Vista general

PROMO
Full4
Tots


Full 1: PROMO

Anàlisi (promo / prog) Factor Inici Final Disimilarity Seqüència RE query Score P value
PROMO Elk-1 [T00250] 863 871 0 GGCAGGAAG 0,05 - -
PROMO Sp1 [T00759] 982 991 0 GGGGCGGGGC 0 - -
PROMO Elk-1 [T00250] 185 193 0,13 CTTCCTCCA 0,05 - -
PROMO PR A [T01661] 240 246 0,49 AACTGTT 0,04 - -
PROMO PR B [T00696] 240 246 0,49 AACTGTT 0,04 - -
PROMO RAR-beta [T00721] 511 520 1,08 TGGGTTTGAC 0,02 - -
PROMO IRF-1 [T00423] 208 216 1,27 AAAAGGAAA 0,02 - -
PROMO Sp1 [T00759] 906 915 1,39 TCCCCGCCCT 0,05 - -
PROMO GR [T05076] 163 169 1,44 CAAAAAC 0,04 - -
PROMO GR [T05076] 473 479 1,44 GTTTTTG 0,04 - -
PROMO c-Ets-1 [T00112] 495 501 1,77 TTTCCTA 0,05 - -
PROMO c-Ets-2 [T00113] 284 292 2,14 TTCCTCTAG 0,09 - -
PROMO GCF [T00320] 962 970 2,34 CGCCTGCGC 0,06 - -
PROMO HNF-1C [T01951] 459 467 2,37 ATCAATAAC 0,01 - -
PROMO c-Ets-2 [T00113] 186 194 2,72 TTCCTCCAT 0,05 - -
PROMO c-Ets-2 [T00113] 207 215 2,95 CAAAAGGAA 0,02 - -
PROMO TFIID [T00820] 119 125 3,08 TTTTGCA 0,04 - -
PROMO NF-AT2 [T01945] 128 137 3,2 GGAAACTTTT 0,01 - -
PROMO NF-AT1 [T00550] 750 758 3,41 ACCTTTTCC 0,01 - -
PROMO GCF [T00320] 685 693 3,41 CTCCTGCGC 0,03 - -
PROMO HNF-3alpha [T02512] 54 61 3,5 TAAAAATT 0,06 - -
PROMO IRF-1 [T00423] 124 132 3,6 CAACGGAAA 0,03 - -

Full 2: Full4

Anàlisi (promo / prog) Factor Inici Final Disimilarity Seqüència RE query Score P value
Programa AhR[T01795] 104 111
GGTGAGG
-995,86 0,75
Programa AP-1[T00029] 306 313
GATTCAC
-996,11 0,76
Programa AR[T00040] 148 155
AACAGAA
3,57 0,06
Programa c-Myc[T00140] 301 307
AGGTGG
-995,96 0,77
Programa HIF-1[T01609] 615 624
AGGCCCGTC
-996,31 0,99
Programa HNF-4[T02758] 305 313
GGATTCAC
-995,85 0,82
Programa NF-AT1[T00550] 214 221
GAAAAAA
3,97 0,02
Programa NF-kappaB1[T00593] 520 529
ACAGTCCCT
-995,82 0,65
Programa NRSF[T06124] 844 853
GCAGCAGCC
-996,52 0,73
Programa PU,1[T02068] 867 874
AGGAAGC
3,34 0,17
Programa RXR-alpha[T01345] 315 321
GATCCA
-996,6 1
Programa SRF[T00764] 335 344
TTCTATGTC
-1994 0,64
Programa YY1[T00915] 512 518
TGGGTT
1,96 0,92

Full 3: Tots

Anàlisi (promo / prog) Factor Inici Final Disimilarity Seqüència RE query Score P value
Programa AR[T00040] 148 155
AACAGAA
3,57 0,06
PROMO - - - - - - - -
Programa NF-AT1[T00550] 214 221
GAAAAAA
3,97 0,02
PROMO NF-AT1 [T00550] 213 221 5,13 GGAAAAAAA 0,02 - -
Programa PU,1[T02068] 567 874
AGGAAGC
3,34 0,17
PROMO - - - - - - - -
Programa YY1[T00915] 512 518
TGGGTT
1,96 0,92
PROMO YY1 [T00915] 511 514 0 ATGG 4,25 - -

*Els quadres marcats en blau mostren la falta de concordància respecte els paràmentres que havíem establert anteriorment però per poder comparar les dues aproximacions s'ha cregut convenient d'afegir.