWMSL yoelii AFSTQHSDTGLFGLYFTGDPANTKDIINSMALEFHKMNKCTDEELNRAKKSLKSFMWMSL chabaudi AFSTQHSDTGLFGLYFTGDPANTKDIINSMALEFHKMNKCTDEELNRAKKSLKSFMWMSL ************************************************************ berghei EYKSILMEDLARQMMILNRILSGKQLCDAIDAVTKEDINRVVSQFLKTKPTVVVYGNISH yoelii EYKSILMEDLARQMMILNRILSGKQLCDAIDAVTKEDINRVVSQFLKTKPTVVVYGNISH chabaudi EYKSILMEDIARQMMILNRILSGKQLCDAIDAVTKEDINRVVSQFLKTKPTVVVYGNISH *********:************************************************** berghei SPHYDEICKMLGUMATICCCKFYYP---------------- yoelii SPHYDEICKMLG-VTIICCCKFYYPTCIHLCALSFFMPL-- chabaudi SPHYDEICKMLG-ITTICCCKFYYPACIHLCALSFYIFISI ************ :: *********