Resultados exonerate para las proteínas compuestas
Command line: [exonerate -m p2g -q fal4_3965compuesta.fa -t contig3965.fa]
Hostname: [am75269]
C4 Alignment:
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Query: Proteinafal4 compuesta para el contig3965
Target: Contig3965 [revcomp]
Model: protein2genome
Raw score: 469
Query range: 37 -> 124
Target range: 3344 -> 3083
38 : LeuLysMetCysValSerAsnAlaAspLeuGlnArgGlnAspGluValAspGluLysTrpAr : 58
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LeuLysMetCysValSerAsnAlaAspLeuGlnArgGlnAspGluValAspGluLysTrpAr
3344 : CTCAAAATGTGCGTTTCCAATGCAGATCTCCAACGACAAGATGAGGTTGACGAGAAATGGCG : 3284
59 : gLysGlnGlnGlnGluTyrAspGluArgValGluArgIleArgValGluLysGluAlaAlaA : 79
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gLysGlnGlnGlnGluTyrAspGluArgValGluArgIleArgValGluLysGluAlaAlaA
3283 : AAAACAACAACAGGAGTATGATGAAAGGGTGGAACGAATACGTGTGGAGAAGGAAGCGGCTG : 3221
80 : spLysGlnLysAspAsnGluGluMetThrLysGlnGluAspGluAspGluArgLysLysArg : 99
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spLysGlnLysAspAsnGluGluMetThrLysGlnGluAspGluAspGluArgLysLysArg
3220 : ATAAACAAAAAGACAACGAAGAGATGACGAAACAAGAAGATGAAGATGAACGTAAAAAGCGA : 3161
100 : MetAspIleAlaAlaGlnHisProLeuMetProAlaProAsnTyrTyrTyrAsnGlnArgPr : 120
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MetAspIleAlaAlaGlnHisProLeuMetProAlaProAsnTyrTyrTyrAsnGlnArgPr
3160 : ATGGATATTGCAGCCCAACATCCGCTTATGCCAGCGCCTAATTACTATTACAACCAGCGCCC : 3098
121 : oHisTyrTyrAsn : 124
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oHisTyrTyrAsn
3097 : TCACTACTACAAC : 3084
vulgar: Proteinafal4 37 124 . Contig3965 3344 3083 - 469 M 87 261
-- completed exonerate analysis
Command line: [exonerate -m p2g -q fal4_4058compuesta.fa -t contig4058.fa]
Hostname: [am75269]
C4 Alignment:
------------
Query: Proteinafal4 compuesta para el contig4058
Target: Contig4058
Model: protein2genome
Raw score: 400
Query range: 34 -> 109
Target range: 2040 -> 2265
35 : TrpGluIleLeuGlnLysHisCysIleGluLeuLysArgSerArgIleAsnGluLeuPheSe : 55
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TrpGluIleLeuGlnLysHisCysIleGluLeuLysArgSerArgIleAsnGluLeuPheSe
2041 : TGGGAAATTTTACAGAAGCACTGCATCGAACTTAAAAGGTCACGAATAAACGAATTGTTTAG : 2101
56 : rProGlnAlaPheAsnHisThrGlyGlnSerGlnGluIleAspLysLeuAsnLysGluLysP : 76
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rProGlnAlaPheAsnHisThrGlyGlnSerGlnGluIleAspLysLeuAsnLysGluLysP
2102 : CCCCCAAGCCTTCAACCATACCGGGCAGTCGCAGGAAATTGACAAGCTTAACAAAGAAAAGT : 2164
77 : heAlaLysLysMetAlaGluTrpLeuArgAspAsnLeuAspLysValArgArgAsnLeuGly : 96
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heAlaLysLysMetAlaGluTrpLeuArgAspAsnLeuAspLysValArgArgAsnLeuGly
2165 : TCGCCAAGAAGATGGCGGAGTGGCTTAGAGATAATCTGGATAAGGTGAGAAGGAATCTGGGA : 2224
97 : LysIleAsnThrSerTyrLysGlyAsnThrArgAspTyr : 109
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LysIleAsnThrSerTyrLysGlyAsnThrArgAspTyr
2225 : AAGATTAATACAAGTTACAAGGGCAATACGAGAGACTAT : 2265
vulgar: Proteinafal4 34 109 . Contig4058 2040 2265 + 400 M 75 225
-- completed exonerate analysis
Command line: [exonerate -m p2g -q huxcompuesta.fa -t contig4169.0.fa]
Hostname: [am75269]
C4 Alignment:
------------
Query: hux_proteína compuesta:
Target: Contig4169.0 [revcomp]
Model: protein2genome
Raw score: 549
Query range: 12 -> 125
Target range: 6206 -> 5829
13 : AlaTyrAlaSerGlySerValValGluLeuThrGluLysAsnIleHisGluPheLeuAlaGl : 33
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AlaTyrAlaSerGlySerValValGluLeuThrGluLysAsnIleHisGluPheLeuAlaGl
6206 : GCGTACGCATCCGGGAGCGTTGTTGAGCTCACTGAGAAGAACATCCACGAGTTCCTGGCCGA : 6146
34 : uLysAspAlaValLeuValLysPheTyrAlaProTrp*** >>>> Target Intron 1 : 47
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uLysAspAlaValLeuValLysPheTyrAlaProTrp***++
6145 : GAAAGACGCCGTTTTGGTGAAGTTCTACGCCCCATGGTAGgt.................... : 6102
48 : >>>> HisCysGlnAlaLeuAlaProGluTyrGluLysAlaAlaLysGlnLeuAlaGluG : 65
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-+HisCysGlnAlaLeuAlaProGluTyrGluLysAlaAlaLysGlnLeuAlaGluG
6101 : .....tgCACTGCCAGGCCCTGGCCCCCGAGTATGAGAAGGCCGCTAAGCAGCTCGCGGAGG : 6012
66 : luGlySerGluValValLeuAlaGluIleAsnCysAspGlyAlaValGlyValAlaGlnGlu : 85
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luGlySerGluValValLeuAlaGluIleAsnCysAspGlyAlaValGlyValAlaGlnGlu
6011 : AGGGCTCCGAGGTGGTACTGGCCGAGATCAACTGCGACGGTGCAGTGGGTGTTGCTCAGGAG : 5952
86 : PheGlyValGluGlyTyrProThrLeuLysPhePheArgLysGlyValAlaArgSerTyrTh : 106
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PheGlyValGluGlyTyrProThrLeuLysPhePheArgLysGlyValAlaArgSerTyrTh
5951 : TTCGGCGTTGAGGGCTACCCTACGCTGAAGTTCTTCCGCAAGGGTGTTGCTAGGAGCTACAC : 5889
107 : rGlySerArgGlnAlaAspGlyIleValSerTrpCysLysThrValLeuLeuProAla : 125
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rGlySerArgGlnAlaAspGlyIleValSerTrpCysLysThrValLeuLeuProAla
5888 : CGGTTCCCGCCAGGCCGATGGCATCGTGAGCTGGTGCAAAACGGTCTTGTTGCCCGCC : 5830
vulgar: hux_proteína 12 125 . Contig4169.0 6206 5829 - 549 M 34 102 5 0 2 I 0 34 3 0 2 M 79 237
-- completed exonerate analysis