...a ells no els fa falta Let's seXXXqs!!!... però al teu parell de seqüències sí!!!
Fes servir el programa a través del següent SERVIDOR:
*(Recorda posar les seqüències en format FASTA, i el símbol negatiu (-), si vols penalitzar negativament els salts)
Tria l'arxiu amb la PRIMERA seqüència:
Tria l'arxiu amb la SEGONA seqüència:
-Selecciona la MATRIU de substitució: BLOSUM30 BLOSUM45 BLOSUM62 BLOSUM80 PAM40 PAM80 PAM120 PAM250 similitudsDNA DNAPAM20 DNAPAM50 DNAPAM85 DNAPAM110 DNAPAM20TransitionTransversion DNAPAM50TransitionTransversion DNAPAM85TransitionTransversion
*(La matriu "similitudsDNA" l'he fet jo, és una mica senzilleta... però funciona. Les puntuacions són: Match=1, Mismatch=0)
-Selecciona les PENALITZACIONS de salt:
Gap Opening Gap Extension
Gap Extension