Vista general

PROMO
Programa
Junts


Full 1: PROMO

Anàlisi (promo / prog) Factor Inici Final Disimilarity Seqüència RE query Score P value
PROMO HNF-1B [T01950] 2 10 0 AGTTAATTA 0,01 - -
PROMO TCF-4E [T02878] 603 609 0 CTTTGCT 0,07 - -
PROMO p53 [T00671] 833 839 0 CATGCCC 0,09 - -
PROMO Elk-1 [T00250] 1063 1071 0,13 CTTCCTCCA 0,02 - -
PROMO USF1 [T00874] 835 844 0,43 TGCCCACGTG 0 - -
PROMO IRF-1 [T00423] 1086 1094 1,27 AAAAGGAAA 0,04 - -
PROMO NF-AT1 [T00550] 667 675 1,44 GGAAAAAGT 0,01 - -
PROMO RBP-Jkappa [T01616] 661 672 1,66 TTCATGGGAAAA 0 - -
PROMO T3R-beta1 [T00851] 120 128 2,26 GGGTGGTGA 0,01
-
PROMO USF1 [T00874] 839 848 2,34 CACGTGGCTA 0,01 - -
PROMO LEF-1 [T02905] 603 610 2,35 CTTTGCTG 0,05 - -
PROMO HNF-1C [T01951] 3 11 2,5 GTTAATTAG 0,05 - -
PROMO c-Myb [T00137] 361 368 2,57 GGCAGTTT 0,03 - -
PROMO c-Ets-2 [T00113] 1064 1072 2,72 TTCCTCCAT 0,03 - -
PROMO c-Ets-2 [T00113] 1085 1093 2,95 CAAAAGGAA 0,06 - -
PROMO NF-AT2 [T01945] 667 676 3,04 GGAAAAAGTC 0,03 - -
PROMO NF-AT2 [T01945] 1006 1015 3,2 GGAAACTTTT 0,03 - -
PROMO IRF-1 [T00423] 1002 1010 3,6 CAACGGAAA 0,05 - -

Full 2: Programa

Anàlisi (promo / prog) Factor Inici Final Disimilarity Seqüència RE query Score P value
Prog AhR [T01795] 982 988 - GGTGAGG
-995.8127 0,69
Prog AP-1[T00029] 101 108 - CAGTCAA - 2,48 0,34
Prog AR[T00040] 1026 1033 - AACAGAA - 3,34 0,06
Prog c-Myc [T00140] 841 847 - ACGTGG - 3,82 0,16
Prgo HIF-1 [T01609] 527 536 - ACACACG
-995.3794 0,41
Prog HNF-4 [T02758] 596 604 - GGGCCCT - -995,67 0,52
Prog NF-AT1[T00550] 669 676 - GAAAAAG - 3,39 0,14
Prog NF-kappaB1[T00593] 310 319 - GACTTCCC - 3,72 0,06
Prog NRSF [T06124] 15 21
TCAGAAC
-994.8965 0,14
Prog PU.1 [T02068] 1023 1032 - ACGAACA - -996.4429 0,98
Prog RXR-alpha [T01345] 414 419 - GAACCT
3,13 0,13
Prog SRF[T00764] 345 820 - AGAGATG - -1994.5807 0,21
Prog YY1 [T00915] 178 184
AGAGATG
2,45 0,92

Full 3: Junts

Anàlisi (promo / prog) Factor Inici Final Disimilarity Seqüència RE query Score P value
Prog AP-1[T00029] 101 108 - CAGTCAA - 2,48 0,34
PROMO AP-1[T00029] 98 106 9,26 ATTCAGTCA 0,08 - -
Prog AR[T00040] 1026 1033 - AACAGAA - 3,34 0,06
PROMO AR[T00040] - - - - - - -
Prog c-Myc [T00140] 841 847 - ACGTGG - 3,82 0,16
PROMO c-Myc [T00140] 839 844 0 CACGTG 0,17 - -
Prog NF-AT1[T00550] 667 676 - GAAAAAG - 3,39 0,14
PROMO NF-AT1 [T00550] 667 675 1,44 GGAAAAAGT 0,01 - -
Prog NF-kappaB1[T00593] 310 319 - GACTTCCC - 3,72 0,06
PROMO NF-kappaB1[T00593] - - - - - - -
Prog RXR-alpha [T01345] 414 419 - GAACCT
3,13 0,13
PROMO RXR-alpha [T01345] - - - - - - -
Prog YY1 [T00915] 178 184
AGAGATG
2,45 0,92
PROMO YY1 [T00915] 176 179 0 ATGG 4,02 - -

*Els quadres marcats en blau mostren la falta de concordància respecte els paràmentres que havíem establert anteriorment però per poder comparar les dues aproximacions s'ha cregut convenient d'afegir.