ALIGNMENT 1/1
	SCORE: 323691
	STRAND: +
	base: 682-4122 (3441 bps)
	second: 3-3445 (3443 bps)
	CONSERVATION (:base: stats)
		Matches = 99.45% (3422/3441)
		Mismatches =  0.55% (19/3441)
		Gapped nucleotides = 0.00% (0/3441)
		base: 682-4122 (3441 bps)
		second: 3-3445 (3443 bps)

               690       700       710       720       730       740 
base     ACGATACAAAACAGAAGCAGTAACGGAAGTTTCCAATGTGTTTGATATTTGTGTTGCCAT
         |||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||
second   ACGATACAAAACAGAAGCAGTAACGGAAGTTTCTAATGTGTTTGATATTTGTGTTGCCAT
               10        20        30        40        50        60  

               750       760       770       780       790       800 
base     TGTATGTTGAATTCCTTTTGTCAATCTTATTGCATGTTCGAAATTGCATAAATTTGGGCC
         |||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||:||||
second   TGTATGTTGAATTCCGTTTGTCAATCTTATTGCATGTTCGAAATTGAATAAATTTAGGCC
               70        80        90       100       110       120  

               810       820        830       840       850       860
base     GTAATTTTCCGACTTTTTT-GAATTTTCGTTCATCTCTTTAATTGTTGATGTTGTCTAGG
         ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||:
second   GTAATTTTCCGACTTTTTTTGAATTTTCGTTCATCTATTTAATTGTTGATGTTGTCTAGT
              130       140       150       160       170       180  

                870       880       890       900       910       920
base     GAGACAGCTTTATTGAATTTCAATGACATGTCGCCATTTACGTGTACATCAGAATAAAAA
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   GAGACAGCTTTATTGAATTTCAATGACATGTCGCCATTTACGTGTACATCAGAATAAAAA
              190       200       210       220       230       240  

                930       940       950       960       970       980
base     GATAATTCCGGCAAATAGTTTCAATTTATATATATTACATCCAGATTTACATTAACAAAG
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||
second   GATAATTCCGGCAAATAGTTTCAATTTATATATATTAAATCCAGATTTACATTAACAAAG
              250       260       270       280       290       300  

                990      1000      1010      1020      1030      1040
base     CATGCCTTCTATAAACAAAAGGAAATTCTATATTCTCTCAATACTCCATATCTACATGAT
         ||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   CACGCCTTCTATAAACAAAAGGAAATTCTATATTCTCTCAATACTCCATATCTACATGAT
              310       320       330       340       350       360  

               1050      1060      1070      1080      1090      1100
base     GGATCTTCCCTATAACCGCCCCCGTTTCCCCCCGTTTGCTATCACCGGTCTACCTAGTGC
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   GGATCTTCCCTATAACCGCCCCCGTTTCCCCCCGTTTGCTATCACCGGTCTACCTAGTGC
              370       380       390       400       410       420  

               1110      1120      1130      1140      1150      1160
base     GGCCAAACTGAAACGAGCAATTTCTCGGGCCTTTGTCTGCTATGACCAGTTTTGCGATGA
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   GGCCAAACTGAAACGAGCAATTTCTCGGGCCTTTGTCTGCTATGACCAGTTTTGCGATGA
              430       440       450       460       470       480  

               1170      1180      1190      1200      1210      1220
base     ACTCCTACAATATCAGCAAAGGTGGACGGATTGGGTGTTCGACCACGGATTTGCAGAAGC
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   ACTCCTACAATATCAGCAAAGGTGGACGGATTGGGTGTTCGACCACGGATTTGCAGAAGC
              490       500       510       520       530       540  

               1230      1240      1250      1260      1270      1280
base     CATAGAAGACATGGCTCTGGTGTTCCAGATTGAACCTTGCCTTCATGGTCCCCGAACAGG
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   CATAGAAGACATGGCTCTGGTGTTCCAGATTGAACCTTGCCTTCATGGTCCCCGAACAGG
              550       560       570       580       590       600  

               1290      1300      1310      1320      1330      1340
base     CACACTGGAAGTGCTGAGATCTTGTCGCACGAAGGTCTTCATTTATACGTCGTACCGCAG
         |||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   CACACTGGAAGTGCTGAGACCTTGTCGCACGAAGGTCTTCATTTATACGTCGTACCGCAG
              610       620       630       640       650       660  

               1350      1360      1370      1380      1390      1400
base     GTTGCGCCACTTTGTTGAGAACCAGTGCATTGCTCAACCTGGCGACGCCGTCCTTGCTTG
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   GTTGCGCCACTTTGTTGAGAACCAGTGCATTGCTCAACCTGGCGACGCCGTCCTTGCTTG
              670       680       690       700       710       720  

               1410      1420      1430      1440      1450      1460
base     CATGATCCCGCCCTACGTGAGTGACCTCTCACTGCAGGAAATGTCTCGAGCCCACAATAG
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   CATGATCCCGCCCTACGTGAGTGACCTCTCACTGCAGGAAATGTCTCGAGCCCACAATAG
              730       740       750       760       770       780  

               1470      1480      1490      1500      1510      1520
base     TTTTTGTCCAGGCAGTCACACGAGCATTGCAGACGTGCAGTGCTTTATTGCCATCCAACT
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   TTTTTGTCCAGGCAGTCACACGAGCATTGCAGACGTGCAGTGCTTTATTGCCATCCAACT
              790       800       810       820       830       840  

               1530      1540      1550      1560      1570      1580
base     CAGCAGCCTATTTGTTGAGGAGGGTACATGTGATGTGCATGGGCGAAATGGATTAAAAAC
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   CAGCAGCCTATTTGTTGAGGAGGGTACATGTGATGTGCATGGGCGAAATGGATTAAAAAC
              850       860       870       880       890       900  

               1590      1600      1610      1620      1630      1640
base     AACCTGCCGCTTCTTTCGTCGTCCCGCTGAGTGCTTCAGCCGTTACGACATAGTTGCAAT
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   AACCTGCCGCTTCTTTCGTCGTCCCGCTGAGTGCTTCAGCCGTTACGACATAGTTGCAAT
              910       920       930       940       950       960  

               1650      1660      1670      1680      1690      1700
base     AGGGTCTGTGCTCTTTCACAACGCATTGCATCAGCCAGCGAACTACAATGAGGATCTTTC
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||
second   AGGGTCTGTGCTCTTTCACAACGCATTGCATCAGCCAGTGAACTACAATGAGGATCTTTC
              970       980       990      1000      1010      1020  

               1710      1720      1730      1740      1750      1760
base     TTGCTTCGATCTGCGGTACGACTATCAGGTTTTCCTCCATGAGCGCGATGCCAATGATGG
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   TTGCTTCGATCTGCGGTACGACTATCAGGTTTTCCTCCATGAGCGCGATGCCAATGATGG
             1030      1040      1050      1060      1070      1080  

               1770      1780      1790      1800      1810      1820
base     TGTGGGGCATTATCCGGAAGGCACACCACTACCTAGTGTCGCCATCGTAGGTGGTGGGCT
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   TGTGGGGCATTATCCGGAAGGCACACCACTACCTAGTGTCGCCATCGTAGGTGGTGGGCT
             1090      1100      1110      1120      1130      1140  

               1830      1840      1850      1860      1870      1880
base     CTCTGGCCTTGTTGCTGCTGCAGAACTACTTGACGCTGGCGTCAGGGAAATAGCCCTTTT
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   CTCTGGCCTTGTTGCTGCTGCAGAACTACTTGACGCTGGCGTCAGGGAAATAGCCCTTTT
             1150      1160      1170      1180      1190      1200  

               1890      1900      1910      1920      1930      1940
base     TACCCCAGTAGATGAGGTTCGGAGTTTGGGTGTATCGCCGATGTCAAACGGCGACGCTCG
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||
second   TACCCCAGTAGATGAGGTTCGGAGTTTGGGTGTATCGCCGATGCCAAACGGCGACGCTCG
             1210      1220      1230      1240      1250      1260  

               1950      1960      1970      1980      1990      2000
base     CCAGGTCTTGACGTCATTCGGTGTCATGCCCATCTCCGGCAACCAAGTTTGTCTGTCATA
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   CCAGGTCTTGACGTCATTCGGTGTCATGCCCATCTCCGGCAACCAAGTTTGTCTGTCATA
             1270      1280      1290      1300      1310      1320  

               2010      2020      2030      2040      2050      2060
base     CTATCTGGATAAGTTTAGAATTCCGTCCAGCCTTCGTTTTCCTTGTGCCGGCAACGATCA
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||
second   CTATCTGGATAAGTTTAGAATTCCGTCCAGCCTTCGTTTTCCTTGTGCCGGCAGCGATCA
             1330      1340      1350      1360      1370      1380  

               2070      2080      2090      2100      2110      2120
base     CACAGCACTCTACTTCCGGAAAAAACGTTACGAATGGCCGGCTGGACAAGCTCCACCAGG
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   CACAGCACTCTACTTCCGGAAAAAACGTTACGAATGGCCGGCTGGACAAGCTCCACCAGG
             1390      1400      1410      1420      1430      1440  

               2130      2140      2150      2160      2170      2180
base     TGAATTCCAGCGGATATCTGCAGGGTGGGAGAAACTACTATACCACGGGTGTGAACGGAA
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   TGAATTCCAGCGGATATCTGCAGGGTGGGAGAAACTACTATACCACGGGTGTGAACGGAA
             1450      1460      1470      1480      1490      1500  

               2190      2200      2210      2220      2230      2240
base     CGGCAGGAGGCTGATCGCTCCGATGGATATCTTTTCCATGCTGAGAGGTCGGCGTTATGA
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   CGGCAGGAGGCTGATCGCTCCGATGGATATCTTTTCCATGCTGAGAGGTCGGCGTTATGA
             1510      1520      1530      1540      1550      1560  

               2250      2260      2270      2280      2290      2300
base     AGAAGCCTCGGAAGCAAGGCGGGCTTGGCTCAGGGAGTTTGATAATTTCACTTTCCATGC
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   AGAAGCCTCGGAAGCAAGGCGGGCTTGGCTCAGGGAGTTTGATAATTTCACTTTCCATGC
             1570      1580      1590      1600      1610      1620  

               2310      2320      2330      2340      2350      2360
base     CGCTCTGGTCGAGATCTTCAGCTGCGGTGTCGAGAGTCCTGGTGGGGCGGCATGGCAAAC
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   CGCTCTGGTCGAGATCTTCAGCTGCGGTGTCGAGAGTCCTGGTGGGGCGGCATGGCAAAC
             1630      1640      1650      1660      1670      1680  

               2370      2380      2390      2400      2410      2420
base     AACTGATTTTGCTGCTTTCGGGATGATGAGATTGGGCGGCGGCCGAGTTTCTTCCTGTTA
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   AACTGATTTTGCTGCTTTCGGGATGATGAGATTGGGCGGCGGCCGAGTTTCTTCCTGTTA
             1690      1700      1710      1720      1730      1740  

               2430      2440      2450      2460      2470      2480
base     CACCCTACTGTTTTCGACAGTCCTGGACTGGATAATCAATGGGTACGAGGAGGACCAGTA
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|
second   CACCCTACTGTTTTCGACAGTCCTGGACTGGATAATCAATGGGTACGAGGAGGACCAGCA
             1750      1760      1770      1780      1790      1800  

               2490      2500      2510      2520      2530      2540
base     TATCTCTGTTGGAGGGGTTCATCTTTTGCAGGCTCTGATGCGCATTGAGATATTCAAGAG
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   TATCTCTGTTGGAGGGGTTCATCTTTTGCAGGCTCTGATGCGCATTGAGATATTCAAGAG
             1810      1820      1830      1840      1850      1860  

               2550      2560      2570      2580      2590      2600
base     AAAAGTAGGATTCCATTTTGACCCCCTGCGTGGACTAGCCAAGGAGGGCGGGAAAGTGAA
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   AAAAGTAGGATTCCATTTTGACCCCCTGCGTGGACTAGCCAAGGAGGGCGGGAAAGTGAA
             1870      1880      1890      1900      1910      1920  

               2610      2620      2630      2640      2650      2660
base     GGTATGCATGAAAGATGGCCGTTCGCGCGTTTTTGACCAGGTCATCATTGGCGGGCGAGG
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   GGTATGCATGAAAGATGGCCGTTCGCGCGTTTTTGACCAGGTCATCATTGGCGGGCGAGG
             1930      1940      1950      1960      1970      1980  

               2670      2680      2690      2700      2710      2720
base     TGGGCCCGATGCAACTAATATCACTCCGGTTAGCCATGTGACCTGTGTCGGCTATGATAT
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   TGGGCCCGATGCAACTAATATCACTCCGGTTAGCCATGTGACCTGTGTCGGCTATGATAT
             1990      2000      2010      2020      2030      2040  

               2730      2740      2750      2760      2770      2780
base     CGAAGCCCCCGCTGGAAACTCGTCTGCTACTGTTAACGCAGCACTTTTCATGATCACAAA
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   CGAAGCCCCCGCTGGAAACTCGTCTGCTACTGTTAACGCAGCACTTTTCATGATCACAAA
             2050      2060      2070      2080      2090      2100  

               2790      2800      2810      2820      2830      2840
base     GCAAAAATTCTGGCTTGATGACGATATCCCAGCTTTGATCTGGACGGATGGGCTCGTCCG
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   GCAAAAATTCTGGCTTGATGACGATATCCCAGCTTTGATCTGGACGGATGGGCTCGTCCG
             2110      2120      2130      2140      2150      2160  

               2850      2860      2870      2880      2890      2900
base     TGAGCTCTGTTGTATTGACATCGAATCGCCATCGGGAGAGGGGCTTGTTATTTTTCATTA
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   TGAGCTCTGTTGTATTGACATCGAATCGCCATCGGGAGAGGGGCTTGTTATTTTTCATTA
             2170      2180      2190      2200      2210      2220  

               2910      2920      2930      2940      2950      2960
base     TGAAATGAACGACTATCTATCCCGCCCGTTCCAGTCCGATGAGAAGAAGAGAAGGTGCTT
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   TGAAATGAACGACTATCTATCCCGCCCGTTCCAGTCCGATGAGAAGAAGAGAAGGTGCTT
             2230      2240      2250      2260      2270      2280  

               2970      2980      2990      3000      3010      3020
base     GGATTTAGTCAGAGAACTTGCTGCTGTCTTTCCTGAATTGGCTTGTCATTTGGTTCCAGT
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   GGATTTAGTCAGAGAACTTGCTGCTGTCTTTCCTGAATTGGCTTGTCATTTGGTTCCAGT
             2290      2300      2310      2320      2330      2340  

               3030      3040      3050      3060      3070      3080
base     CAACGAAGATTACGAAGAATATGTCTTCGACGGCCACTTGAAGGATGGTTTCAGGGCCTC
         ||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   CAACGAAGATTATGAAGAATATGTCTTCGACGGCCACTTGAAGGATGGTTTCAGGGCCTC
             2350      2360      2370      2380      2390      2400  

               3090      3100      3110      3120      3130      3140
base     TTTATGGAGGGAAAATTCTCTTAAAAAATGTCAGTACAGCCAAGATCCGCATATGTATGA
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   TTTATGGAGGGAAAATTCTCTTAAAAAATGTCAGTACAGCCAAGATCCGCATATGTATGA
             2410      2420      2430      2440      2450      2460  

               3150      3160      3170      3180      3190      3200
base     TTCTCCGTTAATGGAGCATGGGGCAGTTTGCCAGATTGACAGTAAGGACTGCGTAAACGG
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   TTCTCCGTTAATGGAGCATGGGGCAGTTTGCCAGATTGACAGTAAGGACTGCGTAAACGG
             2470      2480      2490      2500      2510      2520  

               3210      3220      3230      3240      3250      3260
base     AGCTTTGTTCGAAGAGCAGGTTAAGACGGGCATCATAACGGCCTGCACCGTCATTCGCAG
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   AGCTTTGTTCGAAGAGCAGGTTAAGACGGGCATCATAACGGCCTGCACCGTCATTCGCAG
             2530      2540      2550      2560      2570      2580  

               3270      3280      3290      3300      3310      3320
base     CACCGGCGGGACACTATCTTCACTCCATCCCCTGGATTGGAATAAAATATATTTTCCTGC
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   CACCGGCGGGACACTATCTTCACTCCATCCCCTGGATTGGAATAAAATATATTTTCCTGC
             2590      2600      2610      2620      2630      2640  

               3330      3340      3350      3360      3370      3380
base     TTAAGTATATTAATGTATTAGTGCGTATTAATCCCGTAAGCCTGTAAGCTGCAGTAGCGG
         ||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   TTGAGTATATTAATGTATTAGTGCGTATTAATCCCGTAAGCCTGTAAGCTGCAGTAGCGG
             2650      2660      2670      2680      2690      2700  

               3390      3400      3410      3420      3430      3440
base     CGCTCAACTTAGCTTTCCATGAATAATAATGTTTTTCCTTTATTTTTGATTGAATCCTGC
         ||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   CGCTCAACTTAGTTTTCCATGAATAATAATGTTTTTCCTTTATTTTTGATTGAATCCTGC
             2710      2720      2730      2740      2750      2760  

               3450      3460      3470      3480      3490      3500
base     TTAAAAAATATTCTTTGAGTGGGCTTAAAATGACATTAATCAGATTCCAAAAATTTCCAT
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   TTAAAAAATATTCTTTGAGTGGGCTTAAAATGACATTAATCAGATTCCAAAAATTTCCAT
             2770      2780      2790      2800      2810      2820  

               3510      3520      3530      3540      3550          
base     CTGTGACCATTAGCGCCTTGATCGATGACATTAAAGTCTTCACATCTCCAGAGAAA-GCC
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| :||
second   CTGTGACCATTAGCGCCTTGATCGATGACATTAAAGTCTTCACATCTCCAGAGAAATACC
             2830      2840      2850      2860      2870      2880  

      3560      3570      3580      3590      3600      3610         
base     TTCGTGATTGCTTGTCTCCACGTGCTTTCGCATCTTGACAGCTAATAGCGGGCCCCTTGA
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   TTCGTGATTGCTTGTCTCCACGTGCTTTCGCATCTTGACAGCTAATAGCGGGCCCCTTGA
             2890      2900      2910      2920      2930      2940  

      3620      3630      3640      3650      3660      3670         
base     CACACTAGCCGGCCACGCAATTCGAGATATTCCCACTAACCCCAATGAGGTCACTGCATT
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   CACACTAGCCGGCCACGCAATTCGAGATATTCCCACTAACCCCAATGAGGTCACTGCATT
             2950      2960      2970      2980      2990      3000  

      3680      3690      3700      3710      3720      3730         
base     CGTCATTGGCAGCCGCCCCACTTGCATTCGCCACTGTGCCGTTTGGGGTCCACTAGCCGC
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   CGTCATTGGCAGCCGCCCCACTTGCATTCGCCACTGTGCCGTTTGGGGTCCACTAGCCGC
             3010      3020      3030      3040      3050      3060  

      3740      3750      3760      3770      3780      3790         
base     TAATTAGGACTGCATATATTTTGGACGAGCTAAGGGGTCACTATCACCTTCGGTTTGAAT
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   TAATTAGGACTGCATATATTTTGGACGAGCTAAGGGGTCACTATCACCTTCGGTTTGAAT
             3070      3080      3090      3100      3110      3120  

      3800      3810      3820      3830      3840      3850         
base     TTCCTTTTCACAAGACTTTAATGTTGCCAATTGAGCAGGCTGAAAGAAAATCCGCAATCA
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   TTCCTTTTCACAAGACTTTAATGTTGCCAATTGAGCAGGCTGAAAGAAAATCCGCAATCA
             3130      3140      3150      3160      3170      3180  

      3860      3870      3880      3890      3900      3910         
base     ACGGAGAAAGGTTAACAGCCAAACAAAAAAAGAATGCTTCATCATTGCATAGGGTCTACA
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   ACGGAGAAAGGTTAACAGCCAAACAAAAAAAGAATGCTTCATCATTGCATAGGGTCTACA
             3190      3200      3210      3220      3230      3240  

      3920      3930      3940      3950      3960      3970         
base     ACGACCATTACTTTCGGCGGTGGGCCTTCTACTATTTTTTTCTTAGTCTTCGGCCAGCCA
         |||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||
second   ACGACCATTACTTTCGGCGGTGGGCCTGCTACTATTTTTTTCTTAGTCTTCGGCCAGCCA
             3250      3260      3270      3280      3290      3300  

      3980      3990      4000      4010      4020      4030         
base     TTTGTTAACTTCCTATATAGATCGCTTCACCAGAAGAATGAATTATTTAGATCATGCTGT
         |||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   TTTGTTAACGTCCTATATAGATCGCTTCACCAGAAGAATGAATTATTTAGATCATGCTGT
             3310      3320      3330      3340      3350      3360  

      4040      4050      4060      4070      4080      4090         
base     AATGCTTCAATGCTGTAAGTTCTAAATGTTTGTTTCGTTTTGCAAGAAATCTATTTTGCT
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second   AATGCTTCAATGCTGTAAGTTCTAAATGTTTGTTTCGTTTTGCAAGAAATCTATTTTGCT
             3370      3380      3390      3400      3410      3420  

      4100      4110      4120                                       
base     AACAGCACTTCTTTTATTCTCAG
         |||||||||||||||||||||||
second   AACAGCACTTCTTTTATTCTCAG
             3430      3440