Resultado de exonerate
Command line: [exonerate -m p2g -q compSLA_LP.fa -t contig3744.fa]
Hostname: [am75271]
C4 Alignment:
------------
Query: Compuesta_SLA_LP#drosophila+babesia#
Target: Contig3744
Model: protein2genome
Raw score: 448
Query range: 112 -> 208
Target range: 2315 -> 2603
113 : LeuValAlaArgLeuThrLeuArgLeuCysAlaSerLeuAlaLeuCysLeuGlyAlaArgLe : 133
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LeuValAlaArgLeuThrLeuArgLeuCysAlaSerLeuAlaLeuCysLeuGlyAlaArgLe
2316 : CTGGTTGCTAGGTTAACACTTCGCCTGTGTGCCAGCTTAGCACTTTGCCTGGGTGCTAGGTT : 2376
134 : uProLeuCysLeuValAlaSerLeuAlaArgCysLeuValAlaSerLeuAlaLeuCysProG : 154
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uProLeuCysLeuValAlaSerLeuAlaArgCysLeuValAlaSerLeuAlaLeuCysProG
2377 : ACCACTTTGCCTGGTTGCCAGCTTAGCACGTTGCTTGGTTGCTAGCTTAGCACTTTGCCCGG : 2439
155 : lyAlaSerLeuAlaLeuCysLeuValAlaCysLeuAlaLeuTrpProGlyAlaArgLeuAla : 174
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lyAlaSerLeuAlaLeuCysLeuValAlaCysLeuAlaLeuTrpProGlyAlaArgLeuAla
2440 : GTGCTAGCTTAGCACTTTGTTTGGTTGCTTGCTTAGCACTCTGGCCAGGTGCTAGGTTAGCA : 2499
175 : LeuPheLeuValAlaArgLeuAlaArgCysLeuValAlaArgLeuThrArgCysLeuValAl : 195
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LeuPheLeuValAlaArgLeuAlaArgCysLeuValAlaArgLeuThrArgCysLeuValAl
2500 : CTTTTCCTGGTTGCTAGGTTAGCACGTTGCCTGGTTGCTAGGTTAACACGTTGCCTGGTTGC : 2562
196 : aSerSerThrArgCysLeuValLysGlyGluSerLeuAsn : 208
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aSerSerThrArgCysLeuValValTyrSer***LeuAsn
2563 : TAGCTCAACACGTTGCTTGGTAGTTTACTCATAACTTAAT : 2603
vulgar: Compuesta_SLA_LP#drosophila+babesia# 112 208 . Contig3744 2315 2603 + 448 M 96 288
C4 Alignment:
------------
Query: Compuesta_SLA_LP#drosophila+babesia#
Target: Contig3744
Model: protein2genome
Raw score: 258
Query range: 111 -> 202
Target range: 2120 -> 2393
112 : ThrLeuValAlaArgLeuThrLeuArgLeuCysAlaSerLeuAlaLeuCysLeuGlyAlaAr : 132
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SerLeuValAlaSerLeuAlaLeuCysLeuGlyAlaSerLeuAlaLeuCysLeuArgAlaAr
2121 : AGCCTGGTTGCTAGCTTAGCACTTTGCCTGGGTGCCAGCTTAGCACTTTGCCTGCGTGCTAG : 2181
133 : gLeuProLeuCysLeuValAlaSerLeuAlaArgCysLeuValAlaSerLeuAlaLeuCysP : 153
|||| !!! !||||||! !|||!!!|||.!!! !|||||| !|||!!!||||||||||||!
gLeuThrArgCysLeuGlyAlaArgLeuThrLeuCysLeuTyrAlaArgLeuAlaLeuCysL
2182 : GTTAACACGTTGCCTGGGTGCTAGGTTAACACTTTGCCTGTATGCTAGGTTAGCACTTTGCC : 2244
154 : roGlyAlaSerLeuAlaLeuCysLeuValAlaCysLeuAlaLeuTrpProGlyAlaArgLeu : 173
!! !|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
euValAlaSerLeuAlaLeuCysLeuValAlaCysLeuAlaLeuTrpProGlyAlaArgLeu
2245 : TGGTTGCCAGCTTAGCACTTTGCTTGGTTGCTTGCTTAGCACTCTGGCCAGGTGCTAGGTTA : 2304
174 : AlaLeuPheLeuValAlaArgLeuAlaArgCysLeuValAlaArgLeuThrArgCysLeuVa : 194
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AlaLeuCysLeuValAlaArgLeuThrLeuArgLeuCysAlaSerLeuAlaLeuCysLeuGl
2305 : GCACTTTGCCTGGTTGCTAGGTTAACACTTCGCCTGTGTGCCAGCTTAGCACTTTGCCTGGG : 2367
195 : lAlaSerSerThrArgCysLeuVal : 202
!|||!!!! ! !!! !|||||||||
yAlaArgLeuProLeuCysLeuVal
2368 : TGCTAGGTTACCACTTTGCCTGGTT : 2393
vulgar: Compuesta_SLA_LP#drosophila+babesia# 111 202 . Contig3744 2120 2393 + 258 M 91 273
C4 Alignment:
------------
Query: Compuesta_SLA_LP#drosophila+babesia#
Target: Contig3744
Model: protein2genome
Raw score: 241
Query range: 112 -> 200
Target range: 2171 -> 2435
113 : LeuValAlaArgLeuThrLeuArgLeuCysAlaSerLeuAlaLeuCysLeuGlyAlaArgLe : 133
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LeuArgAlaArgLeuThrArgCysLeuGlyAlaArgLeuThrLeuCysLeuTyrAlaArgLe
2172 : CTGCGTGCTAGGTTAACACGTTGCCTGGGTGCTAGGTTAACACTTTGCCTGTATGCTAGGTT : 2232
134 : uProLeuCysLeuValAlaSerLeuAlaArgCysLeuValAlaSerLeuAlaLeuCysProG : 154
| !!||||||||||||||||||||||||! !||||||||||||!!!|||||||||!! ||||
uAlaLeuCysLeuValAlaSerLeuAlaLeuCysLeuValAlaCysLeuAlaLeuTrpProG
2233 : AGCACTTTGCCTGGTTGCCAGCTTAGCACTTTGCTTGGTTGCTTGCTTAGCACTCTGGCCAG : 2295
155 : lyAlaSerLeuAlaLeuCysLeuValAlaCysLeuAlaLeuTrpProGlyAlaArgLeuAla : 174
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lyAlaArgLeuAlaLeuCysLeuValAlaArgLeuThrLeuArgLeuCysAlaSerLeuAla
2296 : GTGCTAGGTTAGCACTTTGCCTGGTTGCTAGGTTAACACTTCGCCTGTGTGCCAGCTTAGCA : 2355
175 : LeuPheLeuValAlaArgLeuAlaArgCysLeuValAlaArgLeuThrArgCysLeuValAl : 195
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LeuCysLeuGlyAlaArgLeuProLeuCysLeuValAlaSerLeuAlaArgCysLeuValAl
2356 : CTTTGCCTGGGTGCTAGGTTACCACTTTGCCTGGTTGCCAGCTTAGCACGTTGCTTGGTTGC : 2418
196 : aSerSerThrArgCys : 200
||||! !.!!! !|||
aSerLeuAlaLeuCys
2419 : TAGCTTAGCACTTTGC : 2435
vulgar: Compuesta_SLA_LP#drosophila+babesia# 112 200 . Contig3744 2171 2435 + 241 M 88 264
C4 Alignment:
------------
Query: Compuesta_SLA_LP#drosophila+babesia#
Target: Contig3744
Model: protein2genome
Raw score: 222
Query range: 114 -> 195
Target range: 2033 -> 2276
115 : AlaArgLeuThrLeuArgLeuCysAlaSerLeuAlaLeuCysLeuGlyAlaArgLeuProLe : 135
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AlaSerLeuAlaLeuCysLeuSerAlaArgLeuAlaLeuCysLeuIleAlaSerLeuProLe
2034 : GCCAGCTTAGCACTTTGCCTGAGTGCAAGGTTAGCACTTTGCCTGATTGCTAGCTTACCACT : 2094
136 : uCysLeuValAlaSerLeuAlaArgCysLeuValAlaSerLeuAlaLeuCysProGlyAlaS : 156
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uCysLeuSerAlaCysLeuAlaLeuSerLeuValAlaSerLeuAlaLeuCysLeuGlyAlaS
2095 : TTGCCTGAGTGCTTGCTTAGCACTTAGCCTGGTTGCTAGCTTAGCACTTTGCCTGGGTGCCA : 2157
157 : erLeuAlaLeuCysLeuValAlaCysLeuAlaLeuTrpProGlyAlaArgLeuAlaLeuPhe : 176
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erLeuAlaLeuCysLeuArgAlaArgLeuThrArgCysLeuGlyAlaArgLeuThrLeuCys
2158 : GCTTAGCACTTTGCCTGCGTGCTAGGTTAACACGTTGCCTGGGTGCTAGGTTAACACTTTGC : 2217
177 : LeuValAlaArgLeuAlaArgCysLeuValAlaArgLeuThrArgCysLeuValAla : 195
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LeuTyrAlaArgLeuAlaLeuCysLeuValAlaSerLeuAlaLeuCysLeuValAla
2218 : CTGTATGCTAGGTTAGCACTTTGCCTGGTTGCCAGCTTAGCACTTTGCTTGGTTGCT : 2276
vulgar: Compuesta_SLA_LP#drosophila+babesia# 114 195 . Contig3744 2033 2276 + 222 M 81 243
C4 Alignment:
------------
Query: Compuesta_SLA_LP#drosophila+babesia#
Target: Contig3744
Model: protein2genome
Raw score: 220
Query range: 112 -> 201
Target range: 2099 -> 2366
113 : LeuValAlaArgLeuThrLeuArgLeuCysAlaSerLeuAlaLeuCysLeuGlyAlaArgLe : 133
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LeuSerAlaCysLeuAlaLeuSerLeuValAlaSerLeuAlaLeuCysLeuGlyAlaSerLe
2100 : CTGAGTGCTTGCTTAGCACTTAGCCTGGTTGCTAGCTTAGCACTTTGCCTGGGTGCCAGCTT : 2160
134 : uProLeuCysLeuValAlaSerLeuAlaArgCysLeuValAlaSerLeuAlaLeuCysProG : 154
| !!||||||||| !|||!!!|||.!!|||||||||! !|||!!!|||.!!||||||! !
uAlaLeuCysLeuArgAlaArgLeuThrArgCysLeuGlyAlaArgLeuThrLeuCysLeuT
2161 : AGCACTTTGCCTGCGTGCTAGGTTAACACGTTGCCTGGGTGCTAGGTTAACACTTTGCCTGT : 2223
155 : lyAlaSerLeuAlaLeuCysLeuValAlaCysLeuAlaLeuTrpProGlyAlaArgLeuAla : 174
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yrAlaArgLeuAlaLeuCysLeuValAlaSerLeuAlaLeuCysLeuValAlaCysLeuAla
2224 : ATGCTAGGTTAGCACTTTGCCTGGTTGCCAGCTTAGCACTTTGCTTGGTTGCTTGCTTAGCA : 2283
175 : LeuPheLeuValAlaArgLeuAlaArgCysLeuValAlaArgLeuThrArgCysLeuValAl : 195
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LeuTrpProGlyAlaArgLeuAlaLeuCysLeuValAlaArgLeuThrLeuArgLeuCysAl
2284 : CTCTGGCCAGGTGCTAGGTTAGCACTTTGCCTGGTTGCTAGGTTAACACTTCGCCTGTGTGC : 2346
196 : aSerSerThrArgCysLeu : 201
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aSerLeuAlaLeuCysLeu
2347 : CAGCTTAGCACTTTGCCTG : 2366
vulgar: Compuesta_SLA_LP#drosophila+babesia# 112 201 . Contig3744 2099 2366 + 220 M 89 267
C4 Alignment:
------------
Query: Compuesta_SLA_LP#drosophila+babesia#
Target: Contig3744
Model: protein2genome
Raw score: 215
Query range: 112 -> 207
Target range: 2147 -> 2432
113 : LeuValAlaArgLeuThrLeuArgLeuCysAlaSerLeuAlaLeuCysLeuGlyAlaArgLe : 133
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LeuGlyAlaSerLeuAlaLeuCysLeuArgAlaArgLeuThrArgCysLeuGlyAlaArgLe
2148 : CTGGGTGCCAGCTTAGCACTTTGCCTGCGTGCTAGGTTAACACGTTGCCTGGGTGCTAGGTT : 2208
134 : uProLeuCysLeuValAlaSerLeuAlaArgCysLeuValAlaSerLeuAlaLeuCysProG : 154
| !!||||||||| !|||!!!||||||! !||||||||||||||||||||||||||| !!
uThrLeuCysLeuTyrAlaArgLeuAlaLeuCysLeuValAlaSerLeuAlaLeuCysLeuV
2209 : AACACTTTGCCTGTATGCTAGGTTAGCACTTTGCCTGGTTGCCAGCTTAGCACTTTGCTTGG : 2271
155 : lyAlaSerLeuAlaLeuCysLeuValAlaCysLeuAlaLeuTrpProGlyAlaArgLeuAla : 174
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alAlaCysLeuAlaLeuTrpProGlyAlaArgLeuAlaLeuCysLeuValAlaArgLeuThr
2272 : TTGCTTGCTTAGCACTCTGGCCAGGTGCTAGGTTAGCACTTTGCCTGGTTGCTAGGTTAACA : 2331
175 : LeuPheLeuValAlaArgLeuAlaArgCysLeuValAlaArgLeuThrArgCysLeuValAl : 195
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LeuArgLeuCysAlaSerLeuAlaLeuCysLeuGlyAlaArgLeuProLeuCysLeuValAl
2332 : CTTCGCCTGTGTGCCAGCTTAGCACTTTGCCTGGGTGCTAGGTTACCACTTTGCCTGGTTGC : 2394
196 : aSerSerThrArgCysLeuValLysGlyGluSerLeu : 207
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aSerLeuAlaArgCysLeuValAlaSerLeuAlaLeu
2395 : CAGCTTAGCACGTTGCTTGGTTGCTAGCTTAGCACTT : 2432
vulgar: Compuesta_SLA_LP#drosophila+babesia# 112 207 . Contig3744 2147 2432 + 215 M 95 285
C4 Alignment:
------------
Query: Compuesta_SLA_LP#drosophila+babesia#
Target: Contig3744
Model: protein2genome
Raw score: 213
Query range: 122 -> 202
Target range: 2033 -> 2273
123 : AlaSerLeuAlaLeuCysLeuGlyAlaArgLeuProLeuCysLeuValAlaSerLeuAlaAr : 143
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AlaSerLeuAlaLeuCysLeuSerAlaArgLeuAlaLeuCysLeuIleAlaSerLeuProLe
2034 : GCCAGCTTAGCACTTTGCCTGAGTGCAAGGTTAGCACTTTGCCTGATTGCTAGCTTACCACT : 2094
144 : gCysLeuValAlaSerLeuAlaLeuCysProGlyAlaSerLeuAlaLeuCysLeuValAlaC : 164
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uCysLeuSerAlaCysLeuAlaLeuSerLeuValAlaSerLeuAlaLeuCysLeuGlyAlaS
2095 : TTGCCTGAGTGCTTGCTTAGCACTTAGCCTGGTTGCTAGCTTAGCACTTTGCCTGGGTGCCA : 2157
165 : ysLeuAlaLeuTrpProGlyAlaArgLeuAlaLeuPheLeuValAlaArgLeuAlaArgCys : 184
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erLeuAlaLeuCysLeuArgAlaArgLeuThrArgCysLeuGlyAlaArgLeuThrLeuCys
2158 : GCTTAGCACTTTGCCTGCGTGCTAGGTTAACACGTTGCCTGGGTGCTAGGTTAACACTTTGC : 2217
185 : LeuValAlaArgLeuThrArgCysLeuValAlaSerSerThrArgCysLeuVal : 202
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LeuTyrAlaArgLeuAlaLeuCysLeuValAlaSerLeuAlaLeuCysLeuVal
2218 : CTGTATGCTAGGTTAGCACTTTGCCTGGTTGCCAGCTTAGCACTTTGCTTGGTT : 2273
vulgar: Compuesta_SLA_LP#drosophila+babesia# 122 202 . Contig3744 2033 2273 + 213 M 80 240
C4 Alignment:
------------
Query: Compuesta_SLA_LP#drosophila+babesia#
Target: Contig3744
Model: protein2genome
Raw score: 204
Query range: 112 -> 202
Target range: 2195 -> 2465
113 : LeuValAlaArgLeuThrLeuArgLeuCysAlaSerLeuAlaLeuCysLeuGlyAlaArgLe : 133
|||! !||||||||||||||| !!|||! !|||!!!|||||||||||||||! !|||!!!||
LeuGlyAlaArgLeuThrLeuCysLeuTyrAlaArgLeuAlaLeuCysLeuValAlaSerLe
2196 : CTGGGTGCTAGGTTAACACTTTGCCTGTATGCTAGGTTAGCACTTTGCCTGGTTGCCAGCTT : 2256
134 : uProLeuCysLeuValAlaSerLeuAlaArgCysLeuValAlaSerLeuAlaLeuCysProG : 154
| !!|||||||||||||||!!!||||||! !!! ! !! !|||!!!||||||||||||! !!
uAlaLeuCysLeuValAlaCysLeuAlaLeuTrpProGlyAlaArgLeuAlaLeuCysLeuV
2257 : AGCACTTTGCTTGGTTGCTTGCTTAGCACTCTGGCCAGGTGCTAGGTTAGCACTTTGCCTGG : 2319
155 : lyAlaSerLeuAlaLeuCysLeuValAlaCysLeuAlaLeuTrpProGlyAlaArgLeuAla : 174
!|||!!!|||.!!||| !!||| !||| !!|||||||||!! ! !|||||||||||| !!
alAlaArgLeuThrLeuArgLeuCysAlaSerLeuAlaLeuCysLeuGlyAlaArgLeuPro
2320 : TTGCTAGGTTAACACTTCGCCTGTGTGCCAGCTTAGCACTTTGCCTGGGTGCTAGGTTACCA : 2379
175 : LeuPheLeuValAlaArgLeuAlaArgCysLeuValAlaArgLeuThrArgCysLeuValAl : 195
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LeuCysLeuValAlaSerLeuAlaArgCysLeuValAlaSerLeuAlaLeuCysProGlyAl
2380 : CTTTGCCTGGTTGCCAGCTTAGCACGTTGCTTGGTTGCTAGCTTAGCACTTTGCCCGGGTGC : 2442
196 : aSerSerThrArgCysLeuVal : 202
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aSerLeuAlaLeuCysLeuVal
2443 : TAGCTTAGCACTTTGTTTGGTT : 2465
vulgar: Compuesta_SLA_LP#drosophila+babesia# 112 202 . Contig3744 2195 2465 + 204 M 90 270
C4 Alignment:
------------
Query: Compuesta_SLA_LP#drosophila+babesia#
Target: Contig3744
Model: protein2genome
Raw score: 194
Query range: 112 -> 197
Target range: 2339 -> 2594
113 : LeuValAlaArgLeuThrLeuArgLeuCysAlaSerLeuAlaLeuCysLeuGlyAlaArgLe : 133
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LeuCysAlaSerLeuAlaLeuCysLeuGlyAlaArgLeuProLeuCysLeuValAlaSerLe
2340 : CTGTGTGCCAGCTTAGCACTTTGCCTGGGTGCTAGGTTACCACTTTGCCTGGTTGCCAGCTT : 2400
134 : uProLeuCysLeuValAlaSerLeuAlaArgCysLeuValAlaSerLeuAlaLeuCysProG : 154
| !!! !|||||||||||||||||||||! !|||! !! !|||||||||||||||||| !!
uAlaArgCysLeuValAlaSerLeuAlaLeuCysProGlyAlaSerLeuAlaLeuCysLeuV
2401 : AGCACGTTGCTTGGTTGCTAGCTTAGCACTTTGCCCGGGTGCTAGCTTAGCACTTTGTTTGG : 2463
155 : lyAlaSerLeuAlaLeuCysLeuValAlaCysLeuAlaLeuTrpProGlyAlaArgLeuAla : 174
!|||!!!|||||||||!! ! !! !||| ! |||||||||!::! !! !||||||||||||
alAlaCysLeuAlaLeuTrpProGlyAlaArgLeuAlaLeuPheLeuValAlaArgLeuAla
2464 : TTGCTTGCTTAGCACTCTGGCCAGGTGCTAGGTTAGCACTTTTCCTGGTTGCTAGGTTAGCA : 2523
175 : LeuPheLeuValAlaArgLeuAlaArgCysLeuValAlaArgLeuThrArgCysLeuValAl : 195
! !! !|||||||||||||||.!!|||||||||||||||!!!! !|||||||||||||||!.
ArgCysLeuValAlaArgLeuThrArgCysLeuValAlaSerSerThrArgCysLeuValVa
2524 : CGTTGCCTGGTTGCTAGGTTAACACGTTGCCTGGTTGCTAGCTCAACACGTTGCTTGGTAGT : 2586
196 : aSerSer : 197
!! !|||
lTyrSer
2587 : TTACTCA : 2594
vulgar: Compuesta_SLA_LP#drosophila+babesia# 112 197 . Contig3744 2339 2594 + 194 M 85 255
C4 Alignment:
------------
Query: Compuesta_SLA_LP#drosophila+babesia#
Target: Contig3744
Model: protein2genome
Raw score: 192
Query range: 129 -> 207
Target range: 2030 -> 2264
130 : GlyAlaArgLeuProLeuCysLeuValAlaSerLeuAlaArgCysLeuValAlaSerLeuAl : 150
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SerAlaSerLeuAlaLeuCysLeuSerAlaArgLeuAlaLeuCysLeuIleAlaSerLeuPr
2031 : TCCGCCAGCTTAGCACTTTGCCTGAGTGCAAGGTTAGCACTTTGCCTGATTGCTAGCTTACC : 2091
151 : aLeuCysProGlyAlaSerLeuAlaLeuCysLeuValAlaCysLeuAlaLeuTrpProGlyA : 171
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oLeuCysLeuSerAlaCysLeuAlaLeuSerLeuValAlaSerLeuAlaLeuCysLeuGlyA
2092 : ACTTTGCCTGAGTGCTTGCTTAGCACTTAGCCTGGTTGCTAGCTTAGCACTTTGCCTGGGTG : 2154
172 : laArgLeuAlaLeuPheLeuValAlaArgLeuAlaArgCysLeuValAlaArgLeuThrArg : 191
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laSerLeuAlaLeuCysLeuArgAlaArgLeuThrArgCysLeuGlyAlaArgLeuThrLeu
2155 : CCAGCTTAGCACTTTGCCTGCGTGCTAGGTTAACACGTTGCCTGGGTGCTAGGTTAACACTT : 2214
192 : CysLeuValAlaSerSerThrArgCysLeuValLysGlyGluSerLeu : 207
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CysLeuTyrAlaArgLeuAlaLeuCysLeuValAlaSerLeuAlaLeu
2215 : TGCCTGTATGCTAGGTTAGCACTTTGCCTGGTTGCCAGCTTAGCACTT : 2264
vulgar: Compuesta_SLA_LP#drosophila+babesia# 129 207 . Contig3744 2030 2264 + 192 M 78 234
C4 Alignment:
------------
Query: Compuesta_SLA_LP#drosophila+babesia#
Target: Contig3744
Model: protein2genome
Raw score: 190
Query range: 112 -> 202
Target range: 2051 -> 2321
113 : LeuValAlaArgLeuThrLeuArgLeuCysAlaSerLeuAlaLeuCysLeuGlyAlaArgLe : 133
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LeuSerAlaArgLeuAlaLeuCysLeuIleAlaSerLeuProLeuCysLeuSerAlaCysLe
2052 : CTGAGTGCAAGGTTAGCACTTTGCCTGATTGCTAGCTTACCACTTTGCCTGAGTGCTTGCTT : 2112
134 : uProLeuCysLeuValAlaSerLeuAlaArgCysLeuValAlaSerLeuAlaLeuCysProG : 154
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uAlaLeuSerLeuValAlaSerLeuAlaLeuCysLeuGlyAlaSerLeuAlaLeuCysLeuA
2113 : AGCACTTAGCCTGGTTGCTAGCTTAGCACTTTGCCTGGGTGCCAGCTTAGCACTTTGCCTGC : 2175
155 : lyAlaSerLeuAlaLeuCysLeuValAlaCysLeuAlaLeuTrpProGlyAlaArgLeuAla : 174
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rgAlaArgLeuThrArgCysLeuGlyAlaArgLeuThrLeuCysLeuTyrAlaArgLeuAla
2176 : GTGCTAGGTTAACACGTTGCCTGGGTGCTAGGTTAACACTTTGCCTGTATGCTAGGTTAGCA : 2235
175 : LeuPheLeuValAlaArgLeuAlaArgCysLeuValAlaArgLeuThrArgCysLeuValAl : 195
|||! !|||||||||!!!||||||! !|||||||||||| !!|||.!!! !!! ! !! !||
LeuCysLeuValAlaSerLeuAlaLeuCysLeuValAlaCysLeuAlaLeuTrpProGlyAl
2236 : CTTTGCCTGGTTGCCAGCTTAGCACTTTGCTTGGTTGCTTGCTTAGCACTCTGGCCAGGTGC : 2298
196 : aSerSerThrArgCysLeuVal : 202
|!!!! !.!!! !|||||||||
aArgLeuAlaLeuCysLeuVal
2299 : TAGGTTAGCACTTTGCCTGGTT : 2321
vulgar: Compuesta_SLA_LP#drosophila+babesia# 112 202 . Contig3744 2051 2321 + 190 M 90 270
C4 Alignment:
------------
Query: Compuesta_SLA_LP#drosophila+babesia#
Target: Contig3744
Model: protein2genome
Raw score: 171
Query range: 112 -> 189
Target range: 2243 -> 2474
113 : LeuValAlaArgLeuThrLeuArgLeuCysAlaSerLeuAlaLeuCysLeuGlyAlaArgLe : 133
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LeuValAlaSerLeuAlaLeuCysLeuValAlaCysLeuAlaLeuTrpProGlyAlaArgLe
2244 : CTGGTTGCCAGCTTAGCACTTTGCTTGGTTGCTTGCTTAGCACTCTGGCCAGGTGCTAGGTT : 2304
134 : uProLeuCysLeuValAlaSerLeuAlaArgCysLeuValAlaSerLeuAlaLeuCysProG : 154
| !!|||||||||||||||!!!|||.!!! ! !!||| !||||||||||||||||||! !|
uAlaLeuCysLeuValAlaArgLeuThrLeuArgLeuCysAlaSerLeuAlaLeuCysLeuG
2305 : AGCACTTTGCCTGGTTGCTAGGTTAACACTTCGCCTGTGTGCCAGCTTAGCACTTTGCCTGG : 2367
155 : lyAlaSerLeuAlaLeuCysLeuValAlaCysLeuAlaLeuTrpProGlyAlaArgLeuAla : 174
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lyAlaArgLeuProLeuCysLeuValAlaSerLeuAlaArgCysLeuValAlaSerLeuAla
2368 : GTGCTAGGTTACCACTTTGCCTGGTTGCCAGCTTAGCACGTTGCTTGGTTGCTAGCTTAGCA : 2427
175 : LeuPheLeuValAlaArgLeuAlaArgCysLeuValAlaArgLeu : 189
|||! !! !! !|||!!!||||||! !|||||||||||| !!|||
LeuCysProGlyAlaSerLeuAlaLeuCysLeuValAlaCysLeu
2428 : CTTTGCCCGGGTGCTAGCTTAGCACTTTGTTTGGTTGCTTGCTTA : 2474
vulgar: Compuesta_SLA_LP#drosophila+babesia# 112 189 . Contig3744 2243 2474 + 171 M 77 231
C4 Alignment:
------------
Query: Compuesta_SLA_LP#drosophila+babesia#
Target: Contig3744
Model: protein2genome
Raw score: 167
Query range: 138 -> 201
Target range: 2033 -> 2222
139 : AlaSerLeuAlaArgCysLeuValAlaSerLeuAlaLeuCysProGlyAlaSerLeuAlaLe : 159
||||||||||||! !|||||| !|||!!!||||||||||||! ! !||||||||| !!||
AlaSerLeuAlaLeuCysLeuSerAlaArgLeuAlaLeuCysLeuIleAlaSerLeuProLe
2034 : GCCAGCTTAGCACTTTGCCTGAGTGCAAGGTTAGCACTTTGCCTGATTGCTAGCTTACCACT : 2094
160 : uCysLeuValAlaCysLeuAlaLeuTrpProGlyAlaArgLeuAlaLeuPheLeuValAlaA : 180
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uCysLeuSerAlaCysLeuAlaLeuSerLeuValAlaSerLeuAlaLeuCysLeuGlyAlaS
2095 : TTGCCTGAGTGCTTGCTTAGCACTTAGCCTGGTTGCTAGCTTAGCACTTTGCCTGGGTGCCA : 2157
181 : rgLeuAlaArgCysLeuValAlaArgLeuThrArgCysLeuValAlaSerSerThrArgCys : 200
!!||||||! !|||||| !|||||||||||||||||||||! !|||!!!! !|||! !|||
erLeuAlaLeuCysLeuArgAlaArgLeuThrArgCysLeuGlyAlaArgLeuThrLeuCys
2158 : GCTTAGCACTTTGCCTGCGTGCTAGGTTAACACGTTGCCTGGGTGCTAGGTTAACACTTTGC : 2217
201 : Leu : 201
|||
Leu
2218 : CTG : 2222
vulgar: Compuesta_SLA_LP#drosophila+babesia# 138 201 . Contig3744 2033 2222 + 167 M 63 189
C4 Alignment:
------------
Query: Compuesta_SLA_LP#drosophila+babesia#
Target: Contig3744
Model: protein2genome
Raw score: 161
Query range: 112 -> 195
Target range: 2219 -> 2468
113 : LeuValAlaArgLeuThrLeuArgLeuCysAlaSerLeuAlaLeuCysLeuGlyAlaArgLe : 133
||| !|||||||||.!!||| !!||| !|||||||||||||||||||||! !||| !!||
LeuTyrAlaArgLeuAlaLeuCysLeuValAlaSerLeuAlaLeuCysLeuValAlaCysLe
2220 : CTGTATGCTAGGTTAGCACTTTGCCTGGTTGCCAGCTTAGCACTTTGCTTGGTTGCTTGCTT : 2280
134 : uProLeuCysLeuValAlaSerLeuAlaArgCysLeuValAlaSerLeuAlaLeuCysProG : 154
| !!|||!! ! !! !|||!!!||||||! !||||||||||||!!!|||.!!||| !!! !
uAlaLeuTrpProGlyAlaArgLeuAlaLeuCysLeuValAlaArgLeuThrLeuArgLeuC
2281 : AGCACTCTGGCCAGGTGCTAGGTTAGCACTTTGCCTGGTTGCTAGGTTAACACTTCGCCTGT : 2343
155 : lyAlaSerLeuAlaLeuCysLeuValAlaCysLeuAlaLeuTrpProGlyAlaArgLeuAla : 174
!!|||||||||||||||||||||! !||| ! ||| !!|||!! ! !! !|||!!!||||||
ysAlaSerLeuAlaLeuCysLeuGlyAlaArgLeuProLeuCysLeuValAlaSerLeuAla
2344 : GTGCCAGCTTAGCACTTTGCCTGGGTGCTAGGTTACCACTTTGCCTGGTTGCCAGCTTAGCA : 2403
175 : LeuPheLeuValAlaArgLeuAlaArgCysLeuValAlaArgLeuThrArgCysLeuValAl : 195
! !! !|||||||||!!!||||||! !|||! !! !|||!!!|||.!!! !|||||||||||
ArgCysLeuValAlaSerLeuAlaLeuCysProGlyAlaSerLeuAlaLeuCysLeuValAl
2404 : CGTTGCTTGGTTGCTAGCTTAGCACTTTGCCCGGGTGCTAGCTTAGCACTTTGTTTGGTTGC : 2466
196 : a : 195
|
a
2467 : T : 2468
vulgar: Compuesta_SLA_LP#drosophila+babesia# 112 195 . Contig3744 2219 2468 + 161 M 83 249
C4 Alignment:
------------
Query: Compuesta_SLA_LP#drosophila+babesia#
Target: Contig3744
Model: protein2genome
Raw score: 142
Query range: 146 -> 229
Target range: 2033 -> 2282
147 : AlaSerLeuAlaLeuCysProGlyAlaSerLeuAlaLeuCysLeuValAlaCysLeuAlaLe : 167
||||||||||||||||||! !.!!|||!!!|||||||||||||||:!!||| !!||| !!||
AlaSerLeuAlaLeuCysLeuSerAlaArgLeuAlaLeuCysLeuIleAlaSerLeuProLe
2034 : GCCAGCTTAGCACTTTGCCTGAGTGCAAGGTTAGCACTTTGCCTGATTGCTAGCTTACCACT : 2094
168 : uTrpProGlyAlaArgLeuAlaLeuPheLeuValAlaArgLeuAlaArgCysLeuValAlaA : 188
|!! ! !.!!||| !!||||||||| !|||||||||!!!||||||! !||||||! !|||!
uCysLeuSerAlaCysLeuAlaLeuSerLeuValAlaSerLeuAlaLeuCysLeuGlyAlaS
2095 : TTGCCTGAGTGCTTGCTTAGCACTTAGCCTGGTTGCTAGCTTAGCACTTTGCCTGGGTGCCA : 2157
189 : rgLeuThrArgCysLeuValAlaSerSerThrArgCysLeuValLysGlyGluSerLeuAsn : 208
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erLeuAlaLeuCysLeuArgAlaArgLeuThrArgCysLeuGlyAlaArgLeuThrLeuCys
2158 : GCTTAGCACTTTGCCTGCGTGCTAGGTTAACACGTTGCCTGGGTGCTAGGTTAACACTTTGC : 2217
209 : ThrAsnValAspLeuPheArgGluLysIleLysSerLeuGlyValAspSerIleLeuCysLe : 229
! !!!.! ||| ! ! !:!! ||||||!.!:!! !! !:!! !|||||
LeuTyrAlaArgLeuAlaLeuCysLeuValAlaSerLeuAlaLeuCysLeuValAlaCysLe
2218 : CTGTATGCTAGGTTAGCACTTTGCCTGGTTGCCAGCTTAGCACTTTGCTTGGTTGCTTGCTT : 2280
230 : u : 229
|
u
2281 : A : 2282
vulgar: Compuesta_SLA_LP#drosophila+babesia# 146 229 . Contig3744 2033 2282 + 142 M 83 249
-- completed exonerate analysis