LOCALIZACIÓN DE SELENOPROTEÍNAS EN <em>B. BIGEMINA</em>

Resultados exonerate para las proteínas compuestas de Drosophila

	
	Command line: [exonerate -m p2g -q secp43comp.fa -t blast4184.3_106000-109000.fa]
	Hostname: [am75264]

	C4 Alignment:
	------------
	         Query: Secp43comp 
	        Target: Contig4184.3:subseq(106000,3000) [revcomp]
	         Model: protein2genome
	     Raw score: 789
	   Query range: 5 -> 158
	  Target range: 935 -> 1394

	    6 : CysGlnLeuTyrValGlyAspLeuLeuProGluValThrGluAlaMetLeuTyrGluValPh :   26
	        ..!...||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
	        AlaSerLeuTyrValGlyAspLeuLeuProGluValThrGluAlaMetLeuTyrGluValPh
	  936 : GCTAGTCTATACGTGGGCGATCTTCTCCCCGAGGTTACGGAGGCGATGTTGTACGAAGTTTT :  996

	   27 : eAsnGlyValGlyProValAlaSerIleArgValCysArgAspSerValThrArgLysSerL :   47
	        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
	        eAsnGlyValGlyProValAlaSerIleArgValCysArgAspSerValThrArgLysSerL
	  997 : CAATGGAGTAGGACCTGTGGCTTCCATACGTGTCTGCCGTGACAGCGTTACGCGTAAGAGTT : 1059

	   48 : euGlyTyrAlaTyrValAsnTyrTyrAsnValGlnAspAlaGluThrAlaLeuGluCysLeu :   67
	        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
	        euGlyTyrAlaTyrValAsnTyrTyrAsnValGlnAspAlaGluThrAlaLeuGluCysLeu
	 1060 : TGGGTTATGCTTACGTGAATTACTACAACGTACAGGACGCAGAAACTGCGCTCGAGTGTTTA : 1119

	   68 : AsnTyrIleAspIleLysGlyHisProAlaArgIleMetTrpSerAspArgAspProSerLe :   88
	        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
	        AsnTyrIleAspIleLysGlyHisProAlaArgIleMetTrpSerAspArgAspProSerLe
	 1120 : AATTATATCGACATTAAGGGTCACCCTGCTCGTATCATGTGGAGCGACAGAGACCCCAGTTT : 1182

	   89 : uArgLysSerGlyThrGlyAsnIlePheValLysAsnLeuAspLysAlaIleAspThrLysA :  109
	        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
	        uArgLysSerGlyThrGlyAsnIlePheValLysAsnLeuAspLysAlaIleAspThrLysA
	 1183 : GCGTAAAAGCGGTACAGGTAATATCTTCGTGAAGAACCTCGACAAAGCCATTGACACCAAGG : 1245

	  110 : laLeuTyrAspThrPheSerHisPheGlyThrIleLeuSerCysLysValAlaMetAspAla :  129
	        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
	        laLeuTyrAspThrPheSerHisPheGlyThrIleLeuSerCysLysValAlaMetAspAla
	 1246 : CACTGTATGACACGTTCAGTCATTTCGGCACTATTCTGTCTTGCAAAGTGGCCATGGACGCT : 1305

	  130 : LeuGlyAsnSerLysGlyTyrGlyPheValHisTyrThrThrGluGluSerAlaLysGluAl :  150
	        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
	        LeuGlyAsnSerLysGlyTyrGlyPheValHisTyrThrThrGluGluSerAlaLysGluAl
	 1306 : CTCGGCAATTCCAAGGGTTATGGATTCGTGCATTACACGACTGAGGAGAGCGCAAAGGAAGC : 1368

	  151 : aIleGluLysValAsnGlyMetLeu :  158
	        |||||||||||||||||||||||||
	        aIleGluLysValAsnGlyMetLeu
	 1369 : CATAGAAAAGGTGAATGGCATGCTT : 1394

	vulgar: Secp43comp 5 158 . Contig4184.3:subseq(106000,3000) 935 1394 + 789 M 153 459
	-- completed exonerate analysis
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