En la búsqueda de selenoproteínas homólogas se han encontrado proteínas homólogas con selenocisteína, homólogas con cisteína y proteínas implicadas en la biosíntesis de selenoproteínas.
Respecto a las selenoproteínas, sólo se han encontrado dos proteínas presentes en Homo sapiens que también contienen el codón selenocisteína en Trypanosoma brucei: SelK y SelT. No es un resultado muy extraño ya que se trata de dos organismos muy alejados evolutivamente.
T.brucei posee también proteínas homólogas con cisteína como son: GPx1, GPx4, MsrA, SelU1 y SelR1. Concretamente en el caso de GPx4 se encontró una triplicación de gen muy conservada que nos sugiere que puede ser una proteína importante en esta especie. Otro caso interesante fue el de SelI. En un primer momento se pensó que era una potencial proteína homóloga con cisteína, pero al analizarla, se vio que T.brucei sólo presenta el mismo dominio funcional en alguna de sus proteínas, aunque no sea homóloga a SelI.
En cuanto a las proteínas implicadas en la biosíntesis de selenoproteínas, se han encontrado sólo dos proteínas homólogas: eEFSec y SPS. Es muy probable que en el organismo T.brucei existan otras proteínas implicadas en este proceso, pero no necesariamente homólogas a las de H.sapiens. Una opción para continuar con el estudio, sería buscar más proteínas de maquinaria homólogas a otras especies más cercanas (por ejemplo L.major) o específicas de T.brucei.
Sin embargo, la búsqueda de nuevas selenoproteínas no descritas en T.brucei fue muy exitosa. Se encontraron 4 posibles selenoproteínas no presentes en el genoma de H.sapiens, las cuales hemos nombrado: SelTBI (posible selenoproteína 1), SelTBII (posible selenoproteína 2), SelTBIII (posible selenoproteína 3) y SelTBIV (posible selenoproteína 4). Estas selenoproteínas fueron predichas a partir de los SECIS potenciales con COVE score mayor de 15, aunque el programa SECISearch fue capaz de predecir hasta 77 posibles elementos SECIS en el genoma de T.brucei. Por lo tanto, otro punto que se podría ampliar en el presente estudio sería comprobar la existencia de selenoproteínas en los elementos SECIS predichos aunque tengan un score más bajo.