A continuación se muestra una tabla de homología en la que se indican las especies que poseen un gen ortólogo para los genes humanos PML y RARalpha. Los datos mostrados en las tablas han sido obtenidos a partir de las base de datos Ensembl y comparados con los datos de homología de BioMart. Las especies se encuentran ordenadas por % query, que representa la homología de las especies ortólogas respecto a Homo sapiens:
Especie | Ensembl ID | Tipo homología | % Query | % Target |
![]() Pan troglodytes |
ENSPTRG00000007266 | 1-to-1 | 99 | 99 |
![]() Macaca mulatta |
ENSMMUG00000002569 | 1-to-1 | 92 | 92 |
![]() Felis catus |
ENSFCAG00000003098 | 1-to-1 | 78 | 82 |
![]() Bos taurus |
ENSBTAG00000015779 | 1-to-1 | 74 | 75 |
![]() Rattus norvegicus |
ENSRNOG00000008400 | 1-to-1 | 69 | 67 |
![]() Mus musculus |
ENSMUSG00000036986 | 1-to-1 | 68 | 67 |
![]() Tupaia belangeri |
ENSTBEG00000012807 | 1-to-1 | 63 | 69 |
![]() Loxodonta africana |
ENSLAFG00000002717 | 1-to-1 | 53 | 53 |
![]() Oryctolagus cuniculus |
ENSOCUG00000002183 | 1-to-1 | 48 | 49 |
![]() Echinops telfairi |
ENSETEG00000019736 | 1-to-1 | 45 | 46 |
![]() Monodelphis domestica |
ENSMODG00000009808 | 1-to-1 | 42 | 44 |
![]() Canis familiaris |
ENSCAFG00000017858 | 1-to-1 | 38 | 76 |
![]() Dasypus novemcinctus |
ENSDNOG00000009847 | 1-to-1 | 35 | 56 |
![]() Cavia porcellus |
ENSCPOG00000001304 | 1-to-1 | 29 | 48 |
![]() Ornithorhynchus anatinus |
ENSOANG00000008921 | 1-to-1 | 19 | 51 |
![]() Gallus gallus |
ENSGALG00000001398 | 1-to-many | 18 | 42 |
Como podemos observar en la tabla de homología hay un total de 16 especies que poseen un gen ortólogo para PML, lo cual es un indicador de que este gen se encuentra conservado a lo largo del ciclo evolutivo y su función debe ser esencial para muchos organismos. Las especies que comparten una mayor similitud respecto a PML humano son Pan troglodytes y Macaca mulatta, hecho que parece bastante coherente ya que pertenecen al mismo grupo filogenético que Homo sapiens.
A pesar de existir muchas especies homólogas para este gen, la gran mayorí no superan el 70% de similitud lo cual nos puede llevar a pensar que se trate del mismo gen funcional pero que ha acumulado numerosas mutaciones sinónimas.
Observamos como en el caso de Gallus gallus existe homología 1-to-many, lo que quiere decir que se ha producido un proceso de duplicación en el gen PML de esta especie a parte del proceso de especiación que ha dado lugar a este ortólogo. El resto serían homologías 1-to-1, ya que es el hecho más probable al tratarse de una comparación entre una sola copia de cada especie.
Especie | Ensembl ID | Tipo homología | % Query | % Target |
![]() Macaca mulatta |
ENSMMUG00000012486 | 1-to-1 | 97 | 98 |
![]() Pan troglodytes |
ENSPTRG00000009120 | 1-to-1 | 93 | 98 |
![]() Loxodonta africana |
ENSLAFG00000016234 | 1-to-1 | 70 | 78 |
![]() Echinops telfairi |
ENSETEG00000013732 | 1-to-1 | 64 | 85 |
![]() Erinaceus europaeus |
ENSEEUG00000006607 | 1-to-1 | 60 | 62 |
![]() Mus musculus |
ENSMUSG00000037992 | 1-to-1 | 54 | 74 |
![]() Rattus norvegicus |
ENSRNOG00000009972 | 1-to-1 | 54 | 74 |
![]() Canis familiaris |
ENSCAFG00000016060 | 1-to-1 | 54 | 71 |
![]() Monodelphis domestica |
ENSMODG00000013112 | 1-to-1 | 53 | 73 |
![]() Takifugu rubripes |
SINFRUG00000142757 | 1-to-many | 52 | 73 |
![]() Tetraodon nigroviridis |
GSTENG00024106001 | 1-to-1 | 52 | 48 |
![]() Xenopus tropicalis |
ENSXETG00000024390 | 1-to-1 | 51 | 71 |
![]() Oryctolagus cuniculus |
ENSOCUG00000004903 | 1-to-1 | 49 | 96 |
![]() Gasterosteus aculeatus |
ENSGACG00000005297 | 1-to-1 | 48 | 64 |
![]() Danio rerio |
ENSDARG00000056783 | 1-to-many | 40 | 74 |
![]() Dasypus novemcinctus |
ENSDNOG00000011604 | 1-to-1 | 37 | 39 |
![]() Ciona savignyi |
ENSCSAVG00000006794 | 1-to-many | 35 | 37 |
![]() Oryzias latipes |
ENSORLG00000004373 | 1-to-1 | 34 | 76 |
![]() Ciona intestinalis |
ENSCING00000006945 | 1-to-many | 34 | 34 |
![]() Cavia porcellus |
ENSCPOG00000007730 | 1-to-1 | 27 | 50 |
![]() Ornithorhynchus anatinus |
ENSOANG00000012527 | 1-to-1 | 19 | 58 |
![]() Gallus gallus |
ENSGALG00000005629 | 1-to-1 | 8 | 54 |
La tabla anterior muestra los resultados de homología para el gen RARalpha. Podemos observar un total de 22 especies homológas, que como en el caso del gen PML, puede indicarnos la necesidad de conservación de este gen debido a la importancia de su función.
En este caso, las especies más similares respecto a este gen son de nuevo Macaca mulatta y Pan troglodytes, ya que como hemos dicho anteriormente, pertenecen también a la familia de los homínidos.
También podemos observar una gran cantidad de especies con un porcentaje de homología bastante bajo, en base a la idea de que la funcionalidad del gen se conserva pero presenta modificaciones silentes.
Respecto al gen RARalpha, encontramos 4 especies (Danio rerio, Takifugu rubripes, Ciona savignyi y Ciona intestinalis) que presentan un tipo de homología 1-to-many, que por tanto, tendrán varias copias para el gen RARalpha en su genoma.