< LOCALIZACIÓN DE SELENOPROTEÍNAS EN <em>B. BIGEMINA</em>

Resultados exonerate para las proteínas compuestas


	Command line: [exonerate -m p2g -q fal4_3965compuesta.fa -t contig3965.fa]
	Hostname: [am75269]

	C4 Alignment:
	------------
	         Query: Proteinafal4 compuesta para el contig3965
	        Target: Contig3965 [revcomp]
	         Model: protein2genome
	     Raw score: 469
	   Query range: 37 -> 124
	  Target range: 3344 -> 3083

	   38 : LeuLysMetCysValSerAsnAlaAspLeuGlnArgGlnAspGluValAspGluLysTrpAr :   58
	        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
	        LeuLysMetCysValSerAsnAlaAspLeuGlnArgGlnAspGluValAspGluLysTrpAr
	 3344 : CTCAAAATGTGCGTTTCCAATGCAGATCTCCAACGACAAGATGAGGTTGACGAGAAATGGCG : 3284

	   59 : gLysGlnGlnGlnGluTyrAspGluArgValGluArgIleArgValGluLysGluAlaAlaA :   79
	        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
	        gLysGlnGlnGlnGluTyrAspGluArgValGluArgIleArgValGluLysGluAlaAlaA
	 3283 : AAAACAACAACAGGAGTATGATGAAAGGGTGGAACGAATACGTGTGGAGAAGGAAGCGGCTG : 3221

	   80 : spLysGlnLysAspAsnGluGluMetThrLysGlnGluAspGluAspGluArgLysLysArg :   99
	        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
	        spLysGlnLysAspAsnGluGluMetThrLysGlnGluAspGluAspGluArgLysLysArg
	 3220 : ATAAACAAAAAGACAACGAAGAGATGACGAAACAAGAAGATGAAGATGAACGTAAAAAGCGA : 3161

	  100 : MetAspIleAlaAlaGlnHisProLeuMetProAlaProAsnTyrTyrTyrAsnGlnArgPr :  120
	        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
	        MetAspIleAlaAlaGlnHisProLeuMetProAlaProAsnTyrTyrTyrAsnGlnArgPr
	 3160 : ATGGATATTGCAGCCCAACATCCGCTTATGCCAGCGCCTAATTACTATTACAACCAGCGCCC : 3098

	  121 : oHisTyrTyrAsn :  124
	        |||||||||||||
	        oHisTyrTyrAsn
	 3097 : TCACTACTACAAC : 3084

	vulgar: Proteinafal4 37 124 . Contig3965 3344 3083 - 469 M 87 261
	-- completed exonerate analysis








	Command line: [exonerate -m p2g -q fal4_4058compuesta.fa -t contig4058.fa]
	Hostname: [am75269]

	C4 Alignment:
	------------
	         Query: Proteinafal4 compuesta para el contig4058
	        Target: Contig4058
	         Model: protein2genome
	     Raw score: 400
	   Query range: 34 -> 109
	  Target range: 2040 -> 2265

	   35 : TrpGluIleLeuGlnLysHisCysIleGluLeuLysArgSerArgIleAsnGluLeuPheSe :   55
	        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
	        TrpGluIleLeuGlnLysHisCysIleGluLeuLysArgSerArgIleAsnGluLeuPheSe
	 2041 : TGGGAAATTTTACAGAAGCACTGCATCGAACTTAAAAGGTCACGAATAAACGAATTGTTTAG : 2101

	   56 : rProGlnAlaPheAsnHisThrGlyGlnSerGlnGluIleAspLysLeuAsnLysGluLysP :   76
	        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
	        rProGlnAlaPheAsnHisThrGlyGlnSerGlnGluIleAspLysLeuAsnLysGluLysP
	 2102 : CCCCCAAGCCTTCAACCATACCGGGCAGTCGCAGGAAATTGACAAGCTTAACAAAGAAAAGT : 2164

	   77 : heAlaLysLysMetAlaGluTrpLeuArgAspAsnLeuAspLysValArgArgAsnLeuGly :   96
	        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
	        heAlaLysLysMetAlaGluTrpLeuArgAspAsnLeuAspLysValArgArgAsnLeuGly
	 2165 : TCGCCAAGAAGATGGCGGAGTGGCTTAGAGATAATCTGGATAAGGTGAGAAGGAATCTGGGA : 2224

	   97 : LysIleAsnThrSerTyrLysGlyAsnThrArgAspTyr :  109
	        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
	        LysIleAsnThrSerTyrLysGlyAsnThrArgAspTyr
	 2225 : AAGATTAATACAAGTTACAAGGGCAATACGAGAGACTAT : 2265

	vulgar: Proteinafal4 34 109 . Contig4058 2040 2265 + 400 M 75 225
	-- completed exonerate analysis










	Command line: [exonerate -m p2g -q huxcompuesta.fa -t contig4169.0.fa]
	Hostname: [am75269]

	C4 Alignment:
	------------
	         Query: hux_proteína compuesta:
	        Target: Contig4169.0 [revcomp]
	         Model: protein2genome
	     Raw score: 549
	   Query range: 12 -> 125
	  Target range: 6206 -> 5829

	   13 : AlaTyrAlaSerGlySerValValGluLeuThrGluLysAsnIleHisGluPheLeuAlaGl :   33
	        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
	        AlaTyrAlaSerGlySerValValGluLeuThrGluLysAsnIleHisGluPheLeuAlaGl
	 6206 : GCGTACGCATCCGGGAGCGTTGTTGAGCTCACTGAGAAGAACATCCACGAGTTCCTGGCCGA : 6146

	   34 : uLysAspAlaValLeuValLysPheTyrAlaProTrp***  >>>> Target Intron 1 :   47
	        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            38 bp     
	        uLysAspAlaValLeuValLysPheTyrAlaProTrp***++                    
	 6145 : GAAAGACGCCGTTTTGGTGAAGTTCTACGCCCCATGGTAGgt.................... : 6102

	   48 :  >>>>  HisCysGlnAlaLeuAlaProGluTyrGluLysAlaAlaLysGlnLeuAlaGluG :   65
	               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
	             -+HisCysGlnAlaLeuAlaProGluTyrGluLysAlaAlaLysGlnLeuAlaGluG
	 6101 : .....tgCACTGCCAGGCCCTGGCCCCCGAGTATGAGAAGGCCGCTAAGCAGCTCGCGGAGG : 6012

	   66 : luGlySerGluValValLeuAlaGluIleAsnCysAspGlyAlaValGlyValAlaGlnGlu :   85
	        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
	        luGlySerGluValValLeuAlaGluIleAsnCysAspGlyAlaValGlyValAlaGlnGlu
	 6011 : AGGGCTCCGAGGTGGTACTGGCCGAGATCAACTGCGACGGTGCAGTGGGTGTTGCTCAGGAG : 5952

	   86 : PheGlyValGluGlyTyrProThrLeuLysPhePheArgLysGlyValAlaArgSerTyrTh :  106
	        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
	        PheGlyValGluGlyTyrProThrLeuLysPhePheArgLysGlyValAlaArgSerTyrTh
	 5951 : TTCGGCGTTGAGGGCTACCCTACGCTGAAGTTCTTCCGCAAGGGTGTTGCTAGGAGCTACAC : 5889

	  107 : rGlySerArgGlnAlaAspGlyIleValSerTrpCysLysThrValLeuLeuProAla :  125
	        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
	        rGlySerArgGlnAlaAspGlyIleValSerTrpCysLysThrValLeuLeuProAla
	 5888 : CGGTTCCCGCCAGGCCGATGGCATCGTGAGCTGGTGCAAAACGGTCTTGTTGCCCGCC : 5830

	vulgar: hux_proteína 12 125 . Contig4169.0 6206 5829 - 549 M 34 102 5 0 2 I 0 34 3 0 2 M 79 237
	-- completed exonerate analysis