Muchas proteínas que se unen al RNA de cadena simple, contienen una o más copias de un domino putativo de unión a RNA de aproximadamente unos 90 aminoácidos. Este dominio tiene el nombre de motivo de reconocimiento del RNA, en inglés, RNA recognition motif (RRM). Dentro de este dominio hay dos regiones muy bien conservadas, la primera, es un segmento hidrofóbico de 6 residuos, llamado motivo RNP-2, la segunda región, es un segmento de ocho péptidos, llamado RNP-1.

Zinc finger RanBP2-type signature and profile

El transporte núcleo-citoplasmático está mediado por una estructura supramolecular muy grande, que abarca la cubierta nuclear llamada nuclear pore complexes (NPC). En las vías tanto del núcleo al citoplasma, como del citoplasma al núcleo, intervienen tres componentes: un sustrato, un complejo adaptador y un receptor. El complejo adaptador y el receptor pasan a través del NPC con el sustrato. El transporte nuclear depende del ciclo GTPasa de la proteína GTPasa Ran y de las proteínas de unión a Ran (RanBP). RANBP2 es una de estas proteínas, que está localizada en el lado citoplasmático del NPC. Su función no está muy clara, pero se cree que funciona acoplando la hidrólisis de RanGTP a la translocación de NPC mediante su dominio de unión a Ran (RanBD1). RanBP2 contiene también un cluster de dedos de zinc, el RanBP2 zinc fingers. Se ha demostrado que estos dedos de zinc unen RanGDP y la proteína exportina-1 (receptor de la vía de exportación). El dedo de zinc de RanBP2 se encuentran en diferentes proteínas que están involucradas en el transporte nuclear o que están localizadas en la cubierta nuclear. El dedo de zinc de RanBP2 contiene 4 cisteínas y un triptófano en posición upstream del dedo de zinc.