La base de dades NCBI per descarregar la seqüència en format fasta.
El programa BLAST amb el què s'han obtingut les proteïnes amb major identitat a la proteïna predita.
El programa Blastn (MEGABLAST) utilitzat per la cerca d'ESTs que donessin suport a les prediccions. La sortida ha estat filtrada per tal de seleccionar aquells ESTs que es solapaven per tal que es pogués formar una seqüència complerta de cDNA. A més a més els ESTs que no estaven dividits en dos o més fragments (aquells que continguin com un parell de llocs splicing ) han estat eliminats.
El programa RepeatMasker per tal de poder enmascarar la seqüència en format fasta, i així impedir la interferència dels elements repetitius en la predicció de gens.
La base de dades EMBL.
El programa Transfac per tal de poder predir quines eren les possibles regions promotores.
El programa GENSCAN per tal de dur a terme la predicció de gens.
El progama Softberry per dur a terme al predicció de gens.
El progrma Grail per dur a terme la predicció de gens.
| http://www.ncbi.nlm.nih.gov |  |
| www.ncbi.nih.gov/BLAST |  |
| www.ncbi.nih.gov/BLAST |  |
| http://woody.embl-heidelberg.de/repeatmask/ | |
| www.ebi.ac.uk/embl/ |  |
| http://www.gene-regulation.com/ |  |
| http://genes.mit.edu/GENSCAN.html | |
| http://www.softberry.com/>Softberry |  |
| http://grail.lsd.ornl.gov/grailexp/ | |
| genome.imim.es/geneid.html |  geneid Web Server 2002 |