En este apartado colocamos algunos gráficos que muestran resultados que consideramos útiles para nuestro análisis. Algunos de ellos surgen de la profundización en los datos para Homo sapiens, con conclusiones útiles para los otros genomas.
| En todos los genomas hemos realizado un análisis de la frecuencia de repeticiones por tipo de aminoácido según la clasificación de Lehninger. En esta gráfica mostramos (para el caso de Homo sapiens), la comparación entre esa frecuencia en proteínas repetidas con respecto a todo el genoma humano. Podemos claramente observar que existe una gran disminución de los aminoácidos básicos como hidrófobos en aquellas proteínas con repeticiones (siempre mayor al 25%). En cambio, podemos ver como los aminoácidos ácidos e hidrófilos están sobrerrepresentados con respecto al genoma humano entero, con o sin repeticiones (¡para el caso de los ácidos es del 60%!). | |
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| En este gráfica de columnas se puede observar la desviación de la media de longitud de cada aminoácido del genoma de Homo sapiens para con la media de los 20 aminoácidos. Se puede observar que sólo dos aminoácidos son los que se "encargan" de mantener la media alta, es decir, H y Q (el caso de M es diferente, ya que tan sólo se trata de 2 repeticiones). Sobresale el caso de Q, con unas repeticiones más de un 25% de largas de media que el resto. | |
| En este caso, la gráfica muestra lo del caso anterior pero agrupando los aminoácidos según su frecuencia. Se puede observar que existen diferencias significativas. El grupo de los menos frecuentes tiene una media más corta: en Homo sapiens los aminoácidos con pocas repeticiones suelen ser, además, casos de repeticiones cortas. | |
| En esta gráfica se muestra el logaritmo de la frecuencia de casos de cada longitud (de 5,6,7...) de Homo sapiens para cada longitud. Así se puede observar que existe un pronunciado descenso en el número de casos según se aumenta su longitud, hasta llegar a la zona de los casos de 15 a 25 aminoácidos repetidos. Después, vuelven a descender los casos de más de 25 aminoácidos, con esporádicas apariciones de casos más concretos. Especulamos que los casos de más de 15 aminoácidos repetidos pueden tener sentido biológico y, por ello se permiten, y existe una sobrerepresentación de esos casos (el logaritmo deja de descender en picado). | |
| Esta gráfica muestra para los 4 genomas el número de repeticiones de más de 30 repeticiones, extralargas de verdad. El dato es espectacular: casi el 80% de estas repeticiones están protagonizadas por Fugu rubripes (veáse análisis Fugu rubripes). Tetraodon nigroviridis y Gallus gallus tienen casos testimoniales de repeticiones extralargas. | |
