Command line: [exonerate -m p2g TRyoeliiNCBI.fa -t contigTR.fa] Hostname: [am75291] C4 Alignment: ------------ Query: TRyoelii ncbi Target: contig 00659 TR:[revcomp] Model: protein2genome Raw score: 3373 Query range: 0 -> 638 Target range: 13744 -> 11830 1 : MetAsnSerValLeuValSerTyrThrPheIleProLysLysTyrLeuLysIleSerLys : 20 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| MetAsnSerValLeuValSerTyrThrPheIleProLysLysTyrLeuLysIleSerLys 13744 : ATGAACTCTGTATTAGTTAGCTATACATTTATTCCGAAAAAATATTTGAAAATCTCAAAA : 13687 21 : ArgTyrIleThrArgAspSerLysIleTyrGlyHisPheAsnThrAsnLysAsnIleTyr : 40 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ArgTyrIleThrArgAspSerLysIleTyrGlyHisPheAsnThrAsnLysAsnIleTyr 13686 : CGATATATTACAAGAGATAGTAAGATATATGGACACTTTAATACTAATAAAAATATTTAT : 13627 41 : PheGlnArgThrTyrLysPheLeuAsnAsnIleAsnSerIleHisSerAsnCysAlaIle : 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| PheGlnArgThrTyrLysPheLeuAsnAsnIleAsnSerIleHisSerAsnCysAlaIle 13626 : 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