En comparació amb del transcrit principal aquest també presenta 8 exons, però no tots coincideixen. El primer exó es correspondria a l'exó 3 del transcrit principal. El codó que codifica pel primer aminoàcid d'aquest exó està format per l'últim nucleòtid de l'exó 2 i els dos primers nucleòtids de l'exó tres. Per això, aquest nou transcrit comença la traducció a una metionina que hi ha 16 residus upstream. Els exons 2, 3, 4 i 5 són idèntics als exons 4, 5, 6 i 7 del transcrit principal. L'exó 6 és pràcticament igual a l'exó 8 del transcrit principal, però acaba abans i dóna peu a la transcripció dels últims 2 exons que es trobarien a la regió UTR final de l'exó 8 del transcrit principal. També presenta una regió UTR al principi de l'exó 1.
Regió |
N° nucleotids |
Seqüència |
5' upstream |
|
aatggaattcctccggccgggcttacagtaaaagcacgttcatttccaggcactctcatt |
Exó 1 |
1.848 |
CATAGAGCCAGCGGGCGCGGGCGGGACGGGCGCCCCGCGGCCGGACCCAGCCAGGGCACC
ACGCTGCCCGGCCCTGCGCCGCCAGGCACTTCTTTCCGGGGCTCCTAGGGACGCCAGAAG
GAAGTCAACCTCTGCTGCTTCTCCTTGGCCTGCGTTGGACCTTCCTTTTTTTGTTGTTTT
TTTTTGTTTTTCCCCTTTCTTCCTTTTGAATTAACTGGCTTCTTGGCTGGATGTTTTCAA
CTTCTTTCCTGGCTGCGAACTTTTCCCCAATTGTTTTCCTTTTACAACAGGGGGAGAAAG
TGCTCTGTGGTCCGAGGCGAGCCGTGAAGTTGCGTGTGCGTGGCAGTGTGCGTGGCAGGA
TGTGCGTGCGTGTGTAACCCGAGCCGCCCGATCTGTTTCGATCTGCGCCGCGGAGCCCTC
CCTCAAGGCCCGCTCCACCTGCTGCGGTTACGCGGCGCTCGTGGGTGTTCGTGCCTCGGA
GCAGCTAACCGGCGGGTGCTGGGCGACGGTGGAGGAGTATCGTCTCGCTGCTGCCCGAGT
CAGGGCTGAGTCACCCAGCTGATGTAGACAGTGGCTGCCTTCCGAAGAGTGCGTGTTTGC
ATGTGTGTGACTCTGCGGCTGCTCAACTCCCAACAAACCAGAGGACCAGCCACAAACTTA
ACCAACATCCCCAAACCCGAGTTCACAGATGTGGGAGAGCTGTAGAACCCTGAGTGTCAT
CGACTGGGCCTTCTTATGATTGTTGTTTTAAGATTAGCTGAAGATCTCTGAAACGCTGAA
TTTTCTGCACTGAGCGTTTTGACAGAATTCATTGAGAGAACAGAGAACATGACAAGTACT
TCTAGCTCAGCACTGCTCCAACTACTGAAGCTGATTTTCAAGGCTACTTAAAAAAATCTG
CAGCGTACATTAATGGATTTCTGTTGTGTTTAAATTCTCCACAGATTGTATTGTAAATAT
TTTATGAAGTAGAGCATATGTATATATTTATATATACGTGCACATACATTAGTAGCACTA
CCTTTGGAAGTCTCAGCTCTTGCTTTTCGGGACTGAAGCCAGTTTTGCATGATAAAAGTG
GCCTTGTTACGGGAGATAATTGTGTTCTGTTGGGACTTTAGACAAAACTCACCTGCAAAA
AACTGACAGGCATTAACTACTGGAACTTCCAAATAATGTGTTTGCTGATCGTTTTACTCT
TCGCATAAATATTTTAGGAAGTGTATGAGAATTTTGCCTTCAGGAACTTTTCTAACAGCC
AAAGACAGAACTTAACCTCTGCAAGCAAGATTCGTGGAAGATAGTCTCCACTTTTTAATG
CACTAAGCAATCGGTTGCTAGGAGCCCATCCTGGGTCAGAGGCCGATCCGCAGAACCAGA
ACGTTTTCCCCTCCTGGACTGTTAGTAACTTAGTCTCCCTCCTCCCCTAACCACCCCCGC
CCCCCCCCACCCCCCGCAGTAATAAAGGCCCCTGAACGTGTATGTTGGTCTCCCGGGAGC
TGCTTGCTGAAGATCCGCGCCCCTGTCGCCGTCTGGTAGGAGCTGTTTGCAGGGTCCTAA
CTCAATCGGCTTGTTGTGATGCGTATCCCCGTAGATGCCAGCACGAGCCGCCGCTTCACG
CCGCCTTCCACCGCGCTGAGCCCAGGCAAGATGAGCGAGGCGTTGCCGCTGGGCGCCCCG
GACGCCGGCGCTGCCCTGGCCGGCAAGCTGAGGAGCGGCGACCGCAGCATGGTGGAGGTG
CTGGCCGACCACCCGGGCGAGCTGGTGCGCACCGACAGCCCCAACTTCCTCTGCTCCGTG
CTGCCTACGCACTGGCGCTGCAACAAGACCCTGCCCATCGCTTTCAAG |
Intró 1-2 |
6.129 |
gtactggcccggagagggtggtgggaggacaggcggaggccggcgaggccgggggagatc
............................................................
ccctaaaagtgtatgtataacatccctgatgtctgcatttgtcctttgactggtgtttag |
Exó 2 |
157 |
GTGGTGGCCCTAGGGGATGTTCCAGATGGCACTCTGGTCACTGTGATGGCTGGCAATGAT
GAAAACTACTCGGCTGAGCTGAGAAATGCTACCGCAGCCATGAAGAACCAGGTTGCAAGA
TTTAATGACCTCAGGTTTGTCGGTCGAAGTGGAAGAG |
Intró 2-3 |
20.978 |
gtacgttatctgtcaaaactatgcttgaaacacgtttcatggcaacaaacccacatttca
............................................................
caacagatatgttcaggccaccaacctcattctgttttgttctctatcgtgtccccacag |
Exó 3 |
105 |
GGAAAAGCTTCACTCTGACCATCACTGTCTTCACAAACCCACCGCAAGTCGCCACCTACC
ACAGAGCCATCAAAATCACAGTGGATGGGCCCCGAGAACCTCGAA |
Intró 3-4 |
24.872 |
gtaagtgcatccacttggggctggtacaccctccaggctggtacaccctccaggctggta
............................................................
gatctcttccctccctccttccctccccccatcccctcccctccctgctccccacaatag |
Exó 4 |
192 |
GACATCGGCAGAAACTAGATGATCAGACCAAGCCCGGGAGCTTGTCCTTTTCCGAGCGGC
TCAGTGAACTGGAGCAGCTGCGGCGCACAGCCATGAGGGTCAGCCCACACCACCCAGCCC
CCACGCCCAACCCTCGTGCCTCCCTGAACCACTCCACTGCCTTTAACCCTCAGCCTCAGA
GTCAGATGCAGG |
Intró 4-5 |
34.947 |
gtaagtaccagatggagcccactgcccgcctctcctgcacctgggccaccacccacaact
............................................................
aagacattttttaaatcccaccccactttacatataattgacctttctgattctcttcag |
Exó 5 |
162 |
ATACAAGGCAGATCCAACCATCCCCACCGTGGTCCTACGATCAGTCCTACCAATACCTGG
GATCCATTGCCTCTCCTTCTGTGCACCCAGCAACGCCCATTTCACCTGGACGTGCCAGCG
GCATGACAACCCTCTCTGCAGAACTTTCCAGTCGACTCTCAA |
Intró 5-6 |
6.690 |
gtaagccacttgaaaacacattctttgcagctgagctggggtggaaggtccaggagacta
............................................................
gagctgtggcctccgcaacctcctactcacttccgctccgttctcttgcccgccctgcag |
Exó 6 |
443 |
CGGCACCCGACCTGACAGCGTTCAGCGACCCGCGCCAGTTCCCCGCGCTGCCCTCCATCT
CCGACCCCCGCATGCACTATCCAGGCGCCTTCACCTACTCCCCGACGCCGGTCACCTCGG
GCATCGGCATCGGCATGTCGGCCATGGGCTCGGCCACGCGCTACCACACCTACCTGCCGC
CGCCCTACCCCGGCTCGTCGCAAGCGCAGGGAGGCCCGTTCCAAGCCAGCTCGCCCTCCT
ACCACCTGTACTACGGCGCCTCGGCCGGCTCCTACCAGTTCTCCATGGTGGGCGGCGAGC
GCTCGCCGCCGCGCATCCTGCCGCCCTGCACCAACGCCTCCACCGGCTCCGCGCTGCTCA
ACCCCAGCCTCCCGAACCAGAGCGACGTGGTGGAGGCCGAGGGCAGCCACAGCAACTCCC
CCACCAACATGGCGCCCTCCGCG |
Intró 6-7 |
4 |
cgcc |
Exó 7 |
13 |
TGGAGGAGGCCGT |
Intró 7-8 |
95 |
gtggaggccctactgaggcgccaggcctggcccggctgggccccgcgggccgccgccttc
gcctccgggcgcgcgggcctcctgttcgcgacaag
|
Exó 8 |
77 |
CCCGCCGGGATCCCGGGCCCTGGGCCCGGCCACCGTCCTGGGGCCGAGGGCGCCCGACGG
CCAGGATCTCGCTGTAG |
3' downstream |
|
gtcaggcccgcgcagcctcctgcgcccagaagcccacgccgccgccgtctgctggcgccc |