ALIGNMENT 1/1
SCORE: 158004
STRAND: +
base: 3-1754 (1752 bps)
second: 3-1755 (1753 bps)
CONSERVATION (:base: stats)
Matches = 97.60% (1710/1752)
Mismatches = 2.34% (41/1752)
Gapped nucleotides = 0.06% (1/1752)
base: 3-1754 (1752 bps)
second: 3-1755 (1753 bps)
10 20 30 40 50 60
base GCAGTAGCTGTTCTGACGGTGCCCAGAGGCTGGAGGTGGTACCTGTTTCACGCTAGAAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second GCAGTAGCTGTTCTGACGGTGCCCAGAGGCTGGAGGTGGTACCTGTTTCACGCTAGAAAT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
base ATAAATGTAATAAAC-TCATGGATCTGGTTGATGTAACCTGCGCCATGGATGCACTTGTT
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||
second ATAAATGTAATAAACATCATGGATCTGGTTGATGTAACCTGCGCCATTGATGCACTTGTT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
base CTTTTTTGGTTCCGATGGATGGGTTGTTTGCTTGAAATGAAACCTGCCTGTTCGAAATTT
|||||||: ||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||
second CTTTTTTC-TTCCGATGAATGGGTTGTTTGCTTGAAATGAAACCTGCCTGTTCGAGATTT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
base GGTTATCACTTTTTCCATTTATGTTTTTAATTATTTGTGTATTAAAGAAAATAGTTCACA
||||||:||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second GGTTATTACCTTTTCCATTTATGTTTTTAATTATTTGTGTATTAAAGAAAATAGTTCACA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
base TAGCCGCAATATATGACCGAAGCTGGCCCGCAATGCCGCAATAGATGATTAATTTGTCAA
|||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||
second TAGCCGCAATATATGACCGAAGCTGGCCCACAATGCCGCAATAGATGATTAATTTGTCAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
base ACTTAGCTATCAATATCTCGATAGAAGTGCCCACATGTTTAAACTAGGCAAACTCGTTCT
||||||||||||||||||||||||:||||||:||||||||||||:|||||||||||||||
second ACTTAGCTATCAATATCTCGATAGGAGTGCCGACATGTTTAAACCAGGCAAACTCGTTCT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
base CCTTGAAAACTGATAATAAAGACAAGAAAATTAGCCCACTCTAAAAAGTCACATAGCAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second CCTTGAAAACTGATAATAAAGACAAGAAAATTAGCCCACTCTAAAAAGTCACATAGCAAA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
base TTCAACATAAAGAAACCAGAAGTCAGAGGAAAGACTTTTAATCCTTGATTATTTGAACGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|
second TTCAACATAAAGAAACCAGAAGTCAGAGGAAAGACTTTTAATCCTTGATTATTTGAACAA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
base AATAGCCGCAATACGCCAAAGTGTCGCCTTCATGATTGTTCAATAATTTCTGTAGCAAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second AATAGCCGCAATACGCCAAAGTGTCGCCTTCATGATTGTTCAATAATTTCTGTAGCAAAT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
base GGAAAACGTTTTACAAACAATGTGGCCTTGGAGTAATAATCGGAAGAAAAGTTCATAAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second GGAAAACGTTTTACAAACAATGTGGCCTTGGAGTAATAATCGGAAGAAAAGTTCATAAGT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
base CAGATAATTTGCGTTGCTGACACTAGTGACCAAGCACCTTTAAATACCTCTGCTTCCCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second CAGATAATTTGCGTTGCTGACACTAGTGACCAAGCACCTTTAAATACCTCTGCTTCCCAT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
base GCATTTTTCCAAGTTAACCTAAAGTGGCAGTTGAATGGCTCGTTATTTCGGTGGTAGCTC
|||||||:|||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||::|||||||
second GCATTTTGCCAAGTTAACCTAAACTGGCAGTTGAATGGCTCGTTATTTCGGCAGTAGCTC
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
base TCAACGGCTTCATGTCGATGATTTTCGTTTGATCAAGGAGCCCACTCGACTGAAGGCTCA
||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||
second TCAACGGCTTCATGTCGATGATTTTCGTTTTATCAAGGAGCCCACTCGACTGAAGGCTCA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
base GCTTGTTAATGTGGTGGAAACCTACAAGGCTGCACAAACAGAGACGTTAAAGTACTATAT
||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||
second GCTTGTTAATGTGGTGGAAACCTACAAGGCTGTACAAACAGAGACGTTAAAGTACTATAT
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
base ACCATCTGCAACTGAGCGTGTGGCTCATATGGAGGCAGTCCATGTCAACAATGCAGAAAT
|:||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||:|||||||||||||
second ATCATCTGCAACTGAGCGTGTGGCTCATGTGGAGGCAGTCCATGTCGACAATGCAGAAAT
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
base GGGGCTGCATCCGGCCGGGTTCAAGTATCCTCTGTCCTTCGTCTTTACCTCCCTGGCCGT
|||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second GGGGCTGCATCCGGCCGGGTTTAAGTATCCTCTGTCCTTCGTCTTTACCTCCCTGGCCGT
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
base GGCTAAAGCCTGCAAGGAGAACAAGCATCTCGTGTGCGAGGAGCATTTGGAGGGAGATCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second GGCTAAAGCCTGCAAGGAGAACAAGCATCTCGTGTGCGAGGAGCATTTGGAGGGAGATCT
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
base GATATCGTGCGTCGTTCCTCCCTATCAGACAAATGTCTCACTCGCTGCTTTAAGGGAGAT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||
second GATATCGTGCGTCGTTCCTCCCTATCAGACAAATGTCTCTCTCGCTGCTTTAAGGGAGAT
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
base CCACAATTCCATTTCGGGAGGAGGGTACCGGAATCCAACAGACATGGATTATTTTGTGGC
||||||||||:||||||||||||||||||:|:||||||||||||||||||||||||||||
second CCACAATTCCGTTTCGGGAGGAGGGTACCTGGATCCAACAGACATGGATTATTTTGTGGC
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
base GATCTTGCCAGATGAAAATTTCGACTATCAGAGCTGTGAAATTGTCACCAAAAATGGCGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||
second GATCTTGCCAGATGAAAATTTCGACTATCAGAGCTGCGAAATTGTCACCAAAAATGGCGG
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
base CGAAGGCCTTTGCAAGATTTATAGCAGACAACTGGAGGGGCCCTTAGCTTATGAGGCCAT
||||||:|||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||:|||||
second CGAAGGACTTTGCAAGATTTATAGCAGACAACTGGATGGGCCCTTAGCTTATGAAGCCAT
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
base ACTGGCAATTGGCAAGGTCCTGTTGGAATA-GGCAGTGCACCGCTGATCCAACGGGAGTT
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||:||||||||||:|||
second ACTGGCAATTGGCAAGGTCCTGTTGGAATAGGGCAGTGCACCGCTTATCCAACGGGGGTT
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
base TCGATTATATTTCGTATTATCTTACATGACTTAAGATCATGCATGTTTCGCTTGTTCTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second TCGATTATATTTCGTATTATCTTACATGACTTAAGATCATGCATGTTTCGCTTGTTCTCC
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
base CGTGTGTCGGTTACGTTATTGTGTTAAAATAACGGGATGATGATATCAAGTGCTATTGTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||
second CGTGTGTCGGTTACGTTATTGTGTTAAAATAACGGGATGATGCTATCAAGTGCTATTGTA
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
base AAATATGTTATATTTTGAATATCTATAATATAAGCGCTGTGTGCGCTCGATGGGTAGTTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||
second AAATATGTTATATTTTGAATATCTATAATATAAGCGCTGTGTGCGCTCGATGGGCAGTTA
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
base AATGATCATGATATATATTTTTGGGTAATCAATCGCATTGCAGTGCCGTGTGCTTATTGA
:||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||:|||||:||||||||||||||
second CATGATCATGATATATATTATTGGGTAATCAATCGCATTACAGTGGCGTGTGCTTATTGA
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
base AGTAATATAGTGTTAAAATTATTTATTTAATATCTGATAACATATCAAAGGGTACAACGT
|:|||:|||:||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second AATAACATAATGATAAAATTATTTATTTAATATCTGATAACATATCAAAGGGTACAACGT
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
base GATAACAAAGACGGTGGATACAGCGTTTATTGGGATATCCGCTGGCCAGTTATACGTAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second GATAACAAAGACGGTGGATACAGCGTTTATTGGGATATCCGCTGGCCAGTTATACGTAAA
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
base TAATACAGACAGAGTTTGAGAGAGCACGCAGATTGTAGCCAAGTTGAGTGACTTGCCGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
second TAATACAGACAGAGTTTGAGAGAGCACGCAGATTGTAGCCAAGTTGAGTGACTTGCCGGT
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750
base AGCACCGAAGCTAA
||||||||||||||
second AGCACCGAAGCTAA
1750
######################################################################