Command line: [exonerate -m p2g SLALP_drosophila.fa -t subseq2000contig01707.fa]
Hostname: [am75289]

C4 Alignment:
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         Query: gi|45550694|ref|NP_649556.2| CG1427 CG1427-PA, isoform A [Drosophila melanogaster]
        Target: Plasmodium_yoelii_yoelii_str._17XNL|MALPY01707|2002-09-10|ds-DNA|Plasmodium_yoelii_TIGR:subseq(7000,2000) [revcomp]
         Model: protein2genome
     Raw score: 599
   Query range: 60 -> 380
  Target range: 1571 -> 519

   61 : LeuAspSerAsnAsnTyrProHisLysValGlyLeuGlyGluArgGluAlaArgIleAlaCy :   81
        |||:!!!!!  !|||  !  ! ! !!.:!!  !:!!||||||||||||::!||||||  ! !
        LeuAsnArgCysAsnSerGluLysAsnIleLysIleGlyGluArgGluSerArgIleTyrSe
 1571 : TTAAACAGGTGTAATAGTGAAAAGAATATAAAAATAGGAGAAAGAGAAAGTCGGATATATAG : 1511

   82 : sLysLeuValAlaArgArgHisTyrAsnPheGlyHisGlyIleGly{Ar}  >>>> Targe :   97
        !...:!!|||  !!.!!:!:!!!:!...||||||||||||||||||{||}            
        rSerIleValArgAsnLysTyrPheGlyPheGlyHisGlyIleGly{Ar}++          
 1510 : TTCTATTGTTCGAAATAAATATTTTGGATTTGGTCATGGTATAGGC{AG}gt.......... : 1459

   98 : t Intron 1 >>>>  {g}SerGlyAspLeuLeuGluAlaGlnProLysAlaAlaGlySer :  111
        92 bp            {|}||||||:!!|||  !!!:!.!|||||||||::!||||||!:!
                       ++{g}SerGlyAsnLeuGluAspValGlnProLysSerAlaGlyAsn
 1458 : ...............ag{G}TCAGGAAACTTGGAAGATGTGCAACCCAAAAGCGCAGGGAAC : 1329

  112 : ThrLeuLeuAlaArgLeuThrAsnAlaLeuIleLeuAspLeuIleArgGlyIleGlyLeuPr :  132
        !:!||||||..!!:!:!!|||!..  !:!!:!!  !|||||||||!:!  !.!!|||:!!  
        SerLeuLeuCysLysMetThrThrAsnMetLeuLysAspLeuIleLysThrPheGlyIleLy
 1328 : AGCTTATTGTGTAAAATGACAACGAATATGTTAAAAGATCTAATAAAAACTTTTGGAATAAA : 1266

  133 : oSerCysAlaGlyCysPheLeuValProMetCysThrGlyMetThrLeuThrLeuCysLeuG :  153
        !!.!|||! !! !   !:!:!!:!!|||   ...|||||||||  !:!!!:!  !|||||| 
        sLysCysGluAspValTyrIleLeuProTyrAlaThrGlyMetCysIleSerThrCysLeuL
 1265 : AAAATGTGAAGATGTATATATATTACCATATGCAACTGGTATGTGTATAAGTACATGTTTAT : 1203

  154 : lnSerLeuArgLysArgArgProGlyAlaArgTyrValLeuTrpSerArgIleAspGlnLys :  173
         !! !|||!:!!:!! !|||! !..!::!!:!||||||:!!   ||||||||||||!!.|||
        euTyrLeuLysArgMetArgGlnAsnSerLysTyrValIleIleSerArgIleAspHisLys
 1202 : TATATTTAAAAAGAATGAGACAAAATAGTAAATATGTTATAATATCTCGAATAGATCATAAG : 1143

  174 : SerCysPheLysAlaIleThrAlaThrGlyLeuValProValValIleProCysLeuIleLy :  194
        !!!|||!:!|||..!:!!  !  !  !! !|||  !  !:!!|||:!!  !   :!!.!!!!
        ThrCysTyrLysCysLeuAspPheCysAspLeuLysTyrIleValValAspMetIlePheAs
 1142 : ACTTGTTATAAATGTTTAGATTTCTGTGATCTAAAATATATTGTAGTAGATATGATATTTAA : 1080

  195 : sGlyGluSerLeuAsnThrAsnValAspLeuPheArgGluLysIleLysSerLeuGlyValA :  215
        ...!!!:..!|||||||||:!!! ! !   !.!!..!.!.  !!!:|||!.!|||     !!
        nAsnAspGluLeuAsnThrAspGluLysLysIleGluAsnLeuMetLysLysLeu---LysG
 1079 : TAATGATGAATTAAATACAGATGAAAAAAAAATCGAAAATTTAATGAAAAAATTA---AAGG : 1020

  216 : spSerIleLeuCysLeuTyrThrThrThrSerCysPheAlaProArgAsnSerAspAspIle :  235
        !:!.!|||! !|||:!!   |||..!|||||| !!!:!||||||||||||||||||:!!|||
        luLysIleCysCysIleIleThrValThrSerSerTyrAlaProArgAsnSerAspAsnIle
 1019 : AAAAAATATGTTGTATTATAACAGTCACATCTAGTTATGCACCTAGAAATTCAGATAACATT :  960

  236 : AlaGluValSerLysLeuSerLysGlnTrpGlnIleProHisLeuValAsnAsnAlaTyrGl :  256
          !:!!:!!|||:!!|||!!!!!.:!!!::.!.||||||||||||:!!||||||!.!!:!||
        LeuLysIleSerGlnLeuCysAsnLysTyrAspIleProHisLeuIleAsnAsnGlyPheGl
  959 : TTAAAAATTTCACAATTATGTAATAAATATGATATACCACATCTTATTAATAATGGGTTTGG :  897

  257 : yLeuGlnAlaLysGluIleValAsnGlnLeuGlu<->CysAlaAsnArgValGlyArgIleA :  276
        |||||||..!! ! ! |||  !!!.:!!:!!:!!   |||  !:!!  !  !||||||||||
        yLeuGlnCysThrTyrIleCysLysGluIleGlnLysCysTyrAspSerAsnGlyArgIleA
  896 : TTTACAATGTACATATATATGTAAAGAGATTCAAAAGTGTTATGATTCAAATGGGAGAATAG :  834

  277 : spTyrPheValGlnSerSerAspLysAsnLeuLeuValProValGlySerAlaIleValAla :  296
        ||!:! !!|||||||||!!!|||||||||!!!|||:!!|||:!!..!.!!!.!|||:!!  !
        spPheValValGlnSerCysAspLysAsnPheLeuLeuProIleAsnGlyGlyIleIlePhe
  833 : ATTTTGTTGTTCAAAGTTGTGATAAAAATTTCCTTTTACCAATTAATGGAGGTATTATATTT :  774

  297 : SerPheAsnGluSerValLeuHisAspValAlaSerThrTyrAlaGlyArgAlaSerGlySe :  317
        |||!  |||:!!!.!:!!:!!  !!!::!!  !!.!|||||| !!||||||.!! !!! !!:
        SerSerAsnGlnLysIleMetThrGluLeuLysLysThrTyrProGlyArgThrProValAs
  773 : AGTTCGAATCAAAAAATTATGACCGAATTAAAAAAAACATATCCAGGAAGAACACCAGTTAA :  711

  318 : rGlnSerLeuAspValLeuMetThrLeuLeuSerLeuGlyArgAsnGlyPheArgLeuLeuP :  338
        !   ! !||||||:!!!!!!!:|||||||||..!||||||!:!|||  !.!.! !  !||| 
        nValTyrLeuAspLeuPheIleThrLeuLeuGluLeuGlyLysAsnLysIleMetThrLeuA
  710 : TGTTTACTTAGATTTATTTATTACATTATTAGAATTAGGAAAAAATAAAATAATGACATTAA :  648

  339 : heAspGlnArgGlyGluAsnPheAsnTyrLeuArgGluAsnLeuArgLysPheAlaGluPro :  358
          !!::!!|||! !:!!|||||||||!:::!!!.!|||.!.:!!!:!!!..!...!..!  !
        rgGluGluArgValLysAsnPheAsnTrpIleAsnGluGlnValGlnAsnIleCysSerLys
  647 : GGGAAGAAAGAGTGAAAAATTTTAATTGGATAAATGAACAAGTTCAAAATATATGCTCAAAA :  588

  359 : ArgGlyGluIleValIleAspSerArgPheAsnSerIleSerLeuAlaIleThrLeuAlaTh :  379
          !..!  !! !:!!||| ! !!!! !   |||!.!||||||:!!||||||!.!|||  !!.
        TyrAsnLeuLysLeuIleLysThrThrLysAsnLysIleSerIleAlaIleAsnLeuAsnAs
  587 : TATAATTTAAAATTAATAAAAACAACTAAAAATAAAATATCTATTGCTATAAATCTTAATAA :  525

  380 : rLeu :  380
        !|||
        nLeu
  524 : TTTA :  520

vulgar: gi|45550694|ref|NP_649556.2| 60 380 . Plasmodium_yoelii_yoelii_str._17XNL|MALPY01707|2002-09-10|ds-DNA|Plasmodium_yoelii_TIGR:subseq(7000,2000) 1571 519 - 599 M 36 108 S 0 2 5 0 2 I 0 88 3 0 2 S 1 1 M 115 345 G 1 0 M 54 162 G 0 3 M 113 339
-- completed exonerate analysis