ANÁLISIS PARA FUGU RUBRIPES

Para Fugu rubripes, podemos observar algunas diferencias con respecto las otras especies. Los aminoácidos con más casos de repeticiones siguen siendo E,P y S, pero en este caso destaca la abundancia de casos de S (2038), muy por encima de los otros dos (que no llegan a 1500). Cabe destacar que en números absolutos de repeticiones, los valores son los más altos de los 4 genomas. Por último, tan sólo decir que el único aminoácido sin casos es W.
En este gráfico de porcentajes, destaca que la serina representa más de 1 de cada 5 casos de repeticiones (22%), aunque el grupo de E,P y S sigue oscilando alrededor del 50% de casos.
En este gráfico, siguiendo la clasificación de Lehninger de los aminoácidos, podemos observar que el porcentaje de los hidrófilos asciende al 56% (en las otras especies ronda el 50%). En cambio,la presencia de los básicos es del 6%, bastante inferior a la del 10% de otras especies. Esto se debe sobretodo a la caída de presencia de repeticiones de R con respecto a las otras especies.
Fugu rubripes destaca por ser la especie con más casos de repeticiones de más de 15 aminoácidos seguidos, 206. Esto es casi el doble que el resultado para Homo sapiens (125) o casi cuatro veces más que para Tetraodon nigroviridis (58). Además de esta gran cantidad de repeticiones largas, destaca el hecho de que el aminoácido con más casos es C (27%), cuando en las otras especies C era anecdótico en cuanto a repeticiones largas. Q representa el 13% de los casos y S el 27%. Además de todo ello, hay casos de repeticiones largas realmente impresionantes: hay 7 casos con más de 90 aminoácidos repetidos, y el caso máximo alcanza la cifra de ¡175 aminoácidos! (S).
Esta gráfica vuelve a ser espectacular. Vemos que la media de la longitud de repeticiones es de 6,86 repeticiones por caso, el valor más alto de los 4 casos (un 20% más largo que Gallus gallus,teniendo en cuenta que el mínimo teórico posible sería ya de 5 unidades). Además, este valor es casi mantenido en exclusiva por el aminoácido C, con una media de ¡11 unidades por caso! Hay que considerar que los casos de C son 274 (S eran más de 2000), y que, pese a ello, si no se tienen en cuenta, la media general bajaría de 6,8 a 6,4.

En este apartado mostramos los resultados de una prueba de T de Student para medias independientes en la que se ha analizado si existe un contenido diferencial de GC y diferente media de longitud de proteína en 2 muestras de Fugu rubripes : proteínas con repeticiones y proteínas sin repeticiones. En ambos casos los estadísticos son de 0.000. Esto significa que en ambos casos, efectivamente, la diferente media que encontramos es estadísticamente significativa y, por tanto, podemos concluir que las proteínas con repeticiones tienen un contenido en GC más alto y una longitud media de proteína más grande.

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