gi|4585191|gb|AAD25321.1|   transcription activator ORF50 [Human herpesvirus 8]
          Length = 691

 Score =  719 bits (1856), Expect = 0.0
 Identities = 421/522 (80%), Positives = 421/522 (80%)

Query: 1   MILTSSLLKLYNTYDTAGLLSEQSRALCLLVFQPVYLPRIMAPLEIMTKGQLAPENFYSI 60
           MILTSSLLKLYNTYDTAGLLSEQSRALCLLVFQPVYLPRIMAPLEIMTKGQLAPENFYSI
Sbjct: 170 MILTSSLLKLYNTYDTAGLLSEQSRALCLLVFQPVYLPRIMAPLEIMTKGQLAPENFYSI 229

Query: 61  TGSAEKRRPITTGKVTGLSYPGSGXXXXXXXXXXXXXXXXXASMVDLSDVLAKPAVILSA 120
           TGSAEKRRPITTGKVTGLSYPGSG                 ASMVDLSDVLAKPAVILSA
Sbjct: 230 TGSAEKRRPITTGKVTGLSYPGSGLMPESLILPILEPGLLPASMVDLSDVLAKPAVILSA 289

Query: 121 PALSQFVISKPHPNMPHTVSIIPFNPSGTDPAFISTWQAASQNMVYNTSTAPLKPATGSS 180
           PALSQFVISKPHPNMPHTVSIIPFNPSGTDPAFISTWQAASQNMVYNTSTAPLKPATGSS
Sbjct: 290 PALSQFVISKPHPNMPHTVSIIPFNPSGTDPAFISTWQAASQNMVYNTSTAPLKPATGSS 349

Query: 181 QTVSVKAVAQGAVITATTVPQAMPARGTGGELPVMSASTPARDQVAACFVAENTGDSPDN 240
           QTVSVKAVAQGAVITATTVPQAMPARGTGGELPVMSASTPARDQVAACFVAENTGDSPDN
Sbjct: 350 QTVSVKAVAQGAVITATTVPQAMPARGTGGELPVMSASTPARDQVAACFVAENTGDSPDN 409

Query: 241 PSSFLTSCHPCDPNTVIVAQQFQPPQCVTLLQVTCAPSSTPPPDSTVRAXXXXXXXXXXX 300
           PSSFLTSCHPCDPNTVIVAQQFQPPQCVTLLQVTCAPSSTPPPDSTVRA           
Sbjct: 410 PSSFLTSCHPCDPNTVIVAQQFQPPQCVTLLQVTCAPSSTPPPDSTVRAPVVQLPTVVPL 469

Query: 301 XXXXXXXXXXXXEASGEELPGGHDGDQGVPCRDSXXXXXXXXXXXPXXXXXXXXXXXXXX 360
                       EASGEELPGGHDGDQGVPCRDS           P              
Sbjct: 470 PASAFLPALAQPEASGEELPGGHDGDQGVPCRDSTAAATAAEATTPKRKQRSKERSSKKR 529

Query: 361 XALTVPEADXXXXXXXXXXXXXXXXXXQDVHATDVATSEGPSEAXXXXXXXXXXXXXXXX 420
            ALTVPEAD                  QDVHATDVATSEGPSEA                
Sbjct: 530 KALTVPEADTTPSTTTPGTSLGSITTPQDVHATDVATSEGPSEAQPPLLSLPPPLDVDQS 589

Query: 421 XFALLDEAGPETWDVGSPLSPTDDALLSSILQGLYQLDTPPPLRSPSPASFGPESPADIP 480
            FALLDEAGPETWDVGSPLSPTDDALLSSILQGLYQLDTPPPLRSPSPASFGPESPADIP
Sbjct: 590 LFALLDEAGPETWDVGSPLSPTDDALLSSILQGLYQLDTPPPLRSPSPASFGPESPADIP 649

Query: 481 SPSGGEYTQLQPVRATSATPANEVQESGTLYQLHQWRNYFRD 522
           SPSGGEYTQLQPVRATSATPANEVQESGTLYQLHQWRNYFRD
Sbjct: 650 SPSGGEYTQLQPVRATSATPANEVQESGTLYQLHQWRNYFRD 691




(*)Las X que se muestran en nuestra secuencia (Query) son introducidas por el BLASTP
como filtro para eliminar aminoacidos repetidos de un cierto tipo.
Es por ello que la identidad que muestra es de un 80%, pero si no hubiera eliminado
estas partes hubiera sido de un 100%, ya que hemos comprobado que los trozos de secuencia
que elimina son identicos.
Por tanto podemos afirmar que el ORF predicho esta ya identificado y se trata del
ORF 50 de HHV-8.
La secuencia que se alinea con la nuestra no lo hace desde el aminoacido 1 (sino desde el 170)
porque este ORF codifica para una proteina que normalmente hace splicing.