Proteïna predita a través de SPS1 i 2 d'humà (SPG00000032_1.0 i SPG00000033_1.0) de la base de dades de SelenoDB. SPS2 va ser utilitzat per a la predicció, conté selenocisteïna i el seu homòleg en Leishmania infantum cisteïna (codificada per TGC).
n° Aminoàcids | Nucleòtid inici | Nucleòtid final | Cromosoma | Strand | |
SPS | 409 | 2159247 | 2158106 | 36 | - |
Funció d'SPS2 d'humà: Enzim necessari per a passar del ió seleni (Se-) i ATP a fosfat de seleni, donador utilitzat per la síntesis de selenocisteïna.
La nostra predicció concorda amb l'identificador LinJ36.5900 del genoma de Leishmania infantum que correspon a "selenophosphat synthetase" (SPS)
n° Aminoàcids | Nucleòtid inici | Nucleòtid final | Cromosoma | Strand | |
SPS | 398 | 2159287 | 2158091 | 36 | - |
SECIS
n° Nucleòtids | Nucleòtid inici | Nucleòtid final | Cove | |
SECIS | 93 | 2158348 | 2158255 | 2,55 (15) |
![]() |
UUCAAGACCGCCGUCGCCGCCUCGAAGCGGAUGAACGAC AAGUACCGCCUCCUCGAAGGGUACUCGGCCGAGACGAGC GGCGGGCUGCUGGUG |
|
Segons els valors obtinguts al programa SECISearch es pot observar que l'element SECIS predit en l'extrem 3' del gen no és vàlid ja que el seu cove és molt inferior al valor de referència (15). |