Transcrit OTTHUMT00000267016

Seqüència de la proteïna:

MRSKGRARKLATNNECVYGNYPEIPLEEMPDADGVASTPSLNIQEPCSPATSSEAFTPKE
GSPYKAPIYIPDDIPIPAEFELRESNMPGAGLGIWTKRKIEVGEKFGPYVGEQRSNLKDP
SYGWEVHLPRSRRVSVHSWLYLGKRSSDVGIAFSQADVYMPGLQCAFLS

Esquema dels exons:

El transcrit que codifica per la proteïna MDS1 està format per 5 exons. D'aquests, 2 sòn totalment no codificants i dos més són parcialment codificants i no codificants. De manera que, només presenta l'exó 3 completament codificant. Concretament es correspon amb l'exó que codifica per la part de la proteïna MDS1 present en la proteïna de fusió.

Localització al cromosoma 21:   170,349,580 - 170,864,168

Seqüència nucleotídica:

acgt seqüència intrònica acgt seqüència 5' upstream i 3' downstream
ACGT seqüència exònica codificant ACGT seqüència exònica no codificant (UTRs)

Regió N° nucleotids Seqüència
5' upstream 
aagtgataaatcgctccaaactttttttggcggcgctgagatgttggaggggcgtctagc
Exó 1 10 
GCGCATGTGC
Intró 1-2 1 
g
Exó 2 340 
AAGGTGTCCAAACTGACAATGCTGGAGAGATAGCGAGTGTGGATTGAGAGAAAGGGAGAG
AGGGAGGGAGAGAGAGTGAAAGAAGAAAATACAGAGAGTGAGTGTGTGGAAGAGAGAGAG
AAACAGGAGAGAAACAGGAGGGAGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG
AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACAGGAGAGAGAGGGAGGGAGCGAGAGGGAGAGCAAAAGA
AGGAAAGGATCCAAGAAAAAAAAGCCCCAACCACACACCAGCGGCTGCAGGACTGGGCAC
AGCATGAGATCCAAAGGCAGGGCAAGGAAACTGGCCACAA
Intró 2-3 281.811 
gtaggtgcaatatcccttttctattggcttttccccctcctctgccatcttgcatatctg
............................................................
ctgtggaattttgtctcttcaatatcagaaggaattcatgaagttcttatttattcacag
Exó 3 338 
ATAATGAGTGTGTATATGGCAACTACCCTGAAATACCTTTGGAAGAAATGCCAGATGCAG
ATGGAGTAGCCAGCACTCCCTCCCTCAATATTCAAGAGCCATGCTCTCCTGCCACATCCA
GTGAAGCATTCACTCCAAAGGAGGGTTCTCCTTACAAAGCCCCCATCTACATCCCTGATG
ATATCCCCATTCCTGCTGAGTTTGAACTTCGAGAGTCAAATATGCCTGGGGCAGGACTAG
GAATATGGACCAAAAGGAAGATCGAAGTAGGTGAAAAGTTTGGGCCTTATGTGGGAGAGC
AGAGGTCAAACCTGAAAGACCCCAGTTATGGATGGGAG
Intró 3-4 231.431 
gtaagaatgtattttgagttaacacatttatatattgcagctgtgtaaagaagagattgt
............................................................
cgataatgatgatattaatataataataatgatgatgcaatgaattctccattcttctag
Exó 4 153 
GTACATCTTCCAAGGTCTCGGAGGGTAAGCGTTCACTCTTGGTTGTATTTGGGGAAGAGA
AGCTCAGACGTAGGAATAGCCTTCTCTCAGGCTGATGTCTACATGCCTGGACTGCAGTGT
GCCTTCCTCTCGTAGCTCGGAAGGACGCGGAAC
Intró 4-5 61 
ggcgggcgaggcggaaggcagagctgtgttgccggcgcctggcgggcagaggcgggttca
c
Exó 5 444 
CTGGGTGGCTGGAGCCGCCGGCGCTGCGCTTTATTTCGGAGCGCAATGCCATCTACCGGC
GTCCTGCCGTACCTGCAAGTATCCAGACCTTGAAAGTCGCTCCGCCTCCCCCCACCCGAA
GCCAATATAGGGGAAAAAACTCGGAGGCCCTTTCCACGAAATCCTAATTTAGCCAGGACC
TGCCAATGATTCCAGACGACCTTTTGTTTTCCTACCGACGTTTCCTCGTTTTGAAAGCAG
TTTTGTAAAGGGCAAGGAGGTGGGGGCCGCAGGGTTGGGGCGCTGAGCTCCCAGACCCCC
TGATCAGGCCGCACTGTCTGAAGCAATCGGTTCCCCAGATTACTTGTATTTAATACACAA
TGCATCATAAAACAAATCCCTCATCCTGACAGGAAGAAAATAGAACAGCTCATAGCTCGA
GCCGGTCCAATTTATGGCTAAATT
3' downstream 
aaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaaagctccgacaatgggcaagttgagggagggcaggaaa