A diferència del transcrit principal aquest només presenta 5 exons. El primer exó es correspondria a l'exó 3 del transcrit principal. El codó que codifica pel primer aminoàcid d'aquest exó està format per l'últim nucleòtid de l'exó 2 i els dos primers nucleòtids de l'exó tres. Per això, aquest nou transcrit comença la traducció a una metionina que hi ha 16 residus upstream. Els exons 2, 3 i 4 són idèntics als exons 4, 5 i 6 del transcrit principal. L'exó 5 es trobaria a la regió intrònica entre els exons 6 i 7 del transcrit principal. També presenta dues regions UTRs al principi de l'exó 1 i al final de l'exó 5.
Regió |
N° nucleotids |
Seqüència |
5' upstream |
|
aatggaattcctccggccgggcttacagtaaaagcacgttcatttccaggcactctcatt |
Exó 1 |
1.848 |
CATAGAGCCAGCGGGCGCGGGCGGGACGGGCGCCCCGCGGCCGGACCCAGCCAGGGCACC
ACGCTGCCCGGCCCTGCGCCGCCAGGCACTTCTTTCCGGGGCTCCTAGGGACGCCAGAAG
GAAGTCAACCTCTGCTGCTTCTCCTTGGCCTGCGTTGGACCTTCCTTTTTTTGTTGTTTT
TTTTTGTTTTTCCCCTTTCTTCCTTTTGAATTAACTGGCTTCTTGGCTGGATGTTTTCAA
CTTCTTTCCTGGCTGCGAACTTTTCCCCAATTGTTTTCCTTTTACAACAGGGGGAGAAAG
TGCTCTGTGGTCCGAGGCGAGCCGTGAAGTTGCGTGTGCGTGGCAGTGTGCGTGGCAGGA
TGTGCGTGCGTGTGTAACCCGAGCCGCCCGATCTGTTTCGATCTGCGCCGCGGAGCCCTC
CCTCAAGGCCCGCTCCACCTGCTGCGGTTACGCGGCGCTCGTGGGTGTTCGTGCCTCGGA
GCAGCTAACCGGCGGGTGCTGGGCGACGGTGGAGGAGTATCGTCTCGCTGCTGCCCGAGT
CAGGGCTGAGTCACCCAGCTGATGTAGACAGTGGCTGCCTTCCGAAGAGTGCGTGTTTGC
ATGTGTGTGACTCTGCGGCTGCTCAACTCCCAACAAACCAGAGGACCAGCCACAAACTTA
ACCAACATCCCCAAACCCGAGTTCACAGATGTGGGAGAGCTGTAGAACCCTGAGTGTCAT
CGACTGGGCCTTCTTATGATTGTTGTTTTAAGATTAGCTGAAGATCTCTGAAACGCTGAA
TTTTCTGCACTGAGCGTTTTGACAGAATTCATTGAGAGAACAGAGAACATGACAAGTACT
TCTAGCTCAGCACTGCTCCAACTACTGAAGCTGATTTTCAAGGCTACTTAAAAAAATCTG
CAGCGTACATTAATGGATTTCTGTTGTGTTTAAATTCTCCACAGATTGTATTGTAAATAT
TTTATGAAGTAGAGCATATGTATATATTTATATATACGTGCACATACATTAGTAGCACTA
CCTTTGGAAGTCTCAGCTCTTGCTTTTCGGGACTGAAGCCAGTTTTGCATGATAAAAGTG
GCCTTGTTACGGGAGATAATTGTGTTCTGTTGGGACTTTAGACAAAACTCACCTGCAAAA
AACTGACAGGCATTAACTACTGGAACTTCCAAATAATGTGTTTGCTGATCGTTTTACTCT
TCGCATAAATATTTTAGGAAGTGTATGAGAATTTTGCCTTCAGGAACTTTTCTAACAGCC
AAAGACAGAACTTAACCTCTGCAAGCAAGATTCGTGGAAGATAGTCTCCACTTTTTAATG
CACTAAGCAATCGGTTGCTAGGAGCCCATCCTGGGTCAGAGGCCGATCCGCAGAACCAGA
ACGTTTTCCCCTCCTGGACTGTTAGTAACTTAGTCTCCCTCCTCCCCTAACCACCCCCGC
CCCCCCCCACCCCCCGCAGTAATAAAGGCCCCTGAACGTGTATGTTGGTCTCCCGGGAGC
TGCTTGCTGAAGATCCGCGCCCCTGTCGCCGTCTGGTAGGAGCTGTTTGCAGGGTCCTAA
CTCAATCGGCTTGTTGTGATGCGTATCCCCGTAGATGCCAGCACGAGCCGCCGCTTCACG
CCGCCTTCCACCGCGCTGAGCCCAGGCAAGATGAGCGAGGCGTTGCCGCTGGGCGCCCCG
GACGCCGGCGCTGCCCTGGCCGGCAAGCTGAGGAGCGGCGACCGCAGCATGGTGGAGGTG
CTGGCCGACCACCCGGGCGAGCTGGTGCGCACCGACAGCCCCAACTTCCTCTGCTCCGTG
CTGCCTACGCACTGGCGCTGCAACAAGACCCTGCCCATCGCTTTCAAG |
Intró 1-2 |
6.129 |
gtactggcccggagagggtggtgggaggacaggcggaggccggcgaggccgggggagatc
............................................................
ccctaaaagtgtatgtataacatccctgatgtctgcatttgtcctttgactggtgtttag |
Exó 2 |
157 |
GTGGTGGCCCTAGGGGATGTTCCAGATGGCACTCTGGTCACTGTGATGGCTGGCAATGAT
GAAAACTACTCGGCTGAGCTGAGAAATGCTACCGCAGCCATGAAGAACCAGGTTGCAAGA
TTTAATGACCTCAGGTTTGTCGGTCGAAGTGGAAGAG |
Intró 2-3 |
20.978 |
gtacgttatctgtcaaaactatgcttgaaacacgtttcatggcaacaaacccacatttca
............................................................
caacagatatgttcaggccaccaacctcattctgttttgttctctatcgtgtccccacag |
Exó 3 |
105 |
GGAAAAGCTTCACTCTGACCATCACTGTCTTCACAAACCCACCGCAAGTCGCCACCTACC
ACAGAGCCATCAAAATCACAGTGGATGGGCCCCGAGAACCTCGAA |
Intró 3-4 |
24.872 |
gtaagtgcatccacttggggctggtacaccctccaggctggtacaccctccaggctggta
............................................................
gatctcttccctccctccttccctccccccatcccctcccctccctgctccccacaatag |
Exó 4 |
192 |
GACATCGGCAGAAACTAGATGATCAGACCAAGCCCGGGAGCTTGTCCTTTTCCGAGCGGC
TCAGTGAACTGGAGCAGCTGCGGCGCACAGCCATGAGGGTCAGCCCACACCACCCAGCCC
CCACGCCCAACCCTCGTGCCTCCCTGAACCACTCCACTGCCTTTAACCCTCAGCCTCAGA
GTCAGATGCAGG |
Intró 4-5 |
12.713 |
gtaagtaccagatggagcccactgcccgcctctcctgcacctgggccaccacccacaact
............................................................
ctctataaagaattgtccttattttcgaactttctccctggtcacacatggctccctcag |
Exó 5 |
420 |
AGGAAGACACAGCACCCTGGAGATGTTAAGGCAGAAGTCAGTTCTTCTGTCCATCCCTCT
CCCCAGCCAGGATAGAGCTATCTTTTCCATCTCATCCTCAGAAGAGACTCAGAAGAAAGA
TGACAGCCCTCAGAATGCACGTTATGAGGAAGGCAGAATGTGGGTCTGTAATTCCTCCGT
GTCCCTTCTCCCCCTCTGCAAACCGTCGTAACAATAATAGTTCCTAACACATGGGACAAT
TGTGAGGATTAAATGAGTTAGCCTGCAGAAATCACTTGATGCACAGCACATGGGAAGCAT
TGTGTGTATTTATTAATCCTTCACAAAGTCTTTGAGATATATTTTTATCAAATATTTAGC
ATGGATCCCGGTACACTTTCAATACTTAATAAATGGTCAATGTTATTCTTTTTCACTATT |
3' downstream |
|
attgctatttatgtgctcttattggcggcattgttgtatcaccagttagttgtacccatc |